L'approche de ordonnancement génomique neuve a pu être première étape vers des prises de sang pour le dépistage du cancer tôt

« Nous continuons à voir des états prometteurs au sujet des utilisations possibles de diffuser l'analyse de l'ADN de tumeur. Tandis que cette approche a des voies d'aller avant que ce devienne une technologie prouvée pour le dépistage du cancer tôt, cette recherche est une étape importante dans ce sens, » a dit l'expert en matière John Heymach, DM, PhD d'ASCO.

Dans une étude de 124 patients avec le sein avancé, le poumon, et les cancers de la prostate, une approche de ordonnancement génomique neuve et à haute intensité ont trouvé la tumeur de diffusion ADN à un haut débit. Dans 89% de patients, au moins une altération génétique trouvée dans la tumeur a été également trouvée dans le sang. De façon générale, 627 altérations génétiques (de 73%) trouvées dans des échantillons de tumeur ont été également trouvées dans les prises de sang avec cette approche.

L'étude sera décrite dans une conférence de presse aujourd'hui et présentée à la société de 2017 Américains de la rencontre annuelle clinique (ASCO) d'oncologie.

Cette approche novatrice - utilisant l'ordonnancement à haute intensité pour trouver le cancer de la tumeur de diffusion ADN dans la circulation sanguine - hérauts le développement de futurs tests pour le dépistage du cancer tôt.

L'approche de ordonnancement à haute intensité utilisée dans cette étude a une combinaison unique de largeur et de profondeur. Elle balaye très une zone large du génome (508 gènes et plus de deux millions de paires de bases ou de lettres du génome, c.-à-d. A, T, C, et G) avec de grande précision (chaque région du génome est ordonnancée ou « affichée » 60.000 fois), fournissant à environ 100 fois plus de caractéristiques que l'autre ordonnancement s'approche. Cette énorme quantité de caractéristiques sera instrumentale en développant une prise de sang pour trouver le cancer tôt.

Cette approche, cependant, diffère des biopsies liquides, y compris les tests commerciaux, qui profilent seulement relativement une petite partie du génome dans les patients déjà diagnostiqués avec le cancer afin du moniteur de aide la maladie ou trouvent l'altération recevable qui peut être appariée aux médicaments procurables ou aux tests cliniques.

« Nos découvertes prouvent que l'ordonnancement de diffusion à haute intensité de la tumeur ADN est possible et peut fournir des informations inestimables pour la prise de décision clinique, potentiellement sans tout besoin d'échantillons de tissu tumoral, » a dit l'étude de fil Pedram Razavi auteur, DM, PhD, un oncologiste médical et instructeur en médicament au centre de lutte contre le cancer commémoratif de Sloan Kettering (MSK) à New York, NY. « Cette étude est également une étape importante en cours de prises de sang se développantes pour le dépistage précoce du cancer. »

La tumeur de diffusion ADN est un terme employé pour décrire les morceaux matériel génétique minuscules que les cellules cancéreuses mourantes jettent dans la circulation sanguine. Pour produire une illustration de l'horizontal génomique entier de la tumeur de la tumeur de diffusion ADN, les scientifiques « affichent » chaque éclat minuscule et puis les rapiècent ensemble comme puzzle. Dans la circulation sanguine, la tumeur de diffusion ADN est seulement un petit sous-ensemble de tout le ADN sans cellule, car la plupart des éclats de diffusion de matériel génétique viennent des cellules normales.

Au sujet de l'étude
Les chercheurs ont à titre estimatif rassemblé le sang et des prélèvements de tissu de 161 patients présentant le cancer du sein métastatique, le cancer de poumon de non-petit-cellule (NSCLC), ou le cancer de la prostate castration-résistant. Trente-sept patients étaient dus exclu à l'indisponibilité des résultats de l'analyse génétique de la tumeur ou des échantillons sans cellule d'ADN. Pour 124 patients evaluable pour l'analyse de concordance, altérations génétiques comparées de chercheurs dans les tumeurs à ceux dans la tumeur de diffusion ADN des prises de sang.

Des tissus tumoraux se sont analysés utilisant MSK-IMPACT™, des tests diagnostique de 410 gènes qui fournissent des informations génétiques détaillées au sujet du cancer d'un patient. Dans chaque prise de sang, les chercheurs ont séparé le plasma, la partie liquide du sang, des globules sanguins. L'ADN sans cellule extrait du plasma et, séparé, le génome des globules blancs ont été alors ordonnancés utilisant l'à haute intensité, le gène 508 ordonnançant l'analyse.

La « conclusion de la tumeur ADN dans le sang est comme rechercher un pointeau dans une meule de foin. Pour chaque 100 fragments d'ADN, seulement un peut venir de la tumeur, et le reste peut venir des cellules normales, principalement des cellules de moelle osseuse, » a dit M. Razavi. « Notre analyse combinée d'ADN sans cellule et de globule blanc ADN tient compte de l'identification de la tumeur ADN avec une sensibilité beaucoup plus élevée, et profondément l'ordonnancement également nous aide à trouver ces fragments d'ADN rares de tumeur. »

Les tumeurs des patients peuvent avoir les altérations génétiques variées ; il peut y avoir différents changements dans différentes parties de la même tumeur, ainsi que de différents sites où la tumeur s'étend dans le fuselage. Pour ces raisons, l'ordonnancement au-dessus des régions très grandes du génome est en critique important pour recenser la multitude et la diversité des altérations génétiques dans la tumeur.

Recherches de clés
Dans 89% de patients, au moins une altération génétique trouvée dans la tumeur a été également trouvée dans le sang (97% dans des patients de cancer du sein métastatique, 85% dans ceux avec NSCLC, et 84% dans ceux avec le cancer métastatique de la prostate). De façon générale, y compris toutes les variations génomiques actuelles dans les la plupart sinon toutes les cellules tumorales (clonales) ainsi que participants seulement dans les sous-ensembles des cellules cancéreuses (subclonal) du tissu tumoral, les chercheurs ont trouvé un total de 864 altérations génétiques dans les prélèvements de tissu en travers des trois types de tumeur, et 627 (73%) de ceux ont été également trouvés dans le sang.

D'une manière primordiale, sans n'importe quelle connaissance préalable de l'analyse du tissu tumoral, 76% de mutations « recevables » (altérations génétiques qui peuvent être appariées à un traitement ou visé approuvé étant vérifié dans les tests cliniques) trouvées en tissu ont été également trouvés dans le sang.
« La recherche antérieure dans le domaine s'est principalement concentrée sur employer la connaissance du tissu tumoral ordonnançant pour recenser les modifications spécifiques pour rechercher dans la tumeur de diffusion ADN. Cette approche nous permet de trouver, avec la confiance élevée, des changements de la tumeur de diffusion ADN en travers d'une grande partie du génome sans information de tissu tumoral, » a dit M. Razavi. Tandis que les tests ADN de diffusion de tumeur visant un plus petit ensemble de gènes de cancer sont déjà procurables pour l'usage dans la pratique courante de guider des soins, en couvrant un numéro beaucoup plus grand des gènes de cancer, cette approche de ordonnancement à haute intensité peut activer le développement de futurs tests pour le dépistage précoce du cancer.

Prochaines opérations
L'approche de ordonnancement à haute intensité utilisée dans cette étude est une plate-forme de recherches et ne se destine pas pour être disponible dans le commerce aux patients. Pour comprendre le rendement et le potentiel actuels de cette analyse, les chercheurs l'ont vérifié la première fois dans le cancer avancé, un endroit où la tumeur de diffusion ADN a été précédemment caractérisée.

« Cette étude avisera le développement de la technologie pour un futur test qui pourrait éventuellement être employé comme prise de sang pour le dépistage du cancer tôt. Dans les patients subissant le dépistage du cancer, le tissu tumoral n'est pas procurable, et nous devrons trouver des changements de la tumeur de diffusion ADN sans connaissance préalable des résultats d'analyse de tissu, » a dit M. Razavi.

Avantages de biopsie liquide
Les modifications génomiques peuvent différer entre les endroits variés dans une tumeur, ainsi que parmi les différents organes où le cancer a écarté. Un test ADN de diffusion de tumeur fournit « un procès-verbal » de tous les changements génomiques de la tumeur et des métastases primaires. En revanche, une biopsie de tissu, qui prend type seulement un petit morceau de tumeur, manque parfois les altérations génétiques principales qui alimentent l'accroissement de cancer.

Un autre avantage de biopsie liquide est sa capacité de capter les changements génomiques du temps réel, aidant la planification de demande de règlement de guide sans besoin des biopsies conventionnelles complémentaires de tissu. Les modifications génomiques évoluent pendant que le cancer se développe et écarte. Les modifications neuves peuvent mener à la récidive de cancer ou à la résistance à la demande de règlement. Un test liquide de biopsie exige seulement une attraction simple de sang. Il est généralement sûr et pratique de répéter, permettant à des médecins de garder la trace plus facile des mutations neuves.