Neurohistology : combien entier glissez le flux de travail de chocs de lecture

insights from industryDr. Robert SwitzerPresident and Chief Scientific Officerof NeuroScience Associates (NSA)

Une entrevue avec M. Robert Switzer, président et officier scientifique en chef des associés de neurologie (NSA), avant avril Cashin-Garbutt conduit, MAMANS (Cantab)

Pouvez-vous s'il vous plaît donner la visibilité derrière des associés de neurologie (NSA) ?

Accroissant l'avantage de production de masse que la technologie de MultiBrain® porte au neurohistology, le NSA peut accélérer la R&D préclinique et des procédés d'évaluation de sécurité beaucoup pli et les exécuter moins coûteusement. Ceci a comme conséquence des périodes plus rapides pour qu'un médicament potentiel déménage de la R&D aux tests cliniques et plus tôt pour l'usage dans les gens.

Supplémentaire, utilisant certains des mêmes principes, notre grande technologie de propriété industrielle de Format™ nous permet d'inclure et sectionner un hémisphère entier d'esprit humain intact. Ceci accélère non seulement le traitement, mais améliore spectaculairement la visualisation de l'hémisphère entier, contre la pratique courante de voir de petites brames de 1-2cm.

Comment le NSA capable exécuter le neurohistology est-il jusqu'à plus rapidement les méthodes que traditionnelles 40X ?

Le cerveau histologique traditionnel de la partie une de méthodes à la fois utilisant la paraffine a encastré le tissu ou le gel-sectionnement avec des cryostats. Avec la technologie de MultiBrain® nous encastrons les jusqu'à 40 hémisphères de cerveau de souris ou 40 moelles épinières dans une case de gélatine de MultiBrain®. La case gel-est sectionnée avec toutes les parties de coupure rassemblées dans un choix de récipients remplis solution de conserve d'antigène de ` de'.

Les feuilles donnantes droit de `' de parties sont souillées, habituellement le flottement libre de `' (non monté sur des guides pourtant) qui laisse toutes les parties de différents cerveaux contenus dans les feuilles à exposer aux conditions de souillure identiques. C'est extrêmement important en interprétant des différences de souillure en travers de différents cerveaux.

Combien grand est le tissu que vous traitez ?

Un large éventail de tailles de tissu peuvent être facilitées par notre technologie : moelles épinières de souris aux hémisphères d'esprit humain. Naturellement, le seulement un hémisphère d'esprit humain peut être inclus dans une case !  La plupart des grands tissus que nous traitons sont des cerveaux des primates, des crabots, des moutons et des porcs. Les cerveaux plus grands sont importants c'est-à-dire qu'ils imitent plus attentivement l'esprit humain.

Quels sont les défis avec sectionner un tel grand tissu ?

Les défis de sectionner les grands tissus de Format™ ne sont pas comparés significatif à une case des cerveaux de souris ou de rat.  Puisque le tissu est gelé et puis sectionné, il est important que le tissu soit adéquat traité avec le soi-disant cryo de ` protègent les' solutions, qui retardent la taille des cristaux de glace qui forment quand la case du tissu est gelée.

De tels cristaux, si laissé se développer, produiraient de grandes déchirures dans le tissu et ruineraient l'anatomie. Traditionnellement, le sucrose (20-30%) a été employé pour saturer le tissu, mais pendant les 30 dernières années que nous avons employé une solution de glycérol de 20% qui donne des résultats supérieurs.

Que le procédé encastrant multiple concerne-t-il ?

La technologie de MultiBrain® tient compte pour que beaucoup de cerveaux et/ou de moelles épinières soient encastrées dans une case unique de modification de gélatine.  De cette remarque vers l'avant, les tissus restent ensemble pour toutes les procédures de souillure.

Quel choc le balayeur entier de guide de TissueScope LE120 de la pathologie d'Huron Digital a-t-il eu sur votre flux de travail ? Est-ce que quelque chose vous a étonné quand vous avez commencé à balayer ?

L'étendue LE120 de tissu nous a permise de satisfaire une demande croissante des scientifiques pour les images numériques de haute qualité des parties souillées. En hausse jusqu'il y a à quelques années, nous avons seulement fourni les guides souillés des tissus de cerveau ou de moelle épinière. Pendant que la demande se développait pour des images numériques des parties de cerveau et de cordon, la demande de fournir l'analyse d'image a monté en flèche. Naturellement, afin d'exécuter les analyses, des images numériques sont exigées.

Le LE120 nous a permis la puissance de levier MultiBrain® traitant parce que les Software Engineers d'Huron ont conçu les programmes qui pourraient saisir des images de différentes parties de cerveau d'une feuille de MultiBrain® et les grouper.

La pratique commune avec d'autres systèmes de capture d'images sur le marché est de capter le guide de totalité (supportant à 40 spécimens différents) et de le soin laisser à l'usager pour plumer à l'extérieur les différentes images d'échantillon. Ce nécessite la participation humaine qui est coûteuse et longue. Avec le système d'Huron nous continuons à accélérer le procédé d'extraire des caractéristiques les tissus expérimentaux de nos usagers'.

Notre plus grande surprise quand nous avons commencé la première fois à employer le LE120 était comme elle facile était d'employer, particulièrement avec les logements que les Software Engineers ont fourni pour répondre à nos besoins plutôt seuls.

 

Pouvez-vous s'il vous plaît expliquer comment le NSA est impliqué dans la technologie de grand format qui permet le sectionnement de grands cerveaux intacts continuement sans nécessité de subdiviser en brames ou cubes ?

La capacité pour sectionner de grands tissus est régie par les microtomes utilisés pour couper les parties. La plupart des microtomes sont conçus pour le tissu encastré dans des cases de paraffine. Les tissus sont habituellement de petits échantillons ainsi ils sont encastrés dans de petites cases de paraffine. Puisque la plupart des microtomes procurables peuvent seulement case faciliter de ` de timbre-poste taille', des tissus plus grands que celui doivent être subdivisés.

Pour des études de cerveau des animaux plus grands que des rats, une telle subdivision rend l'analyse tout à fait impossible d'évaluer le contexte anatomique d'un plein, intact cerveau.  Les microtomes que nous avons utilisés ont été conçus dans le microtome tôt de 1900s-The AO860 est notre cheval de labour.

Comment Huron aide-t-il en termes de numériser les grands guides de finition ?

Il est évident cela du début de l'évolution d'Huron en concevant les instruments digitaux de saisie que l'image du grand tissu tel qu'un plein esprit humain était leur intention.  Les modèles d'Huron permettent à 1x3 normal » guides d'être chiffré mais peuvent également numériser des guides aussi grands que 6x8 » - une coupe transversale entière d'esprit humain.

Quelle était votre motivation pour déménager à un flux de travail digital et les quels avantages voyez-vous de transitioning à digital ?

Ceci a été pas tellement ` transitioning à digital' car il est de le comprendre en tant qu'élément de notre service envoi-le long de avec analyse d'image. La vitesse et les résultats des outils d'analyse d'image plus neufs sont derrière la majeure partie de la demande dans la numérisation.

Comment traitez-vous un grand nombre de caractéristiques produites de balayer le grand tissu ?

Les tailles de fichier des images numériques énorme-sont mesurées dans les gigas contre des mégaoctets dans les appareils-photo conventionnels de microscope.  Le NSA actuel n'enregistre pas ou ne fournit pas un serveur des images aux usagers. En revanche, nous expédions un disque dur contenant les images saisies au nom de l'usager.  La caractéristique d'image originale captée au NSA est effacée un jour ou l'autre après que l'usager ait reçu le disque dur.

Les grands volumes de fichiers lancent un défi à plusieurs des logiciels en cours qui n'ont pas devenu suivent les capacités neuves de la saisie digitale de plein-partie. Il y a travail-arounds, mais la demande est là ainsi elle devrait s'améliorer dans le proche contrat à terme-nous espèrent !

Enregistrez-vous les fichiers localement ou sur le nuage ?

Des fichiers sont temporairement enregistrés localement. Ils sont envoyés matériel à l'usager.

Les principes de MultiBrain® peuvent-ils être appliqués à un grand choix de types, d'orientations et de numéros de tissu ?

La technologie de MultiBrain® est tout à fait polyvalente et peut faciliter beaucoup de variations sur un thème des orientations et des numéros.  Des types de tissu sont limités par l'intégrité matérielle du tissu dans la condition en coupe. Nous logeons notre service au cerveau et aux moelles épinières.

D'autres tissus, tels que la rate, foie, rein, des ganglions de fond dorsal de temps en temps ont été avec succès traités parce que quand ` fixe' par le formaldéhyde que les parties restent intactes et ne se désagrègent pas comme se produirait avec le thymus, graisse animale, ou le tissu pancréatique, par exemple.

Que pensez-vous les futures prises pour le neurohistology ?

Neurohistology sera toujours nécessaire parce que n'importe ce que l'autre genre in vivo de capacités de représentation peut être développé, on doit toujours, éventuellement, pour examiner pour voir ce qui se produit dans le tissu lui-même.

Quel est prochain sur l'horizon pour le NSA ?

Les capacités d'analyse d'image est le plus grand endroit d'accroissement que je vois.  Pouvoir affecter un certain genre de point d'informations numérique aux structures/aux caractéristiques souillées sur des guides est dans la forte demande.  La gamme des possibilités est presque sans fin parce qu'elle toute descend à ce que le chercheur veut voir ou comparer.

Le prochain endroit lançant le défi important peut extraire la caractéristique qui est produite. C'est où les gens d'informatique trouveront un bon nombre de travail !

Où peuvent les lecteurs trouver plus d'informations ?

Veuillez aller à notre site Web : NSALabs.com et si vous ne pouvez pas trouver ce que vous recherchez là, nous appellent ou svp envoient : [email protected]. Nous apprécions de telles instructions et il nous aide à rester le courant et à être ` en avant de la courbure' en recensant les besoins imprévisibles.

Au sujet de M. Robert Switzer

M. Robert C. Switzer, III a sur trente-cinq ans d'expérience dans le domaine de neurologie. Immédiatement avant de fonder le NSA, il était le directeur du laboratoire de R.H. Cole Neuroscience chez University of Tennessee qui se concentre sur la recherche liée à Parkinson et à maladie d'Alzheimer. M. Switzer a également des positions retenues à l'institut national de la santé mentale et aux laboratoires de recherche animaux comparatifs à Oak Ridge Tennessee.

M. Switzer a écrit plus de quarante manuscrits en tourillons observés par pairs, publiés plus de cinquante abrégés sur scientifiques contact et a contribué à sept livres. De plus, M. Switzer est l'inventeur de la technologie de MultiBrain® du NSA et a été attribué un brevet pour les techniques de coloration argentés employés pour trouver la pathologie de maladie d'Alzheimer.

M. Switzer a reçu un diplôme de l'université de l'Etat d'État du Michigan avec un B.S. dans la physique et l'astronomie et a puis joint le service de biophysique sous M. Barnett Rosenberg aux mécanismes olfactifs de transduction d'étude. Plus tard, l'intrigue de la neuroanatomie comparative l'a attiré au laboratoire de M. John I. Johnson sous qui il a obtenu son M.S. et Ph.D. en biophysique.

En tant que camarade post-doctoral sous la tutelle du jeu rouleau-tambour. Des deOlmos de Lennart Heimer et de Jose à l'université de la Virginie il a appris des techniques de coloration argentés neurohistologic pour recenser des voies neuronales dans le cerveau. Comme un camarade de personnel de NIH, il a évolué l'application de l'argent souillant des méthodes pour trouver particulièrement des effets neurotoxic. Les effets de l'alcool neurotoxic et l'oxygène à haute pression étaient parmi ses premières applications de l'argent souillant des méthodes à cet effet.

Parmi les cotisations « techniques » les plus significatives de M. Switzer's à la neurologie sont l'invention de la technologie® de MultiBrain, la souillure de Campbell-Switzer Alzheimer et également le développement de la première souillure argentée pour des protéines en les 2-D gels. Quelques points culminants de ses cotisations « scientifiques » à la neurologie comprennent des articles publiés sur les effets de l'alcool neurotoxic, un trait neuroanatomical comme discriminateur phylogénique, l'absence des cellules mitrales dans les monotremes, et le lieu des globus pallidus ventraux comme défini par le fer ferrique.

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