L'approche de calcul peut aider à recenser les objectifs potentiels chemoresistant en cellules souche de cancer

Les chercheurs d'université d'Osaka développent la méthode pour extraire des données de valeur des caractéristiques de modification de niveau d'expression du gène et de méthylation d'ADN

Dans le cancer, une des caractéristiques les plus importantes est la méthylation du deoxycytosine pour former le methylcytosine 5 (5mC). La méthylation d'ADN est un procédé par lequel les groupes méthyliques (éléments structurels des composés organiques se composant de trois atomes d'hydrogène collés sur un atome de carbone) sont ajoutés à la molécule d'ADN.

La configuration de cas et de distribution de 5mC se sont avérées essentielle pour le règlement de gène et peuvent servir de biomarqueurs importants à la diagnose. Par conséquent, vérifier la relation entre la méthylation d'ADN et la transcription (la première étape de l'expression du gène) est important pour l'évaluation des réponses cellulaires et le développement des stratégies thérapeutiques nouvelles.

Les analyses considérables de méthylation et de transcription d'ADN ont fourni de grandes quantités de caractéristiques ; cependant, il est difficile de recenser les gènes critiques liés au développement du cancer de ces caractéristiques. À cet effet, une équipe des chercheurs d'université d'Osaka transformés le de large volume des caractéristiques dans un fonctionnement doux utilisant des fonctionnements gaussiens pour extraire l'information appropriée des informations sur les données qui servent de valeur représentative de la méthylation 5mC.

Les « tumeurs contiennent une sous-population des cellules, les cellules souche de cancer appelées (CSCs), qui sont auto-renouvelantes et tumorigènes et jouent un rôle dans la résistance contre la chimiothérapie et la radiothérapie, » explique Masamitsu Konno, le premier auteur de l'étude rapportée dans des états scientifiques. « Nous avons pour cette raison visé à déterminer les techniques performantes de recenser les objectifs thérapeutiques utilisant un modèle de CSC du décarboxylase d'ornithine d'enzymes pour caractériser des événements intracellulaires basés sur le 5mC. »

L'approche de calcul neuve intègre la caractéristique de modification de niveau et de méthylation d'expression du gène, qui permet aux chercheurs de recenser avec succès TRAF4 comme gène important pour le chemoresistance. Par la méthode, l'efficacité des médicaments pour le cancer gastrointestinal humain, y compris le cancer de l'oesophage, a été également déterminée. L'expression TRAF4 anormale a été rapportée dans certains cancers, y compris le sein, le poumon, et les cancers de la prostate, mais c'est la première étude pour prouver que TRAF4 est important pour le règlement possible des fonctionnements dans CSCs de cancer de l'oesophage humain.

« Notre méthode mathématique peut être employée pour mesurer simultanément et recenser les objectifs potentiels chemoresistant en cellules souche de cancer gastrointestinal, » Yuichiro correspondant Doki auteur indique. « Nos résultats fournissent non seulement des données de valeur pour le développement de la thérapeutique neuve pour le cancer de l'oesophage, mais ils supportent également le raisonnement pour l'examen critique de grande puissance des objectifs thérapeutiques du développement de médicament de CSC. »