La aproximación de cómputo puede ayudar a determinar los objetivos potenciales chemoresistant en células madres del cáncer

Los investigadores de la universidad de Osaka desarrollan método para extraer la información valiosa de datos de la modificación del nivel de la expresión génica y de la metilación de la DNA

En cáncer, una de las características más importantes es la metilación del deoxycytosine para formar el methylcytosine 5 (5mC). La metilación de la DNA es un proceso por el cual los grupos metílicos (unidades estructurales de las composiciones orgánicas que consisten en tres átomos de hidrógeno pegados a un átomo de carbono) son agregados a la molécula de la DNA.

La configuración del acontecimiento y de la distribución de 5mC se ha mostrado para ser crucial para la regla del gen y puede servir como biomarkers importantes para los diagnósticos. Por lo tanto, la investigación del lazo entre la metilación y la transcripción (el primer paso de la DNA de la expresión génica) es importante para la interpretación de reacciones celulares y el revelado de estrategias terapéuticas nuevas.

Los análisis extensos de la metilación y de la transcripción de la DNA han ofrecido una gran cantidad de datos; sin embargo, es difícil determinar los genes críticos relacionados con el revelado del cáncer de estos datos. A tal efecto, las personas de los investigadores de la universidad de Osaka transformaron el de gran capacidad de datos en una función lisa usando funciones gausianas para extraer la información apropiada de los datos - la información que sirve como valor representativo de la metilación 5mC.

Los “tumores contienen una subpoblación de células, llamada las células madres de cáncer (CSCs), que son de uno mismo-renovación y tumorigenic y desempeñan un papel en la resistencia contra la quimioterapia y la radioterapia,” explican Masamitsu Konno, primer autor del estudio denunciado en partes científicos. “Por lo tanto apuntamos determinar los métodos eficientes de determinar objetivos terapéuticos usando un modelo de CSC de la decarboxilasa de la ornitina de la enzima para caracterizar las acciones intracelulares basadas en el 5mC.”

La nueva aproximación de cómputo integra los datos de la modificación del nivel y de la metilación de la expresión génica, que permite que los investigadores determinen con éxito TRAF4 como gen importante para el chemoresistance. Con el método, la eficacia de las drogas para el cáncer gastrointestinal humano, incluyendo cáncer del esófago, también fue determinada. La expresión anormal TRAF4 se ha denunciado en ciertos cánceres, incluyendo el pecho, el pulmón, y cánceres de próstata, pero éste es el primer estudio para mostrar que TRAF4 es importante para la regla posible de funciones en CSCs del cáncer del esófago humano.

“Nuestro método matemático se puede utilizar para cuantificar simultáneamente y determinar los objetivos potenciales chemoresistant en células madres gastrointestinales del cáncer,” Yuichiro correspondiente Doki autor dice. “Nuestros resultados no sólo ofrecen la información valiosa para el revelado de la nueva terapéutica para el cáncer del esófago, pero también soportan el análisis razonado para la investigación en grande de objetivos terapéuticos del revelado de la droga de CSC.”