Los expertos de EUCAST dicen que los métodos de las pruebas genéticas no se pueden utilizar para determinar susceptibilidad antimicrobiana

Los expertos en el comité europeo sobre la prueba antimicrobiana de la susceptibilidad (EUCAST), que define las concentraciones óptimas de la droga para inhibir el incremento de patógeno, han encontrado que los métodos genéticos no se pueden todavía utilizar para probar para la susceptibilidad en varia especie bacteriana importante. Aunque tengan sido avances en el genoma entero que ordena (WGS), que permite determinar la serie de la DNA del genoma de un organismo en un único rato, todavía hay varios obstáculos a vencer antes de que este tipo de pruebas genéticas se pueda utilizar en laboratorios clínicos, él concluyó.

Un subcomité de EUCAST dedicado a revisar el papel del WGS en la prueba antimicrobiana de la susceptibilidad (AST) consideraba las pruebas publicadas más recientes en el uso del genoma entero que ordenaba como herramienta para la prueba de la susceptibilidad. El grupo - comprendiendo sobre de docena expertos de cabeza y llevado por profesor Neil Woodford, el jefe de la resistencia antimicrobiana de Inglaterra de la salud pública y de la unidad asociada atención sanitaria de la referencia de las infecciones - no eliminaron que un día será posible que un único análisis prediga cómo una especie de bacterias responderá a una droga antimicrobiana específica, pero allí es pocas pruebas a sugerir que alcanzaremos este punto en un futuro próximo.

El coordinador técnico de los datos de EUCAST, profesor Gunnar Kahlmeter del hospital central, Växjö, Suecia, dijo que es prematuro sugerir que los puntos de interrupción y las recomendaciones para la prueba fenotípica de la susceptibilidad serán requeridos no más pues los métodos genéticos los reemplazarán en cualquier momento. “Ser del uso en una situación clínica, WGS necesitará predecir resistencia antimicrobiana y también la susceptibilidad antimicrobiana, que son dos cosas muy diversas. También será necesario que el WGS cuantifique el grado de resistencia para un organismo, algo que no es actualmente posible.”

El grupo ha elegido comparar cómo el WGS puede predecir independientemente de si el organismo pertenece al tipo salvaje (está sin mecanismos de la resistencia) con la misma predicción realizada con el uso de los valores epidemiológicos del atajo (ECOFFs) desarrollados por EUCAST. Independientemente de si y en ese caso cómo esto se puede ampliar a los puntos de interrupción clínicos se discute en el papel.

El subcomité de EUCAST también destacó que no hay actualmente manera de fijar cómo son diversos laboratorios exactos del WGS, y que hay una necesidad urgente de establecer una única base de datos pública de todos los genes de resistencia sabidos dentro de diversas especies bacterianas para poder compartir datos y comparó más fácilmente.

Los expertos de EUCAST también observan que la tecnología del WGS está limitada actualmente porque no puede ser utilizada para analizar especímenes directamente - se han cultivado las bacterias pueden ser ordenado solamente una vez ellas. El lleva inevitable a los retrasos importantes y a los costos financieros adicionales, que es generalmente prohibitivo para la mayoría de los laboratorios.

EUCAST recomienda que la secuencia del entero-genoma se debe hacer una investigación y una prioridad de financiamiento en el futuro a desplegarse en nuestro conocimiento actual y para desarrollar herramientas más sofisticadas de la predicción. A medida que las bacterias continúan desarrollar mecanismos múltiples de la resistencia, desenredar la genética de su acción recíproca con los antimicrobianos llegará a ser aún más desafiador y aún más necesario, determinado como hacemos frente al avión AC-130 de la resistencia a los medicamentos extrema y de la falla global de algunos antimicrobianos.