L'ordonnancement génétique indique comment propagation des virus de Zika en Amériques

Analyse génétique des échantillons rassemblés comme virus de Zika (ZIKV) écarté dans l'ensemble des Amériques après que son introduction en 2013 ou 2014 ait prouvé que le virus a diffusé non détecté pendant jusqu'à une année dans quelques régions avant qu'il soit venu à l'attention des autorités de la santé publiques. L'ordonnancement génétique a également permis à des scientifiques de recréer l'épidémiologique et les circuits évolutionnaires que le virus a pris pendant qu'il écartait et coupait en sous-types distincts--ou clades--cela ont été trouvés en Amériques. La recherche, publiée en nature aujourd'hui, a été supportée en partie par l'institut national de l'allergie et des maladies infectieuses (NIAID), une partie des instituts de la santé nationaux.

Les chercheurs ont reconstruit la dispersion de Zika en ordonnançant le matériel génétique de ZIKV rassemblé des centaines de patients dans dix pays et territoires. Ils ont éventuellement amassé une base de données de 110 complets ou de génomes partiels de ZIKV--la plus grande collection jusqu'à présent--ce qu'ils ont analysé avec 64 publiés et génomes publiquement partagés.

Basé sur des modifications au génome viral qu'accumulé pendant que la maladie déménageait par les populations neuves, les chercheurs ont conclu que ZIKV a écarté rapidement sur son introduction initiale au Brésil, vraisemblablement un jour ou l'autre en 2013. Plus tard, à plusieurs remarques dans première moitié 2015, le virus a séparé dans au moins trois clades--groupes génétiques distincts dont les membres partagent un ancêtre courant--en Colombie, le Honduras, et le Porto Rico, ainsi qu'un quatrième type ont trouvé dans les parties des Caraïbe et des États-Unis continentaux.

Les chercheurs avaient l'habitude des approches de ordonnancement novatrices pour surmonter le défi de fonctionner avec des échantillons pas initialement destinés à l'ordonnancement génétique viral. Dans de futures manifestations, les chercheurs proposent, des échantillons appropriés pour l'ordonnancement génétique devraient être rassemblés du début pour effectuer l'analyse rétrospective et en simultané beaucoup plus facile et plus précise.

Ces résultats peuvent également avoir un choc direct sur la santé publique, comme compréhension claire des altérations génétiques aux agents pathogènes qui peuvent se produire pendant des manifestations apparaissantes seront principaux au contrôle de la maladie et au développement de avis des tests diagnostique. De même, l'analyse génétique et le partage immédiat dans les bases de données publiques peuvent améliorer la compréhension de la dynamique de la propagation de maladie, de sorte que les autorités de la santé publiques puissent mettre en application les meilleures stratégies de contrôle et de prévention.