Anknyta RNA till autoimmune sjukdomar

En intervju med Dr. Jaga Spurlock, VD:N, IQuity, förade vid April Cashin-Garbutt, MODERN (Cantab)

Är Vad långa non-kodifiera RNAs (lncRNAs) och hur skilja sig åt de från budbärare RNAs (mRNAs)?

Välla Fram, påstår centraldogmet av biologi att DNA gör RNA och RNA gör proteiner. Emellertid finns det många olika typer av RNAs, och endast en av dem, budbärareRNAEN (mRNA), ger löneförhöjning till proteiner. Några andra gör inte proteiner alls.

Vilket som är inget fungera hade identifierats, När kartlägger av människagenom, avslutades, det märktes att det fanns elasticiteter av DNA ordnar för. Vi kallade dessa regioner ”skräpDNA.”, Men över ett mer sistnämnd årtionde, uppskattar vi nu att detta ”skräp” är i faktumet som utövar något sorterar av biologiskt fungerar, och ett är långt till och med produktionen av långa non-kodifiera RNAs eller lncRNAs.

lncRNAs som dykas upp som ett nytt, klassificerar av RNAmolekylen huvudsakligen i den sena 2000sen, och vi är stilla pröva som fullständigt känner igen deras betydelse. lncRNAs ger inte löneförhöjning till proteiner, men de är kraftiga regulatorer av andra gener som är ofta närliggande.

QuantStudio RealtidsPCR-system

IQuity analyserar den Höga Forskare John T. Tossberg, M.S., generna i en tålmodig tar prov genom att använda QuantStudio ett RealtidsPCR-system.

Varför IQuity är att forska in i lncRNAs?

IQuity har intresserats i lncRNAs, därför att många av dekodifiera generna, mRNAsna - som är viktiga i immunförsvaret, och viktiga roller för lek i beslag ett effektivt immunt svar - ha lncRNAs i nära närhet. Så ledde vår kuriositet oss för att betrakta enanslutning strategi. Vi började att kartlägga vår forskning i detta område som söker efter co-uttryckta lncRNAs och närliggande mRNAs som vi visste för att vara viktiga.

Vi som var utstuderade dessa lncRNAs, påverkade huruvida gengrannhuset, och om så, om vi kunde modulera en lncRNA för att förändra en cell fungerar eller fenotypen. Svaret var jaet. Så därefter det nästa var, kunde ifrågasätter dessa lncRNAs vara knockade till autoimmune sjukdomar för fest eller sjukdomar av immunförsvaret? Vi ska behov lite en mer tid att figurera det ut.

I mellantiden har vi utforskat uttryckt av bekant lncRNAs, och de som vi har identifierat oss själva, pröva för att se, om de har förändrat uttryck jämnar i diseased och non-diseased tålmodig. Vad vi grundar, ska är, att skillnader i lncRNAuttryck jämnar bland våra tålmodiga befolkningar långt överskrider något som vi har någonsin observerat med mRNAs, så vi har startat att undersöka lncRNAs i mer stor specificerar och fortsätter detta arbete i framtiden.

Vilka upptäckter så avlägset har gjorts in i anknyta mellan RNA och diagnosen av autoimmune sjukdomar?

Skillnader i genuttryck har undersökts för många år över många villkorar, inklusive autoimmune sjukdomar. I tidig sort 2000s, gav uppfinningen av teknologier för microarraygenuttryckt oss kapaciteten snabbt att avskärma uttryck jämnar av många bekant gener samtidigt.

Dessa tidig sortstudier fokuserade i första hand på mRNAs, var skillnaderna i uttryck kan vara ganska blygsamma. I Dag, fast, vi har kapaciteten inte endast att avskärma mRNAs, men non-kodifiera också RNAs, huruvida är de kort non-kodifiera RNAs eller lncRNAs. Detta har varit fulländat i första hand till och med hela teknologier för genomRNAordnande i viss följd som har dykt upp över jumbon 10 år.

En ny artikel i JAMA-Neurology markerade en grupp på Harvards arbete med kort non-kodifiera RNAs. Enligt MRI-rönet ändrade dessa microRNAs i tålmodig med multipelsclerosis. Det är precis en ny innovation, och den förstärker vidare att andra finner användbar information på det jämnt av RNA.

Många folk i den vetenskapliga gemenskapen utforskar RNA, och i vår forskning fokuserar undersöker vi på lncRNAs och deras nytto- i den processaa diagnostiken.

Vi tror att våra data markerar den enorma informationen som innehålls på det jämnt av RNA, och vi begås till framkallning testar för multipelsclerosisen (MS), det retliga tarmsyndromet (IBS), den upphetsa tarmsjukdomen (IBD, som inkluderar Crohns och koliter), och därefter snart, den rheumatoid artrit (RA), lupus och fibromyalgiaen.

Vi går att erbjuda ett unikt bearbetar för familjeförsörjare i det autoimmune sätter in.

VIAFLO 96 kanaliserar pipetten

John T. Tossberg, M.S., en hög forskare på IQuity, bruk en VIAFLO 96 kanaliserar pipetten, som möjliggör snabbare att bearbeta av tar prov i labbet.

Varför villkorar liksom fibromyalgia har traditionellt varit svårt att diagnostisera?

Upp till det sist årtiondet hade vi inte diagnostiska kriterier som ska följas för att göra en definitiv diagnos. Fibromyalgiaen återstår en klinisk diagnos, och den är en av uteslutandet.

AmerikanHögskolan av Rheumatology (ACR) påstår, att fibromyalgiaen är ibland förvirrad med rheumatoid artrit eller lupus, och i motsats till fibromyalgia, dessa reumatiska sjukdomar orsakar inflammation i fogar ihop och silkespapper.

Fibromyalgiaen karakteriseras av utbrett smärtar med tiden, all över förkroppsliga på muskel-senan föreningspunkterna, och den var, inte tills ACREN kom ut med dessa diagnostiska kriterier som att kräva bevisar av bestämt anbud pekar i förkroppsliga att vi var kompetent att koda ett system för att ankomma på en fibromyalgiadiagnos.

Många av det gemensamt använda labbet testar ser för att utesluta andra möjligheter, och vi har ännu att se ett definitivt testa som identifierar fibromyalgia.

Vår forskning visar att fibromyalgiasyndromet, RA och lupustålmodig ställer ut mycket unika häften för RNAgenuttryck, och dessa skillnader är mätbara. Vi är mycket hoppfulla som denna bearbetar går att ge actionable information i kliniken för familjeförsörjare.

Hur gör du funderare som diagnosen av sådan villkorar kunde vara betaget genom att använda information om lncRNA?

Vi går att göra allt i vårt driver för att ge familjeförsörjare den bäst informationen, så att de kan hjälpa deras tålmodig. Studien av lncRNAs är ett område av aktivutredning i det vetenskapligt sätter in och anknyta deras uttryck och fungerar till kliniska applikationer är något som folket för en radda är nyss början som ska undersökas. Till Och Med vårt analytiskt att närma sig, är vi kompetent att sikta till och med information som innehålls på det jämnt av RNA, och att framkalla bearbetar som manipulerar kan utnyttja för att göra kliniska beslut.

IQuity mottog för en tid sedan ett lån $150.000 från MedborgareInstituten av Hälsas (NIH) programet för Forskning för Innovation för Små (SBIR) Affär. Hur planerar du för att använda detta lån?

IQuity går att använda detta lån vidare för att undersöka lncRNAbiologi i sammanhanget av fibromyalgiaen och andra reumatiska sjukdomar. Vi mottog ett liknande lån i fjol för att utforska lncRNAs i multipelsclerosis, och dessa studier överskred våra förväntningar, och visade skillnader i lncRNAuttryck mönstrar, som var långt mer stor, än oss kunde ha hoppas.

Denna ska utmärkelse låter oss testa liknande hypoteser i rheumatology över ett stort nummer av tålmodig som diagnostiseras med fibromyalgiasyndrom och andra reumatiska sjukdomar. Vi ser för att förfalska anslutningen mellan lncRNAs och dessa sjukdomar. lncRNAs i sammanhanget av rheumatologic sjukdomar och den autoimmune sjukdomen återstår i allmänhet i dess spädbarnsålder. Vi är mycket upphetsada att vara bland första som kartlägger detta område av biologi.

IQUITY bearbetar infographic

Är Vad IQuitys vision?

Vi strävar för att vara en partner med sjukvårdfamiljeförsörjare, genom att ge dem, tar fram till information till och med vårt analytiskt att närma sig att de inte har haft upp, tills detta pekar. Vi planerar för att fortsätta vår forskning, och utvecklingsförsök att komma med extra testar för att marknadsföra. Vi önskar att familjeförsörjare ska ha det bäst bearbetar möjlighet, så att de kan bäst fest dessa utmana sjukdomar.

Gör Vad dig funderare som framtiden rymmer för tålmodig med autoimmune sjukdomar?

Bättre diagnostik bearbetar förbundna med bättre behandlingar såväl som sjukdomledningstrategier, som bör leda för att förbättra resultat.

På IQuity har vi också aktivt beskådat utvecklingen av en bearbeta som kunde vara van vid mäter sjukdomaktivitet och spårar arrangerar av sjukdom i tålmodig.

Även Om vi inte är ettkonsument företag, har vi konsumenten i vårt varar besvärad, och det huvudsakligt fokuserar av vårt arbete är tålmodina som drabbas med dessa autoimmune villkorar. Vi önskar att se långa för tålmodig bly- produktiva liv. Vi gör alla som vi kan beväpna deras familjeförsörjare med information, så att de kan mildra de skadlig följderna av den autoimmune sjukdomen för den kroniska illnessesnågot liknande.

Var kan avläsare finna mer information?

Vår website är IQuity.com.

Om Dr. Jaga Spurlock

Jakt SpurlockDr.en som Jakt Spurlock begås till översättning av grundläggande vetenskapsupptäckter in i förbättrade diagnostiska strategier för tålmodig med autoimmune, villkorar. Som VD av IQuity har han dagliga aspekter för förbiseendet allra av företaget se till att visionen och beskickningen realiseras.

Undersöker undersöker publicerat arbete för Dr. Spurlocks den molekylära basen för autoimmune sjukdom och vidare terapeutiskt uppsätta som mål i ledningen av dessa sjukdomar som utnyttjar en olik uppsättning av genomic, och biochemical att närma sig inklusive teknologier för genuttrycks- och nästa generationordnande i viss följd.

Dr. Spurlock är en Beta Kappakandidat för Phi av Universitetar av Söderna, var han mottog hans kandidatexamen i biologi, magnaen cum laude, med avdelnings- heder. Han tjänade hans Ph.D. i microbiology, och immunologi från den Vanderbilt Universitetar Skolar av Medicin, var han tilldelades den Sidney P. Colowick utmärkelsen för utstående forskning.