La Nueva aproximación puede seguir su trayectoria entre cómo los superbugs viajan y dentro de recursos de atención sanitaria

Bacterias del Asesino - unas que fuera-han desarrollado nuestros mejores antibióticos -- no puede salir en cualquier momento pronto. Pero una nueva aproximación a seguir su trayectoria su extensión podía eventual darnos una oportunidad de limitar su número de víctimas mortales.

Usando datos de un brote 2008 de una de los “superbugs más-temidos,” y de las técnicas de secuencia genéticas modernas, las personas han modelado con éxito, y predicho, la manera que el organismo se extendió entre y dentro de las docenas de recursos de atención sanitaria.

La aproximación puede informar si el fallo de funcionamiento se está extendiendo dentro de un hospital, de una clínica de reposo o de hospital agudo a largo plazo del cuidado - o si un nuevo paciente transferido de otro recurso lo ha traído allí.

Es decir si luchar superbugs es como una película de terror, la aproximación puede informar si la visita está viniendo por dentro de la casa, o si el asesino está estando al acecho fuera de y barge alrededor a través de la puerta.

Y apenas como en una película de terror, conseguir una respuesta puede conducir rápidamente qué clase de profesionales de salud de las barricadas y de las armas deben utilizar contra el malvado.

La aproximación, publicada en Remedio De Translación de la Ciencia, combina aproximaciones epidemiológicas actuales con la secuencia del entero-genoma - explicar la serie entera de la DNA de bacterias de cada paciente infectado.

Esto permite utilizar los cambios minúsculos en la DNA del superbug - la clase de mutaciones que suceso naturalmente en un cierto plazo -- para seguir su trayectoria su extensión en y entre recursos de atención sanitaria.

La aproximación fue desarrollada por las personas del Centro Médico de la Universidad de la Embestida en Chicago y la Facultad de Medicina de la Universidad de Michigan, con el financiamiento de los Centros federales para el Programa de los Epicentros de la Prevención del Control de Enfermedades y de la Prevención. Las personas utilizaron datos sobre un brote 2008 de pulmonía carbapenem-resistente de la Klebsiella (CRKP) en el Cercano Oeste superior.

“Estas regiones empapadas de los organismos, sino no se ha entendido detalladamente cómo suceso ésa - porqué él se extiende como incendio fuera de control en una región y no hace progreso en otra,” dice a Evan Snitkin, Ph.D., profesor adjunto del U-M que se especializa en bioinformática y biología de sistemas. “Porque éste era el primer brote de CRKP en la región de Chicago, decidíamos intentar rastrear sus movimientos iniciales basados en transferencias y la secuencia pacientes del entero-genoma de muestras. Si podemos entender qué transmisión de los mecanismos impulsores en una región, nosotros espera poder intervenir para prevenir la extensión adicional.”

Dorso a tiempo

El hospital de la Embestida determinó el segundo caso de CRKP en la región. Las personas del hospital determinaron el brote después de un paciente llegaron su departamento de emergencia en una transferencia de un hospital agudo del cuidado en Indiana.

Personas llevadas por Maria K. Hayden, M.D., médico de las enfermedades infecciosas que también dirige la División de la Embestida de Microbiología Clínica, conducto y publicadas su propia investigación del brote, usando las mejores técnicas disponibles en ese entonces. Concluyeron que el fallo de funcionamiento se había extendido de un único paciente a mediados de 2007, y eventual infectado 42 personas trató en 14 hospitales agudos del cuidado, dos LTACHs, y 10 clínicas de reposo.

Las Transferencias de pacientes entre estos recursos - por ejemplo, de un LTACH o de un oficio de enfermera a un hospital para el cuidado agudo a corto plazo, y entonces retroceda otra vez - fueron determinadas como un programa piloto importante de la extensión. Un único LTACH fue determinado como cubo dominante para la transmisión.

En este brote, muchos pacientes murieron. Por Toda La Nación, los índices de mortalidad para CRKP son incluso más altos, y tiende a cazar sobre el más enfermo, la mayoría de los pacientes vulnerables.

Muestras Viejas, nuevo análisis

En 2008, la secuencia del entero-genoma de este muchas muestras no era posible.

“Aunque nuestro profesor investigador en ese entonces, el Dr. Sarah Won, conducto una investigación exhaustiva del brote, las herramientas epidemiológicas moleculares disponibles no permitieron en 2008 que determináramos la sincronización y dirección de la extensión para muchos casos,” dice a Hayden. “Salvamos los aislantes con la esperanza que más técnicas discriminatorias estarían disponibles en el futuro. Éramos muy emocionados cuando llegó el futuro!”

Las personas de la Embestida trajeron las muestras al Centro de U-M para los Sistemas Microbianos para ordenar, y las personas de Snitkin comenzaron a poner los datos del genoma así como lo que habían descubierto las personas de Hayden sobre el brote. Esto incluyó algo que no había estado disponible antes del parte original del brote: datos clínicos sobre el “paciente cero,” la persona cuya infección con CRKP dató de mid-2007, y que las personas de Hayden habían determinado previamente como el origen del brote.

Esto permitió que las personas crearan un “árbol de familia” del brote de CRKP, de nuevo a ese primer paciente en el enlace. Correlacionaron la extensión del paciente al paciente, y el recurso al recurso, sobre la base de ambos las personas del Hayden del sleuthwork había hecho y la nueva información genomic de la serie.

Podrían ver qué casos habían resultado de la transmisión dentro del recurso - debido a las prácticas que permitieron que las bacterias del paciente infectado alcanzaran otros - y que habían sido introducidas porque transfirieron a un paciente con las bacterias ya dentro de ellas.

Entonces, probaron la aproximación intentando predecir había venido la infección del CRKP de qué recurso cada paciente, con solamente los genomas de los otros pacientes tratados ya en el brote - y ninguno de la información de los pacientes tratados más adelante.

Este análisis en tiempo real, similar a qué pudo suceso en un brote real, con éxito establecido claramente el recurso donde la infección vino para de cada paciente.

“La serie del genoma es potente para encontrar caminos, pero tener datos epidemiológicos sobre exposiciones y movimiento entre los recursos hace que todo tiene sentido,” dice a Snitkin, que las posiciones de asimientos en los departamentos de Facultad de Medicina del U-M de la Microbiología y Inmunología y Remedio Interno. “Prevemos que podremos utilizar esta misma aproximación en otros organismos, también, aunque la eficacia variará.”

Agrega a Hayden, “Esta aproximación pudo ser determinado útil en determinar caminos de la transmisión pronto después de la aparición de un superbug en una región. Cuanto anterior podemos intervenir para contener un brote, más probable es que puede suprimirlo.”

La experiencia complementaria de las personas de Michigan y de la Embestida hechas el proyecto posible, él agrega. Yendo hacia adelante, las personas esperan probar la aproximación en otras configuraciones, para ver si pueden encontrar los cubos del revelado y de la transmisión resistentes a los antibióticos de las bacterias.

También probarán la aproximación para que su capacidad rastree el origen de la transmisión para un organismo que esté ya presente en un área. Esto podría ser mucho más duro que siguiendo su trayectoria un tipo nuevamente introducido de infección que acaba de incorporar una región.

El papel de LTACH, donde los pacientes pueden vivir por los meses al mismo tiempo que reciben cuidado del hospital-nivel tal como ventilación constante, es una que también esperan explorar más lejos. Tales recursos pueden ser especialmente propensos el revelado de organismos resistentes a los antibióticos simple debido a la clase de cuidado que proporcionan a una población muy vulnerable e inmóvil los sistemas inmunes débiles.

A largo plazo, la esperanza de los investigadores su aproximación se podía adaptar ampliamente por los especialistas del mando públicas de las autoridades sanitarias y de la infección en recursos de atención sanitaria - y utilizar para navegar intervenciones muy temprano en un brote para prevenir la transmisión a través de redes amplias.

Para conseguir a esa punta requerirá el revelado del software del public domain para que los detectives de la enfermedad de la salud pública utilicen rutinario, o aún automaticen el proceso.

Fuente: http://med.umich.edu/

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