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O estudo novo usa a única pilha 3' da genómica 10x' solução para desembaraçar o mecanismo da auto-renovação da célula estaminal

10x genómica, uma empresa centrada sobre a possibilidade do domínio da biologia acelerando a descoberta genomic, publicação hoje anunciada de um artigo na natureza do jornal de um estudo colaborador da pesquisa com os pesquisadores na Faculdade de Medicina da Universidade de Stanford. O artigo autorizado, a “Não-equivalência de ligantes de Wnt e de R-spondin durante a auto-renovação+ intestinal da célula estaminal Lgr5,” utilizam a única pilha 3' das genómica 10x solução para a único-pilha RNA-segs. (scRNA-segs.) para desembaraçar os mecanismos da escorva e da auto-renovação de células estaminais intestinais (ISCs).

A renovação e a diferenciação de Lgr5+ ISCs são críticas à regeneração contínua do forro epitelial do intestino, que nos permite de absorver nutrientes e o fornece uma barreira para nos proteger do ambiente externo. Os rompimentos neste processo podem conduzir a ou agravar desordens intestinais humanas tais como a doença de entranhas inflamatório (IBD), o cancro gastrintestinal e a doença celíaca.

Este processo com cuidado regulado ocorre dentro de uma ameia da célula estaminal chamada a cripta intestinal, e depende da sinalização de Wnt, que pode ser girada acima por ligantes de Wnt e de R-spondin (RSPO). Os autores procuraram identificar os papéis funcionais originais de Wnt e de ligantes de RSPO para regular Lgr5+ ISCs e as contribuições relativas de ligantes in vivo à sinalização de Wnt e à biologia de célula estaminal.

Os autores podiam mostrar usando in vivo experiências que Wnt e RSPO não são sinais redundantes. RSPO foi mostrado para expandir o número da célula estaminal. Embora Wnt fosse necessário manter Lgr5+ ISCs na presença de RSPO, Wnt não era suficiente para induzir números adicionais de Lgr5+ ISCs acima de um determinado ponto inicial, demonstrando esse RSPO, e não Wnt, estabelece o ponto ajustado para o número+ do ISC Lgr5. Os autores executaram a único-pilha RNA-segs. para mostrar definitiva que as contribuições da sinalização de Wnt e de RSPO induziram efeitos distintos em ISCs, inteiramente caracterizando o perfil da expressão para cada subtipo celular original em uma base da pilha-por-pilha em cima da perturbação daqueles sinais in vivo.

Caracterizando a expressão genética de 13.102 únicas pilhas, Yan e os colegas podiam mostrar que as pilhas- do controle Lgr5 representadas diferenciaram os tipos da pilha das linhagens intestinais pequenas, incluindo Paneth, cálice, enteroendocrine, enterocyte, pre-enterocyte, e pilhas do topete. As pilhas+ Lgr5 consistiram em três subpopulações celulares, correspondendo às células estaminais de ciclagem, às células estaminais do não-ciclismo, e às pilhas de amplificação do trânsito. Os autores podiam mostrar mais que estas três subpopulações distintas das pilhas+ Lgr5 eram cada excepcionalmente afetadas por perturbação em Wnt e em sinalização de RSPO, demonstrando conclusiva que Wnts é os factores de escorva que permitem células estaminais de ser competentes expressando os receptors de RSPO em sua superfície da pilha, visto que RSPOs é os factores reais da auto-renovação que expandem o número da célula estaminal.

da “a análise Único-pilha forneceu a prova concludente para os papéis originais de Wnt e de RSPO que sinalizam a sua função respectiva, ou as pilhas Lgr5 cooperativa+ aprontando para a competência, ou para a auto-renovação RSPO-negociada,” disse Grace Zheng, Ph.D., cientista da pesquisa na genómica 10x. “Isto ilustra poderosa o serviço público da único-pilha RNA-segs. para monitorar estados discretos da célula estaminal e sua perturbação dinâmica. Para fazer isto com toda a outra tecnologia seria extremamente incómodo, se não impossível.”

“Nós somos muito entusiasmado sobre este resultado, e abre a possibilidade que o regulamento multi-estratificado análogo por factores aprontar e de auto-renovação pode ser uma propriedade generalizada das células estaminais através de outros sistemas do órgão, com Wnt e RSPO ou componentes funcional equivalentes da ameia da célula estaminal,” disse Ben Hindson, Ph.D., presidente, co-fundador, e oficial científico principal da genómica 10x. “Isto podia ter implicações de grande porte para a pesquisa da célula estaminal e potencial render a introspecção nova para aplicações terapêuticas no futuro.”

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