Metabolomics et RMN

Une entrevue avec M. Iris Mangelschots, Président De Division de Bruker Biospin

Pouvez-vous Veuillez donner une introduction au Centre neuf Birmingham de Phenome et au réseau plus grand ?

Bruker a été concerné dans le réseau de Centre de Phenome depuis son début. Il y a Plusieurs années, le concept visionnaire entier d'un réseau global de phenome a été défrayé réellement avec Professeur Jeremy Nicholson et Bruker BioSpin a fait partie de lui depuis les stades précoces.

Ouverture du Centre de Phenome à l'Université de Birmingham d'AZoNetwork sur Vimeo.

Le Centre Birmingham de Phenome est une installation de grande puissance pour phenotyping métabolique des êtres humains et des organismes de modèle. Il a été financé par une récompense £8 million du Conseil " Recherche " Médical et est fourni avec le matériel de pointe à partir de quatre compagnies d'instrument scientifique. L'installation a été déterminée en tant qu'élément d'une initiative stratifiée BRITANNIQUE de médicament et est aboutie par les personnes à l'Université de Birmingham qui sont internationalement - décelé pour leurs compétences cliniques dans le metabolomics.

Le but de l'initiative est de comprendre les mécanismes liés au vieillissement humain et au début et l'étape progressive de la maladie, au niveau moléculaire. Un Autre objectif est l'identification des cibles moléculaires pour le médicament, l'exercice et l'intervention diététique. Les études viseront également à recenser les repères métaboliques qui pourraient être appliqués dans les élans pour stratifier le risque de maladies spécifiques se développant et pour déterminer qui peut ou ne peut pas répondre aux traitements.

Quelles techniques seront utilisées au centre neuf ?

La spectroscopie (NMR) de Résonance magnétique nucléaire sera utilisée avec onze spectromètres liquides de la chromatographie-masse de performance ultra-haute (UHPLC-MS), ajoutés à la robotique traitante liquide robotisée et à une infrastructure de calcul avancée.

Les Experts de différentes zones variées s'échelonnant du plan d'expérience et de la chimie analytique à la bio-informatique et aux statistiques travailleront tout ensemble au centre sur tous les aspects du projet, de la conception à la traduction d'information biologique saisie.

RMN dans Metabolomics d'AZoNetwork sur Vimeo.

Comment phenotyping métabolique diffère-t-il de phenotyping génomique ?

Le génome sert de jeu d'instructions à établir les structures et les produits biochimiques au corps humain. Le génome ne change pas réellement durant toute la durée de vie, hormis les petits changements qui se produisent en raison des mutations ou des polymorphismes uniques de nucléotide.

Le ramassage de métabolites dans le fuselage dans son ensemble désigné sous le nom du metabolome et se compose de plus de 40.000 métabolites. Le metabolome peut être divisé en différents metabolomes tissu-particuliers ou biofluid-particuliers tels que le metabolome de muscle ou le metabolome de sang.

Le metabolome peut être décrit comme produit en aval de phase terminale qui résulte de la transcription des gènes, avec les métabolites servant de précurseurs dans la protéine, l'ARN et la Synthèse d'ADN, ainsi qu'être concerné dans le règlement et signalant des voies.

À La Différence du génome, le metabolome est extrêmement dynamique et sensible aux changements de l'environnement. Un fonctionnement de personne, par exemple, modifierait le sang et les metabolomes de muscle, comparés à la façon dont ils étaient avant que la personne ait fait fonctionner. Cette sensibilité aux stimulus environnementaux est quelque chose qui peut être employée pour comprendre des mécanismes des maladies et pour recenser les biomarqueurs qui pourraient potentiellement être appliqués dans le pronostic, le diagnostic et la demande de règlement de la maladie.

Pouvez-vous Veuillez donner une synthèse des installations RMN de Bruker disponibles au Centre Birmingham de Phenome ?

Le Centre Birmingham de Phenome offre les compétences, le conseil et les capacités pour réaliser des études phenotyping de grande puissance de la population humaine utilisant des biofluids tels que le plasma, le sérum, l'urine et les prélèvements de liquide céphalo-rachidien, ainsi que les prélèvements de tissu et les lignées cellulaires.

En exécutant le metabolomics non-visé, qui se rapporte quand une large gamme de différentes classes des métabolites sont évaluées dans la recherche découverte-basée, les chercheurs emploient une combinaison de la spectroscopie de pointe (NMR) de résonance magnétique nucléaire et de la spectrométrie de masse de haute résolution avec la chromatographie ultra-haute de performance pour produire de l'information de haute qualité qui représente des milliers de métabolites.

Centre de Phenome

Deux des spectromètres sont les plates-formes d'AVANCE IVDr fournies par Bruker. Ce sont les spectromètres RMN de 600 Mhz, chacun avec une sonde de la température ambiante 5mm. La spectroscopie RMN est une plate-forme très prometteuse pour les chercheurs cliniques et de diagnostics qui active l'examen critique clinique RMN rentable et performant et la recherche d'IVD.

Comment envisagez-vous la participation de Bruker dans le réseau international croissant des centres de phenome étant produits ?

Des systèmes RMN de la spectroscopie de Bruker sont déjà utilisés dans plus de quarante centres de recherche cliniques mondial. Ils sont employés dans les hôpitaux pour exécuter des techniques relatives à la santé d'examen critique ainsi que dans le metabolomics humain de grande puissance étudie pour produire des statistiques et pour recenser des biomarqueurs.

Douze centres de phenome mondial ont été déjà installés avec Bruker en tant qu'associé pour RMN et l'inclusion du matériel RMN de Bruker au Centre Birmingham de Phenome représente une autre étape grande.

Le rôle de Bruker BioSpin dans ce réseau est évidemment d'accepter des capacités RMN, mais d'ailleurs, il est au sujet de normaliser capacités de sorte que toutes les données soient mesurées d'une voie reproductible et puissent être employées par n'importe quel membre neuf de ce réseau continuellement croissant de phenome.

Pouvez-vous Veuillez donner une synthèse du partenariat de Bruker avec le Centre de Phenome à Birmingham ?

Birmingham adhérera au réseau de centre de phenome et Bruker supportera Birmingham dans la façon dont le matériel est utilisé pour mesurer les données et la façon dont les échantillons sont préparés selon les procédures habituelles d'opération (SOPs).

Ces Concessions sont critiques en termes de produire des données reproductibles, ce pourra échangeable et être utilisée pour la recherche clinique n'importe où et à tout moment. Bruker et Université de Birmingham discuteront réellement également la collaboration dans le domaine de produire le teneur. Que, cependant, doit toujours être encore développé et nous formerons les gens qui travaillent au centre de phenome.

RMN dans le metabolomics

quelle est votre visibilité pour le partenariat entre Bruker et le centre de phenome à Birmingham ?

Tout D'abord, nous fournissons la plate-forme d'AVANCE IVDr à Birmingham et c'est la plate-forme normalisée pour n'importe quel membre de centre de phenome. Une Partie de ceci sera de former les gens sur les Concessions, qui sont critiques dedans à produire des données reproductibles qui peuvent être employées par n'importe quel membre de ce réseau global de phenome.

Birmingham peut également utiliser les données produites par tous les membres avant qu'elles aient joint le réseau. Naturellement, Bruker continuera à les supporter d'un technique et même d'un point de vue d'analyse.

Citations

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    Bruker BioSpin - NMR, EPR and Imaging. (2017, August 03). Metabolomics et RMN. News-Medical. Retrieved on November 22, 2019 from https://www.news-medical.net/news/20170117/Metabolomics-and-NMR.aspx.

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    Bruker BioSpin - NMR, EPR and Imaging. "Metabolomics et RMN". News-Medical. 22 November 2019. <https://www.news-medical.net/news/20170117/Metabolomics-and-NMR.aspx>.

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    Bruker BioSpin - NMR, EPR and Imaging. "Metabolomics et RMN". News-Medical. https://www.news-medical.net/news/20170117/Metabolomics-and-NMR.aspx. (accessed November 22, 2019).

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    Bruker BioSpin - NMR, EPR and Imaging. 2017. Metabolomics et RMN. News-Medical, viewed 22 November 2019, https://www.news-medical.net/news/20170117/Metabolomics-and-NMR.aspx.