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Los investigadores desarrollan la biblioteca de referencia genética elegante para localizar mutaciones enfermedad-que causan

La universidad de Hiroshima encuentra manera de determinar enfermedad-causar mutaciones

Los investigadores en la universidad de Hiroshima han desarrollado una biblioteca de referencia genética elegante para localizar y escardar mutaciones fuera enfermedad-que causaban en poblaciones.

La técnica y la base de datos, desarrolladas por el Dr. Satoshi Okada, de la escuela de HU del Biomedical y de las ciencias de la salud, ha estimado con éxito raro-variantes naturales en el gen STAT1 - y ha determinado las enfermedades que resultarían.

Usando la exploración de la alanina - un método para fijar el potencial funcional de genes, este estudio, el primer de su clase, debe ayudar a doctores en el diagnóstico de primario-inmunodeficiencia en pacientes.

STAT1

El gen STAT1 juega una función importante en inmunidad del ordenador principal, con su papel como mediador entre la transmisión de señales química experimentada en los receptores de la superficie de la célula - y la acción resultante de la reacción en el núcleo.

Cuando es estimulado por la alfa química del interferón de las señal-ondas portadoras, el interferón beta, y/o la gamma del interferón, STAT1, que existe en citoplasma de la célula, acopla con otras moléculas del STAT. Estos pareados entonces se mueven al núcleo donde la inmunidad que determina la transcripción genética comienza.

Cualquier variación en este proceso, con la mutación del gen STAT1, puede tener consecuencias serias para los pacientes. Mientras que muchas variantes genéticas no tendrán ningún efecto sobre inmunidad, algunas pueden llevar a la sobre-activación del núcleo - dando por resultado los pacientes que desarrollan infecciones por hongos persistentes.

Por otra parte, las mutaciones que reducen la transmisión de señales gamma STAT1 del interferón, pueden llevar a los pacientes que desarrollan inmunidad reducida a las infecciones bacterianas. En casos graves, estos desordenes pueden ocurrir simultáneamente llevando a la muerte.

Problema

Los investigadores del problema tienen están determinando qué desorden llevarán estas mutaciones raras, cuando están descubiertas, en a los pacientes.

Las aplicaciones informáticas actuales no pueden distinguir si las mutaciones newfound aumentan o disminuyen la activación. También a menudo la consiguen incorrecta, determinando variaciones genéticas como enfermedad que causa cuando de hecho son inofensivas.

¡Se agrega a estas dificultades el hecho de que diversos tipos de las mutaciones STAT1 ocurren en las regiones que recubren del gen - y las enfermedades muy diversas que resultan de vez en cuando los síntomas similares de la parte!

Solución

Para resolver este dilema los investigadores en HU desarrollaron una técnica y una base de datos para estimar el potencial de la enfermedad de las mutaciones STAT1. Esto implicó el medir de la actividad de la activación exhibida por centenares de sustitutos inducidos de la alanina del mutante STAT1.

Midiendo el rendimiento transcriptivo para cada uno de éstos, podían determinar si las variaciones específicas llevarían a la activación creciente - causando enfermedad fungicida, o la activación disminuida - causar los bacterianos.

Confirmaron estos datos nuevamente compaginados eran exactos y útiles comparándolos a las mutaciones sabidas limitadas STAT1 llevadas a cabo en bases de datos globales, y exacto prediciendo el efecto de dos mutaciones newfound originarias de pacientes con las enfermedades confirmadas STAT1.

Los datos también contribuyeron al modelado 3D de STAT1, ayudando a nuestra comprensión molecular del camino STAT1 y cómo la enfermedad se convierte.

Potencial real

Los adelantos recientes en genoma ordenan tecnologías, tales como generación siguiente que ordena (NGS), han permitido para que los investigadores destapen rápidamente los granes números de mutaciones naturales desconocidas y las variaciones en pacientes. Los científicos necesitan saber si éstos son inofensivos y pueden ser idos en el lugar, o el causar y necesidad actuaba de la enfermedad sobre.

El Dr. Okada cree que su biblioteca genética STAT1 es la respuesta y que se debe desplegar para incluir otros genes en la formación de una biblioteca de referencia genética extensa. Él cree que su uso conjuntamente con el genoma la secuencia de tecnologías resolvería cualquier misterio genético que resulte - y que ayuda al combate eterno en enfermedad de combate.