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El nuevo estudio utiliza célula 3' de la genómica 10x la' solución para desenredar el mecanismo de la uno mismo-renovación de la célula madre

10x genómica, una compañía centrada en habilitar la maestría de la biología acelerando el descubrimiento genomic, publicación hoy anunciada de un artículo en la naturaleza del gorrón de un estudio colaborativo de la investigación con los investigadores en la Facultad de Medicina de la Universidad de Stanford. El artículo titulado, la “operación de no equivalencia de los ligands de Wnt y de R-spondin durante la uno mismo-renovación+ intestinal de la célula madre Lgr5,” utiliza la célula 3' de las genómicas 10x solución para ARN-seq unicelular (scRNA-seq) para desenredar los mecanismos del cebo y de la uno mismo-renovación de células madres intestinales (ISCs).

La renovación y la diferenciación de Lgr5+ ISCs es críticas a la regeneración contínua del guarnición epitelial de la tripa, que nos permite absorber los alimentos y ofrece una barrera para protegernos contra el ambiente externo. Las desorganizaciones en este proceso pueden llevar a o empeorar desordenes intestinales humanos tales como síndrome del intestino irritable (IBD), cáncer gastrointestinal y enfermedad celiaca.

Este proceso cuidadosamente regulado ocurre dentro de un lugar de la célula madre llamado la cripta intestinal, y depende de la transmisión de señales de Wnt, que se puede girar hacia arriba por los ligands de Wnt y de R-spondin (RSPO). Los autores intentaron determinar el papeles funcional única de Wnt y de los ligands de RSPO para regular Lgr5+ ISCs y las contribuciones relativas de ligands in vivo a la transmisión de señales de Wnt y a la biología de célula madre.

Los autores podían mostrar usando in vivo experimentos que Wnt y RSPO no son señales redundantes. RSPO fue mostrado para desplegar número de la célula madre. Aunque Wnt fuera necesario mantener Lgr5+ ISCs en presencia de RSPO, Wnt no era suficiente inducir números adicionales de Lgr5+ ISCs encima de cierto umbral, demostrando ese RSPO, y no Wnt, establece el punto de ajuste para el número+ del ISC Lgr5. Los autores realizaron ARN-seq unicelular para mostrar definitivo que las contribuciones de la transmisión de señales de Wnt y de RSPO sacaron efectos distintos sobre ISCs, completo caracterizando el perfil de la expresión para cada subtipo celular único sobre una base de la célula-por-célula sobre la perturbación de esas señales in vivo.

Caracterizando la expresión génica a partir de 13.102 células, Yan y los colegas podían mostrar que las células- del mando Lgr5 representadas distinguieron los tipos de la célula de los pequeños linajes intestinales, incluyendo Paneth, el cubilete, el enteroendocrine, el enterocyte, el pre-enterocyte, y células del penacho. Las células+ Lgr5 consistieron en tres subpoblaciones celulares, correspondiente a las células madres de ciclaje, a las células madres de no-ciclaje, y a las células que amplificaban del tránsito. Los autores podían mostrar más lejos que estas tres subpoblaciones distintas de las células+ Lgr5 eran cada únicamente afectadas por perturbaciones en Wnt y la transmisión de señales de RSPO, demostrando concluyente que Wnts es los factores de cebo que permiten a las células madres ser competentes expresando los receptores de RSPO en su superficie de la célula, mientras que RSPOs es los factores reales de la uno mismo-renovación que despliegan número de la célula madre.

El “análisis unicelular proporcionó la prueba concluyente para el papeles única de Wnt y de RSPO que hacían señales a su función respectiva, o las células cooperativamente que preparaban+ Lgr5 para la capacidad, o para la uno mismo-renovación RSPO-mediada,” dijo la tolerancia Zheng, Ph.D., científico de la investigación en la genómica 10x. “Esto potente ilustra la utilidad de ARN-seq unicelular para vigilar estados discretos de la célula madre y su perturbación dinámica. Para hacer esto con cualquier otra tecnología habría sido extremadamente incómodo, si no imposible.”

“Somos muy emocionados sobre este resultado, y abre la posibilidad que la regla multi-con gradas análoga por factores el preparar y de la uno mismo-renovación puede ser una propiedad generalizada de células madres a través de otros sistemas del órgano, con Wnt y RSPO o los componentes funcionalmente equivalentes del lugar de la célula madre,” dijo a Ben Hindson, Ph.D., presidente, cofundador, y principal oficial científico de la genómica 10x. “Esto podía tener implicaciones de gran envergadura para la investigación de la célula madre y potencialmente rendir nuevo discernimiento hacia usos terapéuticos en el futuro.”

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