Aviso: Esta página é uma tradução automática da página original em inglês. Por favor note uma vez que as traduções são geradas por máquinas, não tradução tudo será perfeita. Este site e suas páginas da Web destinam-se a ler em inglês. Qualquer tradução deste site e suas páginas da Web pode ser imprecisas e imprecisos no todo ou em parte. Esta tradução é fornecida como uma conveniência.

O software computacional que avalia amostras do ADN pode ajudar no diagnóstico, tratamento do cancro

Uma equipa de investigação dos Estados Unidos e do Canadá tornou-se e o software computacional novo com sucesso testado que determina se uma amostra humana do ADN inclui um serviço adicional epigenético ligado ao cancro e a outras normas sanitárias adversas.

Na introdução do 20 de fevereiro do jornal, membros da equipa da Universidade Johns Hopkins,

O Cytosine é um dos quatro blocos de apartamentos genéticos principais, ou dos nucleotides, que compo o ADN. O Methylation refere simplesmente a presença de um grupo (metílico) bioquímico anexado a um nucleotide, neste caso cytosine. Esta versão alterada do cytosine pode afectar a maneira que os genes importantes são de ligar/desligar comutado. Tais miscues genéticos podem jogar dano com actividade saudável dentro das pilhas.

Examinar estas marcas é importante para os pesquisadores que estão tentando fixar para baixo o papel preciso do methylation em vários problemas de saúde. Mas os métodos actuais de traçar o methylation cada um têm defeitos teimosos, tais como a manipulação áspera da amostra do ADN e da necessidade usar amostras de tecido particularmente grandes e pre-tratadas.

O software novo descrito em métodos da natureza é usado com um nanopore disponível no comércio que arranja em seqüência o dispositivo. Os autores dizem que esta técnica caracterizará directamente o methylation do ADN das amostras de tecido menores. “Nós mostramos que com a análise cuidadosa do nanopore que arranja em seqüência dados nós podemos extrair esta camada extra de informação,” dissemos o autor principal Jared T. Simpson, um investigador principal no programa da informática e da Bio-computação no instituto de Ontário para a investigação do cancro e em um professor adjunto da informática na universidade de toronto.

O software da equipe internacional é projectado trabalhar com um sequencer do sequaz das tecnologias de Oxford Nanopore, aproximadamente o tamanho de uma grande movimentação do polegar de USB. Quando esta unidade é usada, o ADN está puxado através de 512 furos extremamente pequenos, porque uma corrente elétrica passa completamente. As mudanças distintivas na corrente como os movimentos do ADN através do furo permitem que o software identifiquem a seqüência do ADN, e agora as marcas do methylation no ADN também.

No papel dos métodos da natureza, os pesquisadores disseram que usaram primeiramente o ADN sintètica misturado “para treinar” seu software para distinguir entre o cytosine misturado e o cytosine que falta o acessório bioquímico crucial.

Os membros da equipa testaram então o processo do software nas amostras do ADN derivadas das pilhas de cancro da mama humanas e detectaram com sucesso mudanças no methylation entre o cancro e amostras normais.

“Esta técnica pode ler partes longas de ADN e considerar mudanças na extensão do methylation na amostra,” disse Winston Timp, um professor adjunto da engenharia biomedicável em Johns Hopkins que supervisionou a pesquisa e foi autor superior do artigo de jornal. “Deixou-nos olhar como as mudanças no methylation aparecem em moléculas individuais enquanto passam através deste poro.”

Tal informação é importante, os pesquisadores dizem, porque o methylation defeituoso é acreditado para jogar um papel nos defeitos congénitos e doenças tais como a artrite reumatóide, assim como cancro. “Nós já sabemos,” Timp disse, “que as mudanças do methylation aparecem cedo na revelação do cancro.”

Disse que mais informação sobre o methylation do ADN poderia ser útil em planejar maneiras novas de detectar o cancro em uma fase mais adiantada e em desenvolver os tratamentos novos que são visados mais precisamente à composição genética de um paciente.

Para ajudar o avanço tal pesquisa, os membros da equipa fez seu nanopore que arranja em seqüência o software para detectar o methylation do ADN disponível em uma base livre do open source em https://github.com/jts/nanopolish.

“Nós tomamos a esta linha de pesquisa um passo crítico mais adiante,” Timp disse. “Minha esperança é que outro neste campo começará a usar o software imediatamente.”

“Felicitações aos membros da equipa da Universidade Johns Hopkins, o instituto de Ontário para a investigação do cancro e a universidade de toronto em seu gene novo que arranja em seqüência o software e os resultados,” disse Reza Moridi, o ministro de Ontário da pesquisa, da inovação e da ciência. “Estas introspecções novas no methylation do ADN podiam ajudar a conduzir às maneiras novas e inovativas de detectar e tratar o cancro.”

Citations

Please use one of the following formats to cite this article in your essay, paper or report:

  • APA

    Oxford Nanopore Technologies. (2019, June 19). O software computacional que avalia amostras do ADN pode ajudar no diagnóstico, tratamento do cancro. News-Medical. Retrieved on October 17, 2021 from https://www.news-medical.net/news/20170224/Computational-software-that-evaluates-DNA-samples-may-help-in-diagnosis-treatment-of-cancer.aspx.

  • MLA

    Oxford Nanopore Technologies. "O software computacional que avalia amostras do ADN pode ajudar no diagnóstico, tratamento do cancro". News-Medical. 17 October 2021. <https://www.news-medical.net/news/20170224/Computational-software-that-evaluates-DNA-samples-may-help-in-diagnosis-treatment-of-cancer.aspx>.

  • Chicago

    Oxford Nanopore Technologies. "O software computacional que avalia amostras do ADN pode ajudar no diagnóstico, tratamento do cancro". News-Medical. https://www.news-medical.net/news/20170224/Computational-software-that-evaluates-DNA-samples-may-help-in-diagnosis-treatment-of-cancer.aspx. (accessed October 17, 2021).

  • Harvard

    Oxford Nanopore Technologies. 2019. O software computacional que avalia amostras do ADN pode ajudar no diagnóstico, tratamento do cancro. News-Medical, viewed 17 October 2021, https://www.news-medical.net/news/20170224/Computational-software-that-evaluates-DNA-samples-may-help-in-diagnosis-treatment-of-cancer.aspx.