新的途徑可能跟蹤 superbugs 在如何中旅行和在保健措施療養院內

兇手細菌 - 外演變我們的最佳的抗生素的部分 -- 不可以很快走開。 但是對跟蹤他們的傳播的一個新的途徑能最終給我們機會保留他們的死亡人數。

使用從 2008年爆發的數據其中一個最恐懼的 「superbugs」,和現代基因排序的技術,小組順利地塑造了,并且預測,這個有機體分佈在和在數十個保健措施療養院內之間的方式。

這個途徑可能告訴這個臭蟲是否在醫院、老人院或者長期深刻關心醫院內分佈 - 或從另一個設備調用的一名新的患者是否帶來它那裡。

換句話說,如果與 superbugs 戰鬥是像恐怖片,這個途徑可能告訴這種購買權是否從這個房子裡邊來,或者這個兇手是否潛伏外面,并且通過門闖入。

并且像在恐怖片,獲得答復可能迅速引導什麼樣的護攔和武器衛生業職員應該使用這個惡棍。

這個途徑,發布在科學平移醫學,與全部染色體排序結合當前流行病學途徑 - 說明清楚細菌整個脫氧核糖核酸順序從每名被傳染的患者的。

這使成為可能使用在 superbug 脫氧核糖核酸上的微小的變化 - 自然隨著時間的推移發生的這种變化 -- 在保健措施療養院之間,跟蹤他們的傳播。

這個途徑由從倉促大學治療中心的小組開發在芝加哥和密執安大學醫學院,有從聯邦疾病控制預防中心的資助的預防震央程序。 小組在上面的中西部使用了關於 carbapenem 抗性克雷伯氏菌性肺炎 2008年爆發的數據。

「這些有機體滲入地區,然而未詳細瞭解那如何發生 - 他們為什麼在一個區域在別的分佈像野火,并且不做進展」, UM 助理教授說埃文 Snitkin、 Ph.D。,專門化分析複雜生物資料的學科和系統生物學的。 「由於這是 CRKP 第一爆發在芝加哥地區,我們決定設法跟蹤在耐心調用和全部染色體排序的其最初的移動範例基礎上。 如果我們可以瞭解什麼推進傳輸在區域,我們希望能干預防止進一步傳播」。

及時

倉促的醫院在這個區域識別 CRKP 第二個事例。 醫院小組在患者以後識別爆發到達了他們的急症室在從一家深刻關心醫院的調用在印第安納。

使用最佳的技術導致由瑪麗 K. Hayden, M.D.,也處理臨床微生物學倉促的分部的一位傳染病醫師,當時執行和被發布的其爆發的自己的調查,小組可用。 他們認為,這個臭蟲從中間2007 的一名唯一患者分佈,并且最終傳染 42 個人在 14 家深刻關心醫院,二 LTACHs 和 10 個老人院對待。

患者調用在這些設施中的 - 例如,從 LTACH 或看護到一家醫院短期深刻關心的,再然後请返回 - 被識別,傳播一個主要驅動器。 唯一 LTACH 被識別作為傳輸的一個關鍵插孔。

在此爆發,許多患者中斷了。 在全國範圍內, CRKP 的死亡率更高,并且它傾向於捕食在最病,多數易損壞的患者。

老範例,新的分析

在 2008年,全部染色體排序此許多範例不是可行的。

「雖然當時我們的研究員,薩拉 Won 博士的,進行了一個詳盡爆發調查,分子流行病學工具可用在 2008 不允許我們確定規定期限,并且傳播的方向許多案件的」, Hayden 說。 「我們保存了孤立以希望更多有識別力的技術在將來是可用的。 我們是非常興奮的,當遠期到達了!」

倉促小組給微生物系統 U M 的中心帶來範例排序的,并且 Snitkin 的小組開始與什麼一起放置染色體數據 Hayden 的小組發現了關於爆發。 這包括了在原始爆發報表前不是可用的事: 關於 『患者零的臨床數據』,與 CRKP 的傳染追溯到中間2007,并且 Hayden 的小組以前識別作為爆發的始發地的人員。

這允許這個小組創建 『系族樹』 CRKP 爆發,回到這根樹幹的該第一名患者。 他們映射了傳播從患者到患者,并且對設備的設備,根據兩個 sleuthwork Hayden 的小組執行和新的基因組順序信息。

他們可能發現哪些案件起因於在這個設備內的傳輸 - 由於引入允許從這名被傳染的患者的細菌到達其他 -,并且的運作,因為患者調用了與細菌已經在他們裡面。

然後,他們通過設法預測哪名測試了這個途徑設備每名患者的 CRKP 傳染來自,使用其他患者的仅染色體已經治療在爆發 - 和無從患者的信息以後治療。

此實時分析,類似對什麼在實際爆發也許發生,順利地精確定位設備傳染來自為每名患者的地方。

「染色體順序為查找路是強大的,但是有關於風險的流行病學在設施之間的數據和移動做一切有意義」, Snitkin 說,在微生物學 UM 醫學院的部門的保持位置 & 免疫學和內科。 「我們構想我們能使用在其他有機體的此同樣途徑,同樣,雖然效力將變化」。

在區域添加 Hayden, 「此途徑也許是特別有用的在識別傳輸路在一 superbug 的誕生以後。 我們可以越及早干預包含爆發,越可能的是我們可能根除它」。

做可能這個的項目的密執安和倉促小組的補充專門技術,他補充說。 前進,這個小組希望測試在其他設置的途徑,發現他們是否可以找到對抗抗生素的細菌發展和傳輸插孔。

他們也將測試這個途徑為了其能力能跟蹤傳輸的始發地已經是存在區的有機體的。 這比跟蹤輸入了區域傳染的一種最近被引入的類型可能困難。

LTACH 的角色,他們也希望進一步測試。的患者可能每次居住在得到醫院級的關心例如恆定的透氣的幾個月,是一个 他們供給給非常易損壞和固定人口弱的免疫系統的這樣設施可能是特別傾向的對對抗抗生素的有機體的發展由於這种關心。

從長遠看,研究員希望他們的途徑能由公共衛生當局和傳染保健措施療養院的控制專家寬廣地適應 - 和用於操縱干預非常及早在爆發防止在間清楚的網絡的傳輸。

要有該點將要求公共領域軟件的發展為了公共衛生疾病探員能定期地使用,甚至自動化這個進程。

來源: http://med.umich.edu/

Advertisement