新しいアプローチは superbugs がそして医療施設の内でどのようにの中で走行するか追跡できます

キラー細菌 - 私達の最もよい抗生物質を展開させた物 -- すぐ立ち去るかもしれなくないです。 しかし広がりの追跡への新しいアプローチは結局私達に死者数を固定する努力次第で成功できるチャンスを与えることができます。

最も恐れられていた 「superbugs」、および現代遺伝の配列の技術の 1 つの 2008 年の発生からのデータを使用して、チームは正常に模倣し、予測される、有機体がたくさんの医療施設の間でそしての内で広げた方法。

アプローチはことができます - またはかどうかバグが病院、療養所または長期激しい心配の病院の内で広がっている告げる別の機能から転送される新しい患者がそれをそこに持って来たら。

すなわち、 superbugs を戦うことがホラー映画のようなら、アプローチはことができ、呼出しが家の中から来ているかどうか、または告げるドアを通って約押し入るためキラーがの外で潜んでいれば。

そしてちょうどホラー映画にのように、答えを得ることはすぐにどのようなバリケードおよび武器の医療専門家が悪人に対して使用するべきであるか導くことができます。

科学の翻訳の薬で出版されるアプローチは全ゲノムの配列と現在の疫学的なアプローチを - 各々の感染させた患者からの細菌の全体の DNA シーケンスを綴ること結合します。

これは superbug DNA の小さい変更 - 自然に一定時間にわたり起こる突然変異の種類を使用することを可能にします -- 広がりを医療施設内および相互間で追跡するため。

アプローチは防止の中央点プログラム中央政府疾病予防対策センターからの資金調達の衛生学校シカゴそしてミシガン州立大学の突進大学医療センターからのチームによって、開発されました。 チームは上部の米国中西部で carbapenem 抵抗力がある Klebsiella 肺炎の 2008 年の (CRKP)発生のデータを使用しました。

「これらの有機体浸透する領域、しかしそれは詳しく理解されませんでした - 1 つの領域の山火事のようになぜ広がり、別のものの前進をしないかそれがどのように起こるかか」、生物情報学およびシステムズ生物学を専門にしているエバン Snitkin、 Ph.D。、 U-M の助教授を言います。 「これがシカゴ領域の CRKP の最初の発生だったので、私達はサンプルの忍耐強い転送そして全ゲノムの配列に基づいて最初の動きをトレースすることを試みることにしました。 それ以上の広がりを防ぐために領域のどんな駆動機構伝達が、私達介入」。できることを望むか私達が理解してもいければ

時間で

突進の病院は領域の CRKP の第 2 例を識別しました。 病院のチームはインディアナで激しい心配の病院からの転送で救急救命室で患者の後で発生を着きました識別しました。

メリー K. Hayden、 M.D. のまた突進の臨床微生物学の部を指示する感染症医者著導かれ、使用できる最もよい技術を使用して発生の自身の調査、その時に行なわれ、そして出版されるチーム。 彼らはバグが中間2007 の単一の患者から広がった、結局 42 人感染させる 14 軒の激しい心配の病院、 2 LTACHs、および 10 の療養所で扱いましたことを結論を出し。

これらの機能間の患者の転送は - 例えば、 LTACH か看護から短期激しい心配のための病院への、およびそれから再度支持して下さい - ように広がりの主要なドライバー識別されました。 単一 LTACH は伝達のための主ハブとして識別されました。

この発生では、多くの患者は停止しました。 全国的に、 CRKP のための死亡率はより高く、病気のほとんどの傷つきやすい患者に犠牲にしがちです。

古いサンプル、新しい分析

2008 年に、このの全ゲノムの配列は多くのサンプル実行可能ではなかったです。

「その時の私達の研究員が、サラ Won 先生、徹底的な発生の調査を行なったが、 2008 で使用できる分子疫学的なツールは私達がタイミングを定めることを可能にしなかったし、多くのケースのための広がりの方向」、 Hayden を言います。 「私達はより多くの識別力がある技術が将来使用できるという希望の隔離集団を保存しました。 私達は未来が!」着いたときに非常に興奮しました

突進のチームは配列の微生物システムのための U M の中心にサンプルを持って来、置き Hayden のチームが発生について調べたものをとともに Snitkin のチームはゲノムデータを始めました。 これはずっと元の発生のレポートの前に使用できない何かを含んでいました: 「患者ゼロの臨床データ識別し」、 CRKP の伝染が中間2007 に遡った、 Hayden のチームが発生の起源として前に人。

これはチームがトランクのその最初患者に戻って CRKP の発生の 「系譜」を、作成することを可能にしました。 彼らは患者からの患者に広がりをマップし、両方に基づいて機能への機能は、 sleuthwork の Hayden のチーム新しい genomic シーケンス情報し。

彼らはどのケースが機能内の伝達に起因したか見ることができます - 感染させた患者からの細菌が他に達するようにした患者がそれらの中の細菌と既に転送されたのでおよびもたらされた - 方法のために。

それから、彼らはどの機能各患者の CRKP の伝染がから来たか予測することを試みることによってアプローチをテストし、既に扱われた他の患者のゲノムだけ発生 - および後で扱われた患者からの情報のどれもで使用します。

伝染があらゆる患者のためにから来たところ起こるかもしれませんものがに実質の発生で類似したこのリアルタイムの分析正常に機能正確に示される。

「ゲノムシーケンスパスを見つけるために強力ですが、露出についての疫学的なデータおよび機能間の動き持っていることはすべてに意味を成させます」は U-M の衛生学校の微生物学の部の地位の掌握及び免疫学および内科 Snitkin を言います。 「私達は効力が」。変わるけれども私達が他の有機体のこの同じアプローチを、余りに使用できることを想像します、

Hayden を、 「このアプローチ領域の superbug の出現の後で伝達のパスの識別に特に有用すぐにであるかもしれません追加します。 発生先に私達が介入してもいければ、より本当らしいですを含むためにそれは私達はそれを根絶できますこと」。

可能なプロジェクトになされるミシガン州および突進のチームの補足の専門知識彼は付け加えます。 前に進んで、チームは抗生物質抵抗力がある細菌開発および伝達のハブを見つけてもいいかどうか見るために他の設定のアプローチをテストすることを望みます。

それらはまた既に領域にある有機体のための伝達の起源をトレースする機能のためにアプローチをテストします。 これはことができまちょうど領域を入力した最近もたらされたタイプの伝染を追跡しますより大いに堅い。

患者が一定した換気のような病院レベルの心配を受け取る月の間一度に住むかもしれない LTACH の役割はまた更に探索することを望む 1 です。 そのような機能は弱い免疫組織を非常に傷つきやすく、不動の人口に与える心配の種類のために抗生物質抵抗力がある有機体の開発に単に特に傾向があるかもしれません。

結局は、医療施設の公衆衛生局および伝染制御専門家によって研究者の希望が彼らのアプローチ - 広く適応させ、広いネットワークによる伝達を防ぐために発生の介在を非常に早く操縦するのに使用できます。

そのポイントへ得ることは公衆衛生の病気の探偵がようにパブリック・ドメインのソフトウェアの開発が定期的に使用するように、また更にプロセスを自動化することができる要求します。

ソース: http://med.umich.edu/

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