Metabolomics e RMN

Un'intervista con Dott. Iris Mangelschots, Presidente Divisionario di Bruker Biospin

Potete fare Prego un'introduzione al nuovo Centro Birmingham di Phenome ed alla più grande rete?

Bruker è stato compreso nella rete del Centro di Phenome dal suo inizio. Parecchi anni fa, l'intero concetto immaginario di una rete globale del phenome realmente è stato sopportato con il Professor Jeremy Nicholson e Bruker BioSpin ha fa parte di dalle fasi iniziali.

Apertura del Centro di Phenome all'Università di Birmingham da AZoNetwork su Vimeo.

Il Centro Birmingham di Phenome è un grande impianto per phenotyping metabolico degli esseri umani e degli organismi del modello. È stato costituito un fondo per da un premio £8 milione dal Consiglio di Ricerca Medica ed è fornito con strumentazione avanzata da quattro società dello strumento scientifico. La funzione è stata stabilita come componente di un'iniziativa stratificata BRITANNICA della medicina e piombo dalle persone all'Università di Birmingham che sono internazionalmente - riconosciuto per la loro competenza clinica in metabolomics.

Lo scopo dell'iniziativa è di capire i meccanismi relativi ad invecchiamento umano ed all'inizio e la progressione della malattia, al livello molecolare. Un Altro obiettivo è l'identificazione degli obiettivi molecolari per la droga, l'esercizio e l'intervento dietetico. Gli studi egualmente mireranno ad identificare gli indicatori metabolici che potrebbero applicarsi negli approcci per stratificare il rischio di malattie specifiche che si sviluppano e per stabilire chi può o non può rispondere alle terapie.

Che tecniche saranno usate al nuovo centro?

La spettroscopia a risonanza magnetica (NMR) Nucleare sarà usata con undici spettrometri liquidi della cromatografia-massa della prestazione ultraelevata (UHPLC-MS), accoppiati con robotica di manipolazione liquida automatizzata e un'infrastruttura di calcolo avanzata.

Gli Esperti dai vari campi differenti che variano dalla progettazione sperimentale e dalla chimica analitica da parte a parte alla bioinformatica e dalle statistiche tutti lavoreranno insieme al centro su tutti gli aspetti del progetto, dalla concezione da parte a parte all'interpretazione delle informazioni biologiche acquisite.

RMN in Metabolomics da AZoNetwork su Vimeo.

Come phenotyping metabolico differisce dal phenotyping genomica?

Il genoma servisce da insieme delle istruzioni per la costruzione le strutture e dei prodotti biochimici nel corpo umano. Il genoma realmente non cambia durante vita, oltre ai piccoli cambi che si presentano come conseguenza delle mutazioni o di singoli polimorfismi del nucleotide.

La raccolta dei metaboliti nell'organismo complessivamente si riferisce a come il metabolome e si compone di più di 40.000 metaboliti. Il metabolome può essere diviso nei metabolomes tessuto-specifici o biofluid-specifici differenti quali il metabolome del muscolo o il metabolome di sangue.

Il metabolome può essere descritto come il prodotto a valle di stadio finale che deriva dalla trascrizione del gene, con i metaboliti che serviscono da precursori in proteina, nella sintesi del DNA e del RNA come pure partecipare al regolamento e segnalando le vie.

A Differenza del genoma, il metabolome è altamente dinamico e sensibile ai cambiamenti nell'ambiente. Un funzionamento della persona, per esempio, altererebbe il sangue e i metabolomes del muscolo, confrontati a come erano prima che la persona funzionasse. Questa sensibilità agli stimoli ambientali è qualcosa che possa essere usato per capire i meccanismi di malattia e per identificare i biomarcatori che potrebbero potenzialmente applicarsi nella prognosi, nella diagnosi e nel trattamento della malattia.

Potete fare Prego una generalità degli impianti RMN di Bruker disponibili al Centro Birmingham di Phenome?

Il Centro Birmingham di Phenome offre la competenza, il consiglio e le capacità per svolgere gli studi phenotyping su grande scala della popolazione umana che usando i biofluids quali plasma, campioni del siero, dell'urina e del liquido cerebrospinale come pure campioni e linee cellulari di tessuto.

Nell'eseguire il metabolomics non mirato a, che si riferisce a quando una vasta gamma di classi differenti di metaboliti sono valutate alla nella ricerca basata a scoperta, i ricercatori usano una combinazione di spettroscopia a risonanza magnetica nucleare (NMR) avanzata e di spettrometria di massa di alta risoluzione con la cromatografia ultraelevata della prestazione per generare le informazioni di alta qualità che rappresentano migliaia di metaboliti.

Centro di Phenome

Due degli spettrometri sono le piattaforme di AVANCE IVDr fornite da Bruker. Questi sono gli spettrometri RMN da 600 Megahertz, ciascuno con una sonda di temperatura ambiente 5mm. La spettroscopia RMN è una piattaforma molto di promessa per i ricercatori di sistemi diagnostici e clinici che permette alla selezione clinica RMN redditizia e ad alto rendimento ed alla ricerca di IVD.

Come prevedete la partecipazione di Bruker alla rete internazionale crescente dei centri del phenome che sono creati?

I sistemi RMN della spettroscopia di Bruker già sono usati dentro oltre quaranta centri di ricerca clinici globalmente. Sono utilizzati in ospedali per eseguire le tecniche correlate con la salute della selezione come pure in metabolomics umano su grande scala studia per generare le statistiche ed identificare i biomarcatori.

Dodici centri del phenome globalmente già sono stati installati con Bruker come il partner per RMN e l'inclusione della strumentazione RMN di Bruker al Centro Birmingham di Phenome rappresenta un'altra grande pietra miliare.

Il ruolo di Bruker BioSpin in questa rete è ovviamente di assicurare le capacità RMN, ma inoltre, è circa la standardizzazione delle quelle capacità in moda da misurare in un modo riproducibile e possano essere usati tutti i dati da tutto il nuovo membro di questa rete continuamente crescente del phenome.

Potete fare Prego una generalità dell'associazione di Bruker con il Centro di Phenome a Birmingham?

Birmingham aderirà alla rete del centro del phenome e Bruker supporterà Birmingham in come la strumentazione sta utilizzanda per misurare i dati ed in come i campioni sono preparati secondo le procedure operative standard (SOPs).

Questi Contentini sono critici in termini di generazione dei dati riproducibili, quello potrà cambiabile e essere usato per la ricerca clinica dovunque ed in qualunque momento. Bruker e l'Università di Birmingham definitivamente egualmente discuteranno la collaborazione nell'area di creazione del contenuto. Che, tuttavia, ancora deve più ulteriormente essere diventato e formeremo la gente che sta lavorando nel centro del phenome.

RMN in metabolomics

che cosa è la vostra visione per l'associazione fra Bruker ed il centro del phenome a Birmingham?

In Primo Luogo, stiamo fornendo la piattaforma di AVANCE IVDr a Birmingham e questa è la piattaforma standardizzata per tutto il membro del centro del phenome. La Parte di questa sarà di formare la gente sui Contentini, che sono critici dentro a generare i dati riproducibili che possono essere usati da tutto il membro di questa rete globale del phenome.

Birmingham può anche usare i dati generati da tutti i membri prima che abbiano unito la rete. Naturalmente, Bruker continuerà a supportarli da un tecnico e perfino da una prospettiva di analisi.

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    Bruker BioSpin - NMR, EPR and Imaging. (2017, August 03). Metabolomics e RMN. News-Medical. Retrieved on November 19, 2019 from https://www.news-medical.net/news/20170117/Metabolomics-and-NMR.aspx.

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    Bruker BioSpin - NMR, EPR and Imaging. 2017. Metabolomics e RMN. News-Medical, viewed 19 November 2019, https://www.news-medical.net/news/20170117/Metabolomics-and-NMR.aspx.