Os métodos NMR-baseados Avançados para estudar RNPs e droga projectam

Prof. Dr. Teresa CarlomagnoTHOUGHT LEADERS SERIES...insight from the world’s leading experts

A espectroscopia da ressonância magnética (NMR) Nuclear é uma ferramenta analítica poderosa amplamente utilizada na pesquisa química para investigar a estrutura e a dinâmica das moléculas.

Na Universidade de Leibniz de Hannover, uma equipe dos pesquisadores tem usado uma aproximação multidisciplinar que combinasse métodos NMR, bioquímicos, biofísicos e por computador para investigar a estrutura dos complexos altos do peso molecular que não podem ser abordados usando sozinho NMR.

O grupo é estado relacionado com as duas linhas principais de pesquisa. Um é a estrutura e a função dos complexos do ribonucleoprotein (RNPs) que têm a actividade catalítica no metabolismo do RNA e no regulamento da expressão genética. A outro é a interacção entre moléculas pequenas e seus grandes, receptors macromoleculares, para a revelação das metodologias para o projecto estrutura-baseado da droga.

Em uma entrevista com a Notícia Médica, o Prof. Dr. Teresa Carlomagno do líder da equipa descreveu um complexo que o grupo tem investigado recentemente que RNA ribosomal dos methylates (rRNA). Disse o rRNA e, de facto, o RNA geralmente, submete-se à alteração em posições diferentes: “Um do mais difundidos destas alterações químicas é methylation no 2' - a posição de O do ribose e da pilha atravessa muito problema conseguir esta alteração.”

A pilha complicou a maquinaria no lugar que envolve o guia RNAs que reconhece as seqüências do rRNA que exigem o methylation. Cada Um destes guia RNAs reconhece dois locais do rRNA. Os pesquisadores presumiram que se esta era funcional significativa e os dois misturaram o controle dos locais, a estrutura nos dois locais do methylation precisaria de diferir.

Bruker Biospin

Contudo, uma estrutura publicada por outros pesquisadores e estabelecida pelo cristalografia do Raio X mostrou que os dois rRNA locais obrigatórios estavam exactamente no mesmo ambiente e teve a mesma estrutura.

A Posterior investigação pelo grupo de Carlomagno, usando uma combinação de dispersão NMR e do pequeno-ângulo de nêutron, revelou uma estrutura que diferisse à publicada. Os pesquisadores tinham mostrado, pela primeira vez, que os locais de reconhecimento do rRNA existem de facto em dois ambientes diferentes, sugerindo que o methylation enzimático dos locais ocorresse em ordem, um pouco do que simultaneamente.

A equipe executou ensaios funcionais na câmara de ar NMR que mostrou que as duas seqüências do RNA estiveram misturadas certamente segundo se, com a seqüência do “líder” que exige o methylation para que a outro esteja misturada e liberada. Isto significou que o regulamento seqüencial estava ocorrendo e, seguinte, os pesquisadores têm projectado experiências da biologia celular verificar o significado fisiológico deste controle.

Nós pensamos que este é um processo os usos da pilha permite a eficientemente e rapidamente a dobradura do ribosome. De facto, se você elimina o methylation das pilhas, morrem.” 

Prof. Dr. Teresa Carlomagno

Igualmente indicou que as experiências funcionais poderiam somente ser projectadas em conseqüência da informação inferida da descoberta de sua estrutura e do methylation seqüencial: “Este é algo que nem a estrutura do Raio X nem a estrutura da microscopia de elétron podiam revelar. As outras técnicas tomam somente uma imagem estática do complexo, visto que nós podemos seguir o ciclo inteiro.”

Carlomagno foi sobre descrever uma metodologia que a equipe se tem tornado recentemente para apoiar o projecto estrutura-baseado da droga. O grupo tinha sido aproximado pelas companhias farmacéuticas que querem saber determinados chumbos da droga ligam aos receptors. A fim fazer isto, os pesquisadores necessários a droga para cristalizar-se com o receptor, mas com as grandes moléculas do receptor, isto não são sempre possíveis.

A equipe decidiu olhar a ligante somente. Esta ligante retem uma “memória” do estado do receptor-limite, uma vez no estado livre. Este estado livre pode dizer aos pesquisadores a conformação que a ligante adota quando liga a um receptor. Contudo, não pode dizer-lhe como o emperramento ocorre.

Bruker Biospin

Isto conduziu o grupo de Carlomagno desenvolver uma metodologia NMR-baseada nova chamada InPharma. InPharma emprega duas ligantes que ligam ao receptor em uma maneira alterna, trocando continuamente sua posição no bolso obrigatório. A Informação deixada no bolso pela primeira ligante é então “instruída” pela segunda ligante quando liga.

“Fazendo as duas ligantes fale desta maneira, você sabem que átomo da ligante tinha sido próximo a que peça do receptor lendo o para fora nas partes das ligantes que puderam se comunicar entre se,” explicou Carlomagno. Esta informação é extraída usando-se a bioinformática e usada então para encontrar que as peças do receptor as ligantes consideraram e como se comunicaram com o receptor. “Desenvolvendo esta metodologia, nós encontramos uma maneira de obter os modos obrigatórios destas ligantes aos receptors nos casos onde uma estrutura de cristal não pode ser resolvida.”

Carlomagno adicionou que está muito feliz com o produto e as companhias farmacéuticas têm relatado já em dados de InPharma que controlaram adquirir sem a ajuda ou o conselho do grupo.

Para obter mais informações sobre do Grupo de Carlomagno, InPharma, e o trabalho da equipe em complexos de RNP, alcançam por favor a seguinte relação: http://carlomagno-group.org/

Citations

Please use one of the following formats to cite this article in your essay, paper or report:

  • APA

    Bruker BioSpin - NMR, EPR and Imaging. (2017, August 03). Os métodos NMR-baseados Avançados para estudar RNPs e droga projectam. News-Medical. Retrieved on August 19, 2019 from https://www.news-medical.net/news/20170124/Advanced-NMR-based-methods-for-studying-RNPs-and-drug-design.aspx.

  • MLA

    Bruker BioSpin - NMR, EPR and Imaging. "Os métodos NMR-baseados Avançados para estudar RNPs e droga projectam". News-Medical. 19 August 2019. <https://www.news-medical.net/news/20170124/Advanced-NMR-based-methods-for-studying-RNPs-and-drug-design.aspx>.

  • Chicago

    Bruker BioSpin - NMR, EPR and Imaging. "Os métodos NMR-baseados Avançados para estudar RNPs e droga projectam". News-Medical. https://www.news-medical.net/news/20170124/Advanced-NMR-based-methods-for-studying-RNPs-and-drug-design.aspx. (accessed August 19, 2019).

  • Harvard

    Bruker BioSpin - NMR, EPR and Imaging. 2017. Os métodos NMR-baseados Avançados para estudar RNPs e droga projectam. News-Medical, viewed 19 August 2019, https://www.news-medical.net/news/20170124/Advanced-NMR-based-methods-for-studying-RNPs-and-drug-design.aspx.