새로운 접근은 superbugs가 그리고 의료 시설 안에 어떻게의 사이에서 여행하는지 추적하을 수 있습니다

살인자 박테리아 - 우리의 최고 항생제를 밖으로 발전한 그들 -- 곧 가버리 일지모른지 않습니다. 그러나 그들의 퍼짐 추적에 새로운 접근은 결국 저희에게 그들의 사망자 수를 억제해 놓는 성공의 기회를 줄 수 있었습니다.

가장 두려워한 "superbugs," 및 현대 유전 연속 기술의 한의 2008년 발발에서 데이터를 사용하여, 팀은 성공적으로 만들고, 예상하는, 유기체에 의하여 다스 의료 시설 사이에서 그리고 안에 퍼진 쪽.

접근은 버그가 병원, 요양소 또는 장기 심각한 배려 병원 안에 퍼지거나 말할 수 있습니다 - 다른 시설로부터 옮겨진 새로운 환자가 그것을 거기 가져오는지지.

즉 superbugs를 싸우는 경우에 공포 영화 같이 이면, 접근은 문을 통해서 대략 느리게 움직이기 위하여 외침이 집 안에서 오거나, 살인자가 이상으로와 잠복하는지지 말할 수 있습니다.

그리고 다만 공포 영화에서 같이, 응답을 얻는 것은 빨리 어떤 종류의 바리케이드와 무기 건강 전문가가 악당에 대하여 사용해야 하는지 인도할 수 있습니다.

과학 번역상 약에서 간행된 접근은 전체 게놈 연속과, 현재 역학 접근을 - 각 감염한 환자에게서 박테리아의 전체 DNA 순서를 밖으로 철자하는 결합합니다.

이것은 superbug DNA에 있는 작은 변경 - 자연적으로 한동안 일어나는 돌연변이의 종류를 이용하게 가능하게 합니다 -- 그들의 퍼짐을 의료 시설 사이사이 추적하기 위하여.

접근은과 예방의 예방 진앙 프로그램 연방 중앙 질병 관리국에서 자금 조달과 더불어 의과 대학 시카고 그리고 미시간 대학에 있는 붐빔 대학 의료 센터에서 팀에 의해, 개발되었습니다. 팀은 위 Midwest에 있는 carbapenem 저항하는 Klebsiella 폐염의 2008년 (CRKP) 발발에 데이터를 사용했습니다.

"왜 1개의 지구에 있는 연소제 같이 퍼지고 또 다른 한개에 있는 전진을 만들지 않는지 방법 그것이 일어나는지 이 유기체 침투 지구, 아니라 상세히 이해되지 않았습니다 -," 생물정보학과 시스템 생물학을 전문화해 Evan Snitkin, Ph.D., U-M 조교수를 말합니다. "이것이 시카고 지구에 있는 CRKP의 첫번째 발발이었기 때문에, 우리는 견본의 참을성 있는 이동 그리고 전체 게놈 연속에 근거를 둔 그것의 처음 운동을 추적하는 것을 시도하는 것을 결정했습니다. 추가 퍼짐을 방지하기 위하여 지구에 있는 무슨 드라이브 전송이, 우리 개입할 수." 있는 것을 희망하는 우리가 이해해서 좋은 경우에

후에 때 맞추어

붐빔의 병원은 지구에 있는 CRKP의 두번째 예를 확인했습니다. 병원 팀은 인디애나에 있는 심각한 배려 병원에서 이동에 있는 그들의 긴급 부에 환자 후에 발발을 도착했습니다 확인했습니다.

메리 K. Hayden, M.D. 의 또한 붐빔의 임상 미생물학의 부를 지시하는 감염증 의사의 지도되고, 유효한 최고 기술을 사용하는 발발의 그것의 자신의 수사이라고, 당시에 수행되고 간행되는 팀. 그(것)들은 버그가 중앙 2007에 있는 단 하나 환자에게서 퍼졌었다는 것을 결론지었습니다, 결국 42명의 사람들이라고 감염하는 14의 심각한 배려 병원, 2 LTACHs, 그리고 10의 요양소에서 취급했습니다.

이 기능 중 환자의 이동은 - 예를 들면, LTACH 또는 간호에서 단기적인 심각한 배려를 위한 병원에, 및 그 때 다시 역행시키십시오 - 퍼짐의 중요한 운전사 확인되었습니다. 단 하나 LTACH는 전송을 위한 중요한 허브로 확인되었습니다.

이 발발에서는, 많은 환자는 정지했습니다. 전국적으로, CRKP를 위한 사망률은 더 높 조차, 가장 아픈 것 의 대부분의 취약한 환자에 먹이로 해 경향이 있습니다.

오래된 견본, 새로운 분석

후에 2008년에, 이의 전체 게놈 연속은 많은 견본 가능하지 않았습니다.

"당시에 우리의 연구원이, Sarah Won 박사, 철저한 발발 수사를 진행했더라도, 2008에서 유효한 분자 역학 공구는 저희가 타이밍을 결정하는 것을 허용하지 않으며 많은 케이스를 위한 퍼짐의 방향," Hayden를 말합니다. "우리는 추가 식별 가능한 기술이 앞으로는 유효할 희망에 격리된 것을 저장했습니다. 우리는 미래가!" 도착할 때 아주 흥분했습니다

붐빔 팀은 연속을 위한 미생물 시스템을 위한 U M의 센터에 견본을 가져오고, 두는 것을 Hayden의 팀이 발발에 관하여 알아냈었던 무슨을과 함께 Snitkin의 팀은 게놈 데이터를 시작했습니다. 이것은 본래 발발 보고의 앞에 유효하지 않아 무언가를 포함했습니다: "환자 0에 임상 데이터 확인하고," CRKP를 가진 그의 감염이 중앙 2007를 거슬러 올라간, Hayden의 팀이 발발의 기점으로 이전에 사람.

이것은 팀이 트렁크에 그 첫번째 환자로 다시 CRKP 발발의 "족보"를, 만드는 것을 허용했습니다. 그(것)들은 환자에게서 환자에게 퍼짐을 지도로 나타내고, 둘 다에 근거하여 시설에 시설은, sleuthwork Hayden의 팀 새로운 genomic 순서 정보 하고.

그(것)들은 어느 케이스가 시설 내의 전송에서 유래했었던지 볼 수 있었습니다 - 감염한 환자에게서 박테리아가 그 외를 도달하는 것을 허용한 환자가 그(것)들 안쪽에 박테리아로 이미 옮겨졌기 때문에 소개되고 - 사례 때문에.

다음, 그(것)들은 어느 시설 각 환자의 CRKP 감염이에게서 왔었던지 예상하는 것을 시도해서 접근을 시험해, 이미 치료된 그밖 환자의 단지 게놈을 발발 - 및 나중에 치료된 환자에게서 정보의 아무도에서 사용하.

감염이 각 환자를 위해에게서 온 곳에 일어날지도 모른 무슨이에 실제적인 발발에서 유사한 이 실시간 분석, 성공적으로 시설이라고 정밀 폭격을 하는.

"게놈 순서 통로를 찾아내기를 위해 강력합니다, 그러나 노출에 관하여 역학 데이터에는 및 기능 사이 운동이 있는 것은 모두에 이해되,"는 U-M 의과 대학의 미생물학의 부에 있는 보류 위치 & 면역학 및 내과학 Snitkin를 말합니다. "우리는 효험이." 변화하더라도 우리가 그밖 유기체에 이 동일 접근을, 너무 사용할 수 계획합니다, 있을 것이라는 점을

Hayden를, "이 접근 지구에 있는 superbug의 출현 후에 전송의 통로 확인에 특히 유용할 것이 빨리 지도 모릅니다 추가합니다. 발발 먼저 우리가 개입해서 좋으면, 더 확률이 높습니다 포함하기 위하여 우리는 그것을 근절할 수 있습니다."

가능한 계획사업에게 한 미시간과 붐빔 팀의 무료한 전문 기술, 그는 덧붙입니다. 진행해서, 팀은, 그밖 조정에 있는 항생제 저항하는 박테리아 발달 및 전송의 허브를 찾아내서 좋은지 보기 위하여 접근을 시험하는 것을 희망합니다.

그(것)들은 또한 이미 지역에서 나타나 유기체를 위한 전송의 기점을 추적하는 그것의 기능을 위해 접근을 시험할 것입니다. 이것은 수 있어 지금 막 지구를 입력한 감염의 새로 소개한 모형 추적 보다는 매우 더 단단할.

환자가 일정한 환기와 같은 병원 수준 배려를 수신하는 달 동안 한번에 살 수 있는 LTACH의 역할은 또한 더 멀리 탐구하는 것을 희망하는 하나입니다. 그 같은 기능은 약한 면역 계통을 아주 취약한 부동 인구에 제공하는 배려의 종류 때문에 항생제 저항하는 유기체의 발달에 단순히 특히 수그릴지도 모릅니다.

결국에는, 연구원 희망은 의료 시설에 있는 공중 보건 당국 및 감염 통제 전문가에 의해 그들의 접근 - 대체로 적응시키고 넓은 통신망을 통해 전송을 방지하기 위하여 발발에서 내정간섭을 아주 일찌기 조타하도록 이용될 수 있었습니다.

그 점에 얻는 것은 공중 위생 질병 담정이 공개 소프트웨어 소프트웨어의 발달이 일상적으로 사용하골 것을, 또는 프로세스를 자동화하도록 요구할 것입니다.

근원: http://med.umich.edu/

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