Metabolomics e NMR

Uma entrevista com Dr. Íris Mangelschots, Presidente Divisional de Bruker Biospin

Por Favor pode você dar uma introdução ao Centro novo Birmingham de Phenome e à rede maior?

Bruker foi envolvido na rede do Centro de Phenome desde seu começo. Diversos anos há, o conceito visionário inteiro de uma rede global do phenome foi carregado realmente com Professor Jeremy Nicholson e Bruker BioSpin foi parte dele desde as fases iniciais.

Abertura do Centro de Phenome na Universidade de Birmingham de AZoNetwork em Vimeo.

O Centro Birmingham de Phenome é uma facilidade em grande escala para phenotyping metabólico dos seres humanos e dos organismos do modelo. Foi financiado por uma concessão £8 milhão do Conselho de Investigação Médica e é fornecido com o equipamento avançado de quatro empresas do instrumento científico. A facilidade foi estabelecida como parte de uma iniciativa estratificada BRITÂNICA da medicina e é conduzida pelos indivíduos na Universidade de Birmingham que são internacional - reconhecido para sua experiência clínica no metabolomics.

A finalidade da iniciativa é compreender os mecanismos relativos ao envelhecimento humano e ao início e a progressão da doença, a nível molecular. Um Outro objetivo é a identificação de alvos moleculars para a droga, o exercício e a intervenção dietética. Os estudos igualmente apontarão identificar os marcadores metabólicos que poderiam ser aplicados nas aproximações para estratificar o risco de doenças específicas que se tornam e para estabelecer quem pode ou não pode responder às terapias.

Que técnicas serão usadas no centro novo?

A espectroscopia da ressonância magnética (NMR) Nuclear será usada junto com onze espectrómetros líquidos da cromatografia-massa do desempenho ultra-alto (UHPLC-MS), acoplados com robótica de manipulação líquida automatizada e uma infra-estrutura computacional avançada.

Os Peritos dos vários campos diferentes que variam do projecto experimental e da química analítica completamente à bioinformática e das estatísticas tudo estarão trabalhando junto no centro em todos os aspectos do projecto, da concepção completamente à interpretação da informação biológica adquirida.

NMR em Metabolomics de AZoNetwork em Vimeo.

Como phenotyping metabólico difere de phenotyping genomic?

O genoma serve como um grupo de instruções para construir as estruturas e os produtos bioquímicos no corpo humano. O genoma não muda realmente ao longo da vida, com exceção das pequenas alterações que ocorrem em conseqüência das mutações ou dos únicos polimorfismo do nucleotide.

A coleção dos metabolitos no corpo no conjunto é referida como o metabolome e compo de mais de 40.000 metabolitos. O metabolome pode ser dividido em metabolomes tecido-específicos ou biofluid-específicos diferentes tais como o metabolome do músculo ou o metabolome do sangue.

O metabolome pode ser descrito como o produto a jusante da fase final que resulta da transcrição do gene, com os metabolitos que servem como precursores na proteína, na síntese do RNA e do ADN, assim como ser envolvido no regulamento e sinalizando caminhos.

Ao Contrário do genoma, o metabolome é altamente dinâmico e sensível às mudanças no ambiente. Um corredor da pessoa, por exemplo, alterou o sangue e os metabolomes do músculo, comparados a como eram antes que a pessoa foi executado. Esta sensibilidade aos estímulos ambientais é algo que pode ser usado para compreender mecanismos da doença e para identificar os biomarkers que poderiam potencial ser aplicados no prognóstico, no diagnóstico e no tratamento da doença.

Por Favor pode você dar uma vista geral das facilidades NMR de Bruker disponíveis no Centro Birmingham de Phenome?

O Centro Birmingham de Phenome oferece a experiência, o conselho e as capacidades executar estudos phenotyping em grande escala da população humana usando biofluids tais como o plasma, as amostras do soro, da urina e do líquido cerebrospinal, assim como as amostras de tecido e as linha celular.

Ao executar o metabolomics não-visado, que refere quando uma escala larga de classes diferentes de metabolitos é avaliada na pesquisa descoberta-baseada, os pesquisadores usam uma combinação de espectroscopia avançada da ressonância magnética (NMR) nuclear e a espectrometria em massa de alta resolução com cromatografia ultra-alta do desempenho para gerar a informação de alta qualidade que representa milhares de metabolitos.

Centro de Phenome

Dois dos espectrómetros são as plataformas de AVANCE IVDr fornecidas por Bruker. Estes são os espectrómetros NMR de 600 Megahertz, cada um com uma ponta de prova da temperatura ambiente 5mm. A espectroscopia NMR é uma plataforma muito prometedora para pesquisadores clínicos e dos diagnósticos que permite a selecção clínica NMR eficaz na redução de custos, de capacidade elevada e a pesquisa do IVD.

Como você prevê a participação de Bruker na rede internacional crescente dos centros do phenome que estão sendo criados?

Os sistemas NMR da espectroscopia de Bruker são usados já dentro sobre quarenta centros de pesquisa clínicos global. São usados nos hospitais para executar técnicas saúde-relacionadas da selecção assim como no metabolomics humano em grande escala estuda para gerar estatísticas e identificar biomarkers.

Doze centros do phenome têm-se estabelecido global já com o Bruker como o sócio para NMR e a inclusão do equipamento NMR de Bruker no Centro Birmingham de Phenome representa um outro grande marco miliário.

O papel de Bruker BioSpin nesta rede é obviamente fornecer capacidades NMR, mas além disso, é sobre a estandardização daquelas capacidades de modo que todos os dados sejam medidos em uma maneira reprodutível e possam ser usados por todo o membro novo desta rede continuamente crescente do phenome.

Por Favor pode você dar uma vista geral da parceria de Bruker com o Centro de Phenome em Birmingham?

Birmingham estará aderindo à rede do centro do phenome e Bruker apoiará Birmingham em como o equipamento está sendo usado para medir os dados e em como as amostras são preparadas de acordo com os procedimentos de funcionamento padrão (SOPs).

Estas Concessões são críticas em termos de gerar dados reprodutíveis, aquela poderá cambiável e ser usado para a pesquisa clínica em qualquer lugar e a qualquer hora. Bruker e a Universidade de Birmingham definida igualmente discutirão a colaboração na área de criar o índice. Que, contudo, ainda precisa de ser tornado mais e nós estaremos treinando os povos que estão trabalhando no centro do phenome.

NMR no metabolomics

que é sua visão para a parceria entre Bruker e o centro do phenome em Birmingham?

Antes de mais nada, nós estamos fornecendo a plataforma de AVANCE IVDr a Birmingham e esta é a plataforma estandardizada para todo o membro do centro do phenome. A Parte desta será treinar os povos nas Concessões, que são críticas dentro a gerar os dados reprodutíveis que podem ser usados por todo o membro desta rede global do phenome.

Birmingham pôde igualmente usar os dados gerados por todos os membros antes que se juntaram à rede. Naturalmente, Bruker continuará a apoiá-los de um técnico e mesmo de uma perspectiva do ensaio.

Citations

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    Bruker BioSpin - NMR, EPR and Imaging. (2017, August 03). Metabolomics e NMR. News-Medical. Retrieved on November 19, 2019 from https://www.news-medical.net/news/20170117/Metabolomics-and-NMR.aspx.

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