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Metabolomics y RMN

Una entrevista con el Dr. Iris Mangelschots, presidente divisional de Bruker Biospin

Nota importante: los métodos y las soluciones descritos en esta entrevista están para el uso de la investigación solamente y no para el uso en procedimientos diagnósticos clínicos.

¿Puede usted dar por favor una introducción al nuevo centro Birmingham de Phenome y a la red más grande?

Bruker ha estado implicado en la red del centro de Phenome desde su principio. Hace varios años, el concepto visionario entero de una red global del phenome fue soportado real con profesor Jeremy Nicholson y Bruker BioSpin ha sido parte de él desde los primeros tiempos.

Orificio del centro de Phenome en la universidad de Birmingham de AZoNetwork en Vimeo.

El centro Birmingham de Phenome es una instalación en grande para phenotyping metabólico de seres humanos y de organismos del modelo. Ha sido financiado por una recompensa £8 millón del Consejo de Investigación médico y se suministra el equipo avanzado a partir de cuatro compañías del instrumento científico. La instalación se ha establecido como parte de una iniciativa estratificada BRITÁNICA del remedio y es llevada por los individuos en la universidad de Birmingham que están internacionalmente - reconocido para su experiencia clínica en metabolomics.

El propósito de la iniciativa es entender los mecanismos relacionados con el envejecimiento humano y el inicio y la progresión de la enfermedad, en el nivel molecular. Otro objetivo es la identificación de los objetivos moleculares para la droga, el ejercicio y la intervención dietética. Los estudios también apuntarán determinar los marcadores metabólicos que se podrían aplicar en aproximaciones para estratificar el riesgo de enfermedades específicas que se convertían y para establecer quién puede o no puede responder a las terapias.

¿Qué técnicas serán utilizadas en el nuevo centro?

La espectroscopia de resonancia magnética (NMR) nuclear será utilizada junto con once espectrómetros líquidos de la cromatografía-masa del funcionamiento ultraalto (UHPLC-MS), acoplados con robótica de manejo líquida automatizada y una infraestructura de cómputo avanzada.

Los expertos de diversos diversos campos que colocan de diseño experimental y de química analítica a través a la bioinformática y de las estadísticas todos trabajarán juntos en el centro en todos los aspectos del proyecto, del concepto a través a la interpretación de la información biológica detectada.

RMN en Metabolomics de AZoNetwork en Vimeo.

¿Cómo el phenotyping metabólico difiere de phenotyping genomic?

El genoma sirve como equipo de las instrucciones para construir las estructuras y los productos bioquímicos en el cuerpo humano. El genoma no cambia realmente en vida, independientemente de los pequeños cambios que ocurren como resultado de mutaciones o de únicos polimorfismos del nucleótido.

La colección de metabilitos en la carrocería en conjunto se refiere como el metabolome y se compone de más de 40.000 metabilitos. El metabolome se puede dividir en diversos metabolomes tejido-específicos o biofluid-específicos tales como el metabolome del músculo o el metabolome de la sangre.

El metabolome se puede describir como el producto rio abajo de la fase final que resulta de la transcripción del gen, con los metabilitos sirviendo como precursores en proteína, síntesis del ARN y de la DNA, e implicar en la regla y haciendo señales caminos.

A diferencia del genoma, el metabolome es altamente dinámico y sensible a los cambios en el ambiente. Un funcionamiento de la persona, por ejemplo, alteraría sangre y los metabolomes del músculo, comparados a cómo eran antes de que la persona se ejecutara. Esta sensibilidad a los estímulos ambientales es algo que se puede utilizar para entender mecanismos de la enfermedad y para determinar los biomarkers que se podrían potencialmente aplicar en el pronóstico, la diagnosis y el tratamiento de la enfermedad.

¿Puede usted dar por favor una reseña de las instalaciones de Bruker RMN disponibles en el centro Birmingham de Phenome?

El centro Birmingham de Phenome ofrece la experiencia, el consejo y las capacidades para realizar estudios phenotyping en grande de la población humana usando biofluids tales como plasma, las muestras del suero, de la orina y del líquido cerebroespinal, así como las muestras de tejido y las variedades de células.

Al realizar el metabolomics no-apuntado, que se refiere cuando una amplia gama de diversas clases de metabilitos se fijan en la investigación descubrimiento-basada, los investigadores utilizan una combinación de la espectroscopia de resonancia magnética nuclear (NMR) avanzada y de la espectrometría de masa de alta resolución con cromatografía ultraalta del funcionamiento para generar la información de alta calidad que representa millares de metabilitos.

Centro de Phenome

Dos de los espectrómetros son las plataformas de AVANCE IVDr ofrecidas por Bruker. Éstos son los espectrómetros de 600 megaciclos RMN, cada uno con una antena de la temperatura ambiente 5m m. La espectroscopia del RMN es una plataforma muy prometedora para los investigadores clínicos y de los diagnósticos que habilite la investigación clínica de poco costo, de alto rendimiento del RMN y la investigación del IVD.

¿Cómo usted considera la implicación de Bruker en la red internacional cada vez mayor de los centros del phenome que son creados?

Los sistemas de la espectroscopia del RMN de Bruker se utilizan ya hacia adentro sobre cuarenta centros de investigación clínicos global. Se utilizan en hospitales para realizar técnicas relativas a la salud de la investigación así como en metabolomics humano en grande estudia para generar estadísticas y para determinar biomarkers.

Doce centros del phenome global se han fijado ya con Bruker como el socio para el RMN y la partícula extraña del equipo de Bruker RMN en el centro Birmingham de Phenome representa otra gran piedra miliaria.

El papel de Bruker BioSpin en esta red es obviamente suministrar capacidades del RMN, pero por otra parte, está sobre estandardizar esas capacidades para medir de una manera reproductiva y se puedan utilizar todos los datos por cualquier nueva pieza de esta red contínuo cada vez mayor del phenome.

¿Puede usted dar por favor una reseña de la sociedad de Bruker con el centro de Phenome en Birmingham?

Birmingham ensamblará la red del centro del phenome y Bruker soportará Birmingham en cómo el equipo se está utilizando para medir los datos y cómo las muestras se preparan según los procedimientos estándars (SOPs).

Estas compensaciones son críticas en términos de generar datos reproductivos, ésa podrá cambiable y ser utilizado para la investigación clínica dondequiera y en cualquier momento. Bruker y la universidad de Birmingham definitivamente también discutirán la colaboración en el área de crear el contenido. Que, sin embargo, todavía necesita ser convertido más a fondo y entrenaremos a la gente que está trabajando en el centro del phenome.

RMN en metabolomics

¿Cuál es su visión para la sociedad entre Bruker y el centro del phenome en Birmingham?

En primer lugar, estamos suministrando la plataforma de AVANCE IVDr a Birmingham y ésta es la plataforma estandardizada para cualquier pieza del centro del phenome. La parte de esto será entrenar a la gente en las compensaciones, que son críticas hacia adentro a generar los datos reproductivos que se pueden utilizar por cualquier pieza de esta red global del phenome.

Birmingham puede también utilizar los datos generados por todas las piezas antes de que ensamblaran la red. Por supuesto, Bruker continuará soportarlos de un técnico e incluso de una perspectiva del análisis.

Citations

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    Bruker BioSpin - NMR, EPR and Imaging. (2020, February 21). Metabolomics y RMN. News-Medical. Retrieved on August 04, 2020 from https://www.news-medical.net/news/20170117/Metabolomics-and-NMR.aspx.

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    Bruker BioSpin - NMR, EPR and Imaging. "Metabolomics y RMN". News-Medical. 04 August 2020. <https://www.news-medical.net/news/20170117/Metabolomics-and-NMR.aspx>.

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    Bruker BioSpin - NMR, EPR and Imaging. "Metabolomics y RMN". News-Medical. https://www.news-medical.net/news/20170117/Metabolomics-and-NMR.aspx. (accessed August 04, 2020).

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