Ligando o RNA às doenças auto-imunes

Uma entrevista com Dr. Perseguição Spurlock, CEO, IQuity, conduziu daqui até abril Cashin-Garbutt, MILIAMPÈRE (Cantab)

Que são não-codificação longa RNAs (lncRNAs) e como diferem do mensageiro RNAs (mRNAs)?

Bem, o dogma central da biologia indica que o ADN faz o RNA e o RNA faz proteínas. Contudo, há muitos tipos diferentes de RNAs, e somente um delas, o RNA de mensageiro (mRNA), causa proteínas. Alguns outro não fazem proteínas de todo.

Quando os mapas do genoma humano foram terminados, observou-se que havia os estiramentos da seqüência do ADN para que nenhuma função tinha sido identificada. Nós chamamos estas regiões da “ADN sucata.” Mas sobre uma década mais tarde, nós apreciamos agora que esta “sucata” de facto está exercendo alguma meio função biológica, e uma maneira é através da produção de não-codificação longa RNAs, ou dos lncRNAs.

os lncRNAs emergiram como uma classe nova de molécula do RNA predominante no final de 2000s e nós ainda estamos tentando reconhecer inteiramente sua importância. os lncRNAs não causam proteínas, mas são reguladores poderosos de outros genes que são frequentemente próximos.

Sistema do PCR do Tempo real de QuantStudio

O Cientista Superior John T. Tossberg de IQuity, M.S., analisa os genes em uma amostra paciente usando um sistema do PCR do Tempo real de QuantStudio.

Por Que é a pesquisa de IQuity em lncRNAs?

IQuity foi interessado nos lncRNAs porque muitos dos genes da proteína-codificação, dos mRNAs - que são importantes no sistema imunitário, e de papéis importantes do jogo em montar uma resposta imune eficaz - tenha lncRNAs na grande proximidade. Assim nossa curiosidade conduziu-nos considerar uma estratégia da culpa-por-associação. Nós começamos a fazer um mapa de nossa pesquisa nesta área que procura os lncRNAs co-expressados e os mRNAs próximos que nós soubemos para ser importantes.

Nós estudamos se estes lncRNAs influenciavam o ao lado dos genes, e em caso afirmativo, se nós poderíamos modular um lncRNA para alterar a função ou o fenótipo de uma pilha. A resposta era yes. Tão então a pergunta seguinte eram, podiam estes lncRNAs ser batidos para baixo para tratar doenças auto-imunes ou doenças do sistema imunitário? Nós precisaremos um pouco de mais hora de figurar para fora esse.

Entretanto, nós investigamos a expressão de lncRNAs conhecidos e aqueles nós identificamo-nos, tentando ver se alteraram a expressão nivelam em pacientes doentes e não-doentes. O Que nós encontramos é que as diferenças na expressão do lncRNA nivelam entre nossas populações pacientes excedem distante qualquer coisa que nós observamos nunca com mRNAs, assim que nós começamos explorar em maiores detalhes lncRNAs e continuaremos este trabalho no futuro.

Que descobertas até agora foram feitos na relação entre o RNA e o diagnóstico de doenças auto-imunes?

As Diferenças na expressão genética foram exploradas por muitos anos através de muitas circunstâncias, incluindo doenças auto-imunes. No 2000s adiantado, a invenção de tecnologias da expressão genética do microarray deu-nos a capacidade para seleccionar ràpida ao mesmo tempo níveis da expressão de muitos genes conhecidos.

Estes estudam cedo centrado primeiramente sobre os mRNAs, onde as diferenças na expressão podem ser bastante modestas. Hoje, embora, nós temos a capacidade para seleccionar não somente mRNAs, mas igualmente não-codificação RNAs, se sejam não-codificação curto RNAs ou lncRNAs. Isto foi realizado primeiramente através do RNA inteiro do genoma que arranja em seqüência as tecnologias que emergiram durante os últimos 10 anos.

Um artigo recente na Neurologia do JAMA destacou um grupo no trabalho de Harvard com não-codificação curto RNAs. De acordo com os resultados de MRI, estes microRNAs mudaram nos pacientes com esclerose múltipla. Aquela é apenas uma inovação recente, e reforça mais que outro está encontrando a informação útil a nível de RNA.

Muitos povos na comunidade científica estão investigando o RNA, e em nossa pesquisa nós centramo-nos sobre lncRNAs e exploramo-nos seu serviço público no processo diagnóstico.

Nós acreditamos que nossos dados destacam a informação tremenda que é contida a nível de RNA, e nós somos comprometidos aos testes tornando-se para a esclerose múltipla (MS), síndrome do intestino irritável (IBS), a doença de entranhas inflamatório (IBD, que inclui Crohn e colite), e então logo, artrite reumatóide (RA), lúpus e fibromialgia.

Nós estamos indo oferecer uma ferramenta original para fornecedores no campo auto-imune.

Pipeta do canal de VIAFLO 96

John T. Tossberg, M.S., um cientista superior em IQuity, usa uma pipeta do canal de VIAFLO 96, que permita mais rapidamente o processamento das amostras no laboratório.

Por Que as condições tais como a fibromialgia foram tradicional difíceis de diagnosticar?

Acima até da última década, nós não tivemos os critérios diagnósticos a seguir a fim fazer um diagnóstico definitivo. A Fibromialgia permanece um diagnóstico clínico, e é uma da exclusão.

A Faculdade Americana da Reumatologia (ACR) indica que a fibromialgia está confundida às vezes com a artrite reumatóide ou o lúpus, e ao contrário da fibromialgia, da inflamação reumático da causa destas doenças nas junções e dos tecidos.

A Fibromialgia é caracterizada por dor difundida ao longo do tempo, por todo o lado no corpo nas junções do músculo-tendão, e não foi até que o ACR saiu com estes critérios diagnósticos que exigem a evidência de determinados pontos macios no corpo que nós podíamos codificar um sistema para chegar em um diagnóstico da fibromialgia.

Muitos dos testes de laboratório de uso geral estão olhando para excluir outras possibilidades, e nós temos para ver ainda um teste definitivo que identifique a fibromialgia.

Nossa pesquisa mostra que a síndrome da fibromialgia, o RA e os pacientes do lúpus exibem assinaturas muito originais da expressão genética do RNA, e estas diferenças são mensuráveis. Nós somos muito esperançosos que esta ferramenta está indo fornecer a informação accionável na clínica para fornecedores.

Como você pensa o diagnóstico de tais circunstâncias poderia ser superado usando a informação do lncRNA?

Nós estamos indo fazer tudo em nossa potência dar a fornecedores a melhor informação de modo que possam ajudar seus pacientes. O estudo dos lncRNAs é uma área da investigação activa no campo científico, e ligar suas expressão e função às aplicações clínicas é algo que muitos povos agora estão começando a explorar. Com nossas aproximações analíticas, nós podemos peneirar com a informação contida a nível de RNA e desenvolver as ferramentas que os doutores podem leverage para fazer decisões clínicas.

IQuity recebeu recentemente uma concessão $150.000 dos Institutos Nacionais do Programa de investigação da Inovação da Empresa De Pequeno Porte De Saúde (NIH) (SBIR). Como você planeia usar esta concessão?

IQuity está indo usar esta concessão para explorar mais a biologia do lncRNA no contexto da fibromialgia e de outras doenças reumáticos. Nós recebemos uma concessão similar no ano passado para investigar lncRNAs na esclerose múltipla, e estes estudos excederam nossas expectativas e mostraram diferenças nos testes padrões da expressão do lncRNA que eram distante maiores do que nós poderiam ter esperado.

Esta concessão permitirá que nós testem hipóteses similares na reumatologia através de um grande número pacientes diagnosticados com síndrome da fibromialgia e outras doenças reumáticos. Nós estamos olhando para forjar a conexão entre lncRNAs e estas doenças. lncRNAs no contexto de doenças rheumatologic e da doença auto-imune em sobras gerais em sua infância. Nós somos muito entusiasmado estar entre o primeiro para fazer um mapa desta área da biologia.

Processo de IQUITY infographic

Que é a visão de IQuity?

Nós esforçamo-nos para ser um sócio com os fornecedores de serviços de saúde dando lhes o acesso à informação com nossas aproximações analíticas que não tiveram acima até deste ponto. Nós planeamos continuar nossos esforços da investigação e desenvolvimento para trazer testes adicionais para introduzir no mercado. Nós queremos fornecedores ter as melhores ferramentas possíveis de modo que possam o melhor deleite estas doenças desafiantes.

Que você pensa as posses futuras para pacientes com doenças auto-imunes?

Melhore as ferramentas diagnósticas acopladas com melhores tratamentos, assim como as estratégias de gestão da doença, que devem conduzir para melhorar resultados.

Em IQuity, nós temos contemplado igualmente activamente a revelação de uma ferramenta que poderia ser usada para medir a actividade da doença e para seguir as fases da doença nos pacientes.

Embora nós não sejamos uma empresa do directo-à-consumidor, nós temos o consumidor em nossas mentes, e o foco principal de nosso trabalho é os pacientes que são afligidos com estas circunstâncias auto-imunes. Nós queremos ver pacientes conduzir vidas longas, produtivas. Nós estamos fazendo tudo que nós podemos armar seus fornecedores com a informação de modo que possa abrandar as conseqüências prejudiciais de doenças crônicas como a doença auto-imune.

Onde podem os leitores encontrar mais informação?

Nosso Web site é IQuity.com.

Sobre o Dr. Perseguição Spurlock

Perseguição SpurlockO Dr. Perseguição Spurlock é comprometido a traduzir descobertas da ciência básica em estratégias diagnósticas melhoradas para pacientes com as circunstâncias auto-imunes. Como o CEO de IQuity, tem o descuido do dia a dia de todos os aspectos da empresa assegurando-se de que a visão e a missão estejam realizadas.

O trabalho publicado do Dr. Spurlock explora a base molecular para a doença auto-imune e examina mais alvos terapêuticos na gestão destas doenças que leveraging um grupo diverso de aproximações genomic e bioquímicas que incluem a expressão genética e a próxima geração que arranjam em seqüência tecnologias.

O Dr. Spurlock é graduado do Kappa da Phi um Beta Da Universidade do Sul, onde recebeu seu diploma de licenciado na biologia, magna cum laude, com honras departamentais. Ganhou seu Ph.D. na microbiologia e na imunologia da Faculdade de Medicina da Universidade de Vanderbilt, onde foi concedido a concessão de Sidney P. Colowick para a pesquisa proeminente.