A aproximação arranjando em seqüência genomic nova podia ser primeira etapa para análises de sangue para a detecção de cancro adiantada

“Nós continuamos a ver relatórios prometedores sobre usos possíveis de circular a análise do ADN do tumor. Quando esta aproximação tiver maneiras de ir antes que se transforme uma tecnologia provada para a detecção de cancro adiantada, esta pesquisa é uma etapa importante nesse sentido,” disse o perito John Heymach de ASCO, DM, PhD.

Em um estudo de 124 pacientes com peito avançado, o pulmão, e os cancros da próstata, uma nova, aproximação arranjando em seqüência genomic da alta intensidade detectaram o ADN de circulação do tumor em uma taxa alta. Em 89% dos pacientes, pelo menos uma mudança genética detectada no tumor foi detectada igualmente no sangue. Totais, 627 (73%) mudanças genéticas encontradas em amostras do tumor foram encontradas igualmente em amostras de sangue com esta aproximação.

O estudo será caracterizado em uma roda de imprensa hoje e apresentado na sociedade de 2017 americanos da reunião anual (ASCO) da oncologia clínica.

Esta aproximação inovativa - usando a alta intensidade que arranja em seqüência para detectar o cancro do ADN de circulação do tumor na circulação sanguínea - arautos a revelação dos testes futuros para a detecção de cancro adiantada.

A alta intensidade que arranja em seqüência a aproximação usada neste estudo tem uma combinação original de largura e de profundidade. Faz a varredura de uma área muito larga do genoma (508 genes e mais de dois milhão pares ou letras baixas do genoma, isto é. A, T, C, e G) com a precisão alta (cada região do genoma é arranjada em seqüência ou “lida” 60.000 vezes), rendendo a aproximadamente 100 vezes mais dados do que outro arranjar em seqüência aproxima-se. Esta quantidade enorme de dados será instrumental em desenvolver uma análise de sangue para detectar cedo o cancro.

Esta aproximação, contudo, difere das biópsias líquidas, incluindo os testes comerciais, que perfilam somente uma parcela relativamente pequena do genoma nos pacientes já diagnosticados com cancro com a finalidade do monitor de ajuda a doença ou detectam as alterações accionáveis que podem ser combinadas às drogas disponíveis ou aos ensaios clínicos.

“Nossos resultados mostram que arranjar em seqüência de circulação do ADN do tumor da alta intensidade é possível e pode fornecer a informação inestimável para a tomada de decisão clínica, potencial sem alguma necessidade para amostras de tecido do tumor,” disse o estudo Pedram Razavi autor, DM, PhD, um oncologista médico e instrutor do chumbo na medicina no centro memorável do cancro de Sloan Kettering (MSK) em New York, NY. “Este estudo é igualmente uma etapa importante em processo das análises de sangue tornando-se para a detecção atempada de cancro.”

O ADN de circulação do tumor é um termo usado para descrever as partes minúsculas de material genético que as células cancerosas de morte derramam na circulação sanguínea. Para criar uma imagem da paisagem genomic inteira do tumor do ADN de circulação do tumor, os cientistas “lêem” cada fragmento minúsculo e remendam-nos então junto como um enigma. Na circulação sanguínea, o ADN de circulação do tumor é somente um subconjunto pequeno do ADN sem célula total, porque a maioria de fragmentos de circulação do material genético vêm das pilhas normais.

Sobre o estudo
Os pesquisadores recolheram em perspectiva o sangue e as amostras de tecido de 161 pacientes com cancro da mama metastático, câncer pulmonar da não-pequeno-pilha (NSCLC), ou cancro da próstata castração-resistente. Trinta e sete pacientes eram excluído devido à indisponibilidade dos resultados da análise genética do tumor ou das amostras sem célula do ADN. Para 124 pacientes evaluable para a análise da concordância, os pesquisadores compararam mudanças genéticas nos tumores àquelas no ADN de circulação do tumor das amostras de sangue.

Os tecidos do tumor foram analisados usando MSK-IMPACT™, um teste de diagnóstico de 410 genes que fornecesse informação genética detalhada sobre o cancro de um paciente. Em cada amostra de sangue, os pesquisadores separaram o plasma, a parte líquida do sangue, dos glóbulos. O ADN sem célula extraído do plasma e, separada, o genoma dos glóbulos brancos foram arranjados em seqüência então usando a alta intensidade, gene 508 que arranja em seqüência o ensaio.

“Encontrar o ADN do tumor no sangue é como a procura de uma agulha em um monte de feno. Para cada 100 fragmentos do ADN, somente um pode vir do tumor, e o resto pode vir das pilhas normais, principalmente pilhas da medula,” disse o Dr. Razavi. “Nossa análise combinada do ADN sem célula e do ADN branco do glóbulo permite a identificação do ADN do tumor com sensibilidade muito mais alta, e profundamente arranjar em seqüência igualmente ajuda-nos a encontrar aqueles fragmentos raros do ADN do tumor.”

Os tumores dos pacientes podem ter várias mudanças genéticas; pode haver umas mudanças diferentes em partes diferentes do mesmo tumor, assim como nos locais diferentes onde o tumor espalha no corpo. Por estas razões, arranjar em seqüência sobre regiões muito largas do genoma é criticamente importante identificar a multidão e a diversidade de mudanças genéticas no tumor.

Resultados chaves
Em 89% dos pacientes, pelo menos uma mudança genética detectada no tumor foi detectada igualmente no sangue (97% em pacientes de cancro da mama metastáticos, 85% naqueles com NSCLC, e 84% naqueles com cancro da próstata metastático). Totais, incluindo todas as variações genomic actuais na maioria se não todas as pilhas do tumor (clonal) assim como presentes somente nos subconjuntos das células cancerosas (subclonal) do tecido do tumor, os pesquisadores detectaram um total de 864 mudanças genéticas em amostras de tecido através dos três tipos do tumor, e 627 (73%) daqueles foram encontradas igualmente no sangue.

Importante, sem nenhum conhecimento prévio da análise do tecido do tumor, 76% das mutações “accionáveis” (mudanças genéticas que podem ser combinadas a uma terapia ou a uma visada aprovada que estão sendo testadas nos ensaios clínicos) detectadas no tecido foram detectadas igualmente no sangue.
“A pesquisa prévia no campo centrou-se primeiramente sobre a utilização do conhecimento do tecido do tumor que arranja em seqüência para identificar mudanças específicas para procurar no ADN de circulação do tumor. Esta aproximação permite que nós detectem, com confiança alta, mudanças no ADN de circulação do tumor através de uma grande parte do genoma sem informação do tecido do tumor,” disse o Dr. Razavi. Quando o ADN de circulação do tumor testar a escolha de objectivos de um grupo menor de genes do cancro está já disponível para o uso na prática rotineira guiar o cuidado, cobrindo um número muito maior de genes do cancro, esta alta intensidade que arranja em seqüência a aproximação pode permitir a revelação dos testes futuros para a detecção atempada de cancro.

Passos seguintes
A alta intensidade que arranja em seqüência a aproximação usada neste estudo é uma plataforma da pesquisa e não é pretendida ser disponível no comércio aos pacientes. Para compreender o desempenho e o potencial actuais deste ensaio, os pesquisadores testaram-no primeiramente no cancro avançado, uma área onde o ADN de circulação do tumor tem sido caracterizado previamente.

“Este estudo informará a revelação da tecnologia para um teste futuro que poderia eventualmente ser usado como uma análise de sangue para a detecção de cancro adiantada. Nos pacientes que submetem-se à despistagem do cancro, o tecido do tumor não está disponível, e nós precisaremos de detectar mudanças no ADN de circulação do tumor sem conhecimento prévio de resultados da análise do tecido,” disse o Dr. Razavi.

Vantagens da biópsia líquida
As mudanças Genomic podem diferir entre várias áreas dentro de um tumor, assim como entre os órgãos diferentes onde o cancro espalhou. Um teste de circulação do ADN do tumor fornece “um relatório sumário” de todas as mudanças genomic no tumor e nas metástases preliminares. Ao contrário, uma biópsia do tecido, que tome tipicamente somente uma parte pequena do tumor, falta às vezes as mudanças genéticas chaves que abastecem o crescimento do cancro.

Uma outra vantagem da biópsia líquida é sua capacidade para capturar mudanças genomic no tempo real, ajudando o planeamento de tratamento do guia sem a necessidade de biópsias convencionais adicionais do tecido. As mudanças Genomic evoluem enquanto o cancro cresce e espalha. As mudanças novas podem conduzir ao retorno ou à resistência do cancro ao tratamento. Um teste líquido da biópsia exige somente uma tracção simples do sangue. É geralmente seguro e conveniente repetir, permitindo que os doutores mantenham uma trilha mais fácil de mutações novas.