La nueva aproximación de secuencia genomic podía ser primer paso hacia los análisis de sangre para la detección de cáncer temprana

“Continuamos ver partes prometedores sobre aplicaciones posibles de circular análisis de la DNA del tumor. Mientras que esta aproximación tiene maneras de ir antes de que se convierta en una tecnología probada para la detección de cáncer temprana, esta investigación es un paso importante en esa dirección,” dijo al experto Juan Heymach, Doctor en Medicina, doctorado de ASCO.

En un estudio de 124 pacientes con el pecho avanzado, el pulmón, y los cánceres de próstata, una nueva, de alta intensidad aproximación de secuencia genomic descubrieron la DNA de circulación del tumor a una alta tasa. En el 89% de pacientes, por lo menos un cambio genético descubierto en el tumor también fue descubierto en la sangre. Totales, 627 (el 73%) cambios genéticos encontrados en muestras del tumor también fueron encontrados en muestras de sangre con esta aproximación.

El estudio será ofrecido en una rueda de prensa hoy y presentado en la sociedad de 2017 americanos de la reunión anual (ASCO) de la oncología clínica.

Esta aproximación innovadora - usando la secuencia de alta intensidad para descubrir el cáncer de la DNA de circulación del tumor en la circulación sanguínea - precursores el revelado de las pruebas futuras para la detección de cáncer temprana.

La aproximación de secuencia de alta intensidad usada en este estudio tiene una combinación única de la anchura y de la profundidad. Explora un área muy amplia del genoma (508 genes y más de dos millones de pares o cartas bajos del genoma, es decir. A, T, C, y G) con la alta exactitud (cada región del genoma se ordena o “se lee” 60.000 veces), rindiendo a cerca de 100 veces más datos que la otra secuencia se acerca. Este periodo enorme de datos será instrumental en desarrollar un análisis de sangre para descubrir el cáncer temprano.

Esta aproximación, sin embargo, difiere de biopsias líquidas, incluyendo las pruebas comerciales, que perfilan solamente una porción relativamente pequeña del genoma en los pacientes ya diagnosticados con el cáncer con el fin de monitor de ayuda la enfermedad o descubren los cambios procesables que se pueden igualar a las drogas disponibles o a las juicios clínicas.

“Nuestras conclusión muestran que la secuencia de circulación de alta intensidad de la DNA del tumor es posible y puede ofrecer la información inestimable para la toma de decisión clínica, potencialmente sin cualquier necesidad de muestras de tejido del tumor,” dijo el estudio del guía Pedram Razavi autor, el Doctor en Medicina, el doctorado, un oncólogo médico y al instructor en remedio en el centro conmemorativo del cáncer de Sloan Kettering (MSK) en Nueva York, NY. “Este estudio es también un paso importante en curso de análisis de sangre que se convierten para la detección temprana del cáncer.”

La DNA de circulación del tumor es un término usado para describir los pedazos minúsculos de material genético que las células cancerosas de muerte vierten en la circulación de sangre. Para crear un retrato del paisaje genomic entero del tumor de la DNA de circulación del tumor, los científicos “leen” cada fragmento minúsculo y después juntan las piezas de ellas junta como rompecabezas. En la circulación sanguínea, la DNA de circulación del tumor es solamente un pequeño subconjunto de la DNA sin células total, pues la mayoría de los fragmentos de circulación del material genético vienen de las células normales.

Sobre el estudio
Los investigadores cerco anticipado sangre y muestras de tejido a partir de 161 pacientes con el cáncer de pecho metastático, el cáncer de pulmón de la no-pequeño-célula (NSCLC), o el cáncer de próstata castración-resistente. Treinta y siete pacientes eran excluido debido a la indisponibilidad de los resultados del análisis genético del tumor o de las muestras sin células de la DNA. Para 124 pacientes evaluable para el análisis de la concordancia, los investigadores compararon cambios genéticos en los tumores a ésos en la DNA de circulación del tumor de las muestras de sangre.

Los tejidos del tumor eran analizados usando MSK-IMPACT™, una prueba diagnóstica de 410 genes que ofrece la información genética detallada sobre el cáncer de un paciente. En cada muestra de sangre, los investigadores separaron el plasma, la parte líquida de la sangre, de los glóbulos. La DNA sin células extraída del plasma y, por separado, el genoma de los glóbulos blancos entonces fueron ordenados usando el de alta intensidad, gen 508 que ordenaba análisis.

“Encontrar la DNA del tumor en la sangre ser como buscar una aguja en un pajar. Para cada 100 fragmentos de la DNA, solamente uno puede venir del tumor, y el descanso puede venir de las células normales, principal las células de la médula,” dijo al Dr. Razavi. “Nuestro análisis combinado de la DNA sin células y de la DNA blanca del glóbulo permite la identificación de la DNA del tumor con una sensibilidad mucho más alta, y profundamente la secuencia también nos ayuda a encontrar esos fragmentos raros de la DNA del tumor.”

Los tumores de los pacientes pueden tener diversos cambios genéticos; puede haber diversos cambios en diversas partes del mismo tumor, así como en diversos sitios en donde el tumor se extiende en la carrocería. Por estas razones, la secuencia sobre las regiones muy amplias del genoma es crítico importante determinar la multitud y la diversidad de cambios genéticos en el tumor.

Conclusión dominantes
En el 89% de pacientes, por lo menos un cambio genético descubierto en el tumor también fue descubierto en la sangre (el 97% en enfermos de cáncer metastáticos del pecho, el 85% en ésos con NSCLC, y el 84% en ésos con el cáncer de próstata metastático). Totales, incluyendo todas las variaciones genomic presentes en la mayoría si no todas las células del tumor (clónicas) así como los presentes solamente en los subconjuntos de las células cancerosas (subclonal) del tejido del tumor, los investigadores descubrieron un total de 864 cambios genéticos en muestras de tejido a través de los tres tipos del tumor, y 627 (el 73%) de ésos también fueron encontrados en la sangre.

Importantemente, sin ningún conocimiento anterior del análisis del tejido del tumor, los 76% de las mutaciones “procesables” (cambios genéticos que se pueden igualar a una terapia o apuntada aprobada que es probada en juicios clínicas) descubiertas en tejido también fueron descubiertos en sangre.
La “investigación anterior en el campo se ha centrado sobre todo en usar conocimiento del tejido del tumor que ordenaba para determinar cambios específicos para buscar en la DNA de circulación del tumor. Esta aproximación permite que descubramos, con alta confianza, los cambios en la DNA de circulación del tumor a través de una parte grande del genoma sin la información del tejido del tumor,” dijo al Dr. Razavi. Mientras que la DNA de circulación del tumor prueba el alcance de un equipo más pequeño de genes del cáncer está ya disponible para el uso en práctica rutinaria de conducir cuidado, revistiendo un número mucho más grande de genes del cáncer, esta aproximación de secuencia de alta intensidad puede habilitar el revelado de las pruebas futuras para la detección temprana del cáncer.

Pasos siguientes
La aproximación de secuencia de alta intensidad usada en este estudio es una plataforma de la investigación y no se piensa ser disponible en el comercio a los pacientes. Para entender el funcionamiento y el potencial actuales de este análisis, los investigadores primero lo probaron en el cáncer avanzado, un área donde la DNA de circulación del tumor se ha caracterizado previamente.

“Este estudio informará al revelado la tecnología para una prueba futura que se podría utilizar eventual como análisis de sangre para la detección de cáncer temprana. En los pacientes que experimentan la investigación de cáncer, el tejido del tumor no está disponible, y necesitaremos descubrir cambios en la DNA de circulación del tumor sin el conocimiento anterior de los resultados del análisis del tejido,” dijo al Dr. Razavi.

Ventajas de la biopsia líquida
Los cambios Genomic pueden diferir entre las diversas áreas dentro de un tumor, así como entre los diversos órganos donde el cáncer se ha extendido. Una prueba de circulación de la DNA del tumor ofrece “un informe resumido” de todos los cambios genomic en el tumor y las metástasis primarios. En cambio, una biopsia del tejido, que toma típicamente solamente un pequeño pedazo del tumor, falta a veces los cambios genéticos dominantes que aprovisionan de combustible incremento del cáncer.

Otra ventaja de la biopsia líquida es su capacidad de capturar cambios genomic en la formulación de planes de tratamiento en tiempo real, de ayuda de la guía sin la necesidad de las biopsias convencionales adicionales del tejido. Los cambios Genomic se desarrollan mientras que el cáncer crece y se extiende. Los nuevos cambios pueden llevar a la repetición o a la resistencia del cáncer al tratamiento. Una prueba líquida de la biopsia requiere solamente un drenaje simple de la sangre. Es generalmente seguro y conveniente relanzar, permitiendo que los doctores guarden un carril más fácil de nuevas mutaciones.