Arranjar em seqüência genético revela como o vírus de Zika espalhou nos Americas

Análise genética das amostras recolhidas como o vírus de Zika (ZIKV) espalhado durante todo os Americas depois que sua introdução em 2013 ou 2014 mostraram que o vírus circulou indetectado por até um ano em algumas regiões antes que vier à atenção de autoridades responsáveis pela saúde pública. Arranjar em seqüência genético igualmente permitiu cientistas de recrear o epidemiológico e trajectos que evolucionários o vírus tomou enquanto espalhou e rachou nos subtipos distintos--ou clades--isso foi detectado nos Americas. A pesquisa, publicada na natureza hoje, foi apoiada na parte pelo instituto nacional da alergia e das doenças infecciosas (NIAID), parte dos institutos de saúde nacionais.

Os pesquisadores reconstruíram a dispersão de Zika arranjando em seqüência o material genético de ZIKV recolhido das centenas de pacientes em dez países e territórios. Acumularam eventualmente uma base de dados de 110 completos ou de genomas parciais de ZIKV--a coleção a maior até agora--qual analisaram junto com 64 publicados e genomas publicamente compartilhados.

Baseado em mudanças ao genoma viral que acumulou enquanto a doença se moveu através das populações novas, os pesquisadores concluíram que ZIKV espalhou ràpida em cima de sua introdução inicial em Brasil, provavelmente algum dia em 2013. Mais tarde, em diversos pontos em 2015 início a meados, o vírus separou pelo menos em três clades--grupos genéticos distintos cujos os membros compartilham de um antepassado comum--em Colômbia, as Honduras, e Porto Rico, assim como um quarto tipo encontraram nas partes das Caraíbas e dos Estados Unidos continentais.

Os pesquisadores usaram aproximações arranjando em seqüência inovativas para superar o desafio do trabalho com as amostras pretendidas não originalmente para arranjar em seqüência genético viral. Nas manifestações futuras, os pesquisadores sugerem, as amostras apropriadas para arranjar em seqüência genético devem ser recolhidas desde o início para fazer a análise retrospectiva e simultânea muito mais fácil e mais exacta.

Estes resultados igualmente podem ter um impacto directo na saúde pública, como uma compreensão clara das mudanças genéticas aos micróbios patogénicos que podem ocorrer durante manifestações emergentes serão chaves à fiscalização da doença e à revelação de informação de testes de diagnóstico. Similarmente, a análise genética e o alerta que compartilham em público de bases de dados podem aumentar a compreensão da dinâmica da propagação da doença, de modo que as autoridades responsáveis pela saúde pública possam executar as estratégias melhores possível do controle e da prevenção.