Le Microbiome humain - une empreinte digital potentielle neuve dans les preuves médico-légales ?

Thought LeadersProf. Jack GilbertDirector of The Microbiome CenterUniversity of Chicago

Une entrevue avec professeur Jack Gilbert, conduit par Alina Shrourou, BSC.

Quel est un microbiome et pourquoi est des microbiomes seul à une personne ?

Un microbiome est le grand total des microbes des bactéries, des champignons, et des virus qui vivent à l'intérieur de votre fuselage. Ils sont partout dans votre peau et dans votre intestin. Seules les bactéries représente 2 ou 3 livres de votre Massachusetts de fuselage.

© vrx/Shutterstock.com

Ce qui est intéressant est que quand vous êtes né, vous êtes en grande partie stérile. Vous acquérez des microbes de votre mère et de l'environnement. Puis, la voie vous vivez votre durée et les choses que vous agissez l'un sur l'autre avec la forme le genre de microbes qui colonisent et vivent à l'intérieur de vous. Ceci a comme conséquence votre propre seul profil, et même les vrais jumeaux ont différents profils.

Veuillez donner le projet de Microbiome de cambriolage que vous avez discuté chez Pittcon 2018.

Nous avions essayé de comprendre si notre signature bactérienne peut agir comme une empreinte digital, et soyons employés en tant que certain genre d'outil légal, comme la preuve de trace.

Nous émettons environ 36 millions de cellules bactériennes dans notre environnement immédiat chaque seule heure - ainsi si un cambrioleur dans une chambre pendant 10 mn touche des objectifs et laisse quelques leurs bactéries, pouvons-nous trouver leur signature bactérienne personnelle en obtenant certaines des bactéries présentes dans la chambre ?

Il pourrait alors être possible d'ordonnancer l'information, comme nous faisons avec l'ADN humain à une scène du crime, et recense pour cette raison cette personne.

C'est une idée intéressante, et au moment où c'est un projet de recherche très tôt que nous travaillons en circuit avec l'institut national de la justice.

Comment déterminez-vous si un organisme microbien est associé à un trait particulier ?

Nous avions essayé de voir si la signature bactérienne qui vit à l'intérieur de nous est d'une certaine manière marquée avec nos choix de mode de vie.

La signature qui appartient à vous est beaucoup déterminée par la façon dont vous avez vécu votre durée ; si vous avez eu des animaux familiers grandir, si vous avez grandi dans une ville ou une ferme etc., est tout factorisé dedans.

Les différents environnements de travail peuvent déterminer quelles bactéries vivent à l'intérieur de vous, comment elles se développent et comment elles sont distribuées, ainsi nous avons voulu voir si ce marque. Nous avons accumulé une base de données de plus de 12.000 personnes et nous avions marqué combien assimilé nos fausses signatures de microbiome de cambrioleurs sont aux gens dans notre base de données. Elle a compliqué, mais nous obtenons réellement près de recenser quelqu'un des traits de mode de vie basés sur la signature microbienne qu'ils laissent à une scène du crime.

Quelles techniques analytiques êtes-vous employant pour recenser des biomarqueurs microbiens ?

Nous influençons le séquençage du génome, particulièrement les plates-formes d'Illumina - extraction d'ADN, et amplification d'ACP, plus ou moins la même voie que nous avec des séquences d'ADN humaines. Nous recensons un gène particulier actuel dans toutes les bactéries que nous ordonnançons alors et l'employons pour déterminer quels organismes bactériens sont présents dans les autres sujets et ce qui rend une personne seule.

Nous produisons alors une estimation de probabilité que vos bactéries seraient trouvées dans un certain environnement. Utilisant des techniques statistiques avancées, nous essayons et recensons si les caractéristiques de ordonnancement de vos bactéries peuvent vous mettre à cette scène du crime.

Veuillez donner tous les biomarqueurs spécifiques que vous avez déjà recensés dans ce projet.

La voie dont nous analysons le microbiota est en recherchant de seules tensions des organismes. Nous tous avons une substance particulière d'Escherichia coli vivre à l'intérieur de notre intestin, et nous tous avons la vie de l'épidermite de staphylocoque dans notre peau, mais chacun individuel a une tension avec un génotype et un génome seuls à eux. Elle évolue avec vous et subit une mutation au fil du temps, et nous appelons ces biomarqueurs de mutations.

Nous employons que l'information pour essayer et recenser si nous pouvons retirer des mutations génotypes particulières, ou les biomarqueurs, qui sont seuls à une personne.

Si le mode de vie d'une personne peut changer durant toute leur vie, fait-il ce moyen que leur microbiome peut aussi ? Si oui, les signatures de microbiome sont-elles toujours un outil précis d'identification ?

Nous essayons de répondre à une question très particulière ; si le profil de microbiome d'une personne est stable et reste avec vous durant toute votre durée.

Nous présumons basé sur toutes les caractéristiques que nous nous sommes rassemblées que nous avons une composition basée seule par tension qui est une empreinte digital de notre microbiota, mais nous avons pas prouvé ceci, et il y a un bon nombre de facteurs qui pourraient modifier cette théorie.

Une partie de ce projet est d'essayer et recenser si notre niche microbienne d'empreinte digital, et comment la niche il est. Une fois que vous laissez une trace de votre signature de bactéries sur un téléviseur de poignée de porte ou, diminue-t-il ? Et si oui, comment rapidement ?

Utilisant l'analyse de Microbiome pour l'enquête de scène du crime d'AZoNetwork sur Vimeo.

Que pensez-vous les futures prises pour l'usage du seul microbiome d'une personne de cette façon ? Ou pour d'autres applications ?

Le contrat à terme excite réellement. Nous pouvons potentiellement employer le microbiome dans la science légale, mais ce serait dans le futur. Le programme humain d'ADN pour des preuves médico-légales a pris des décennies, et nous commençons seulement juste notre voyage.

Ce qui est la plupart d'exciter est nous pouvons également employer l'information de microbiome à l'intérieur de nos fuselages en médicament personnalisé, utilisant le microbiome pour prévoir si une personne répondra à un traitement particulier.

Nous pourrions examiner le microbiome d'un malade du cancer et déterminer s'ils ont les biomarqueurs qui peuvent indiquer leur réaction à l'immunothérapie, qui peut aider des professionnels de la santé à recenser leur stratégie idéale pour le traitement. Nous pouvons employer ceci pour concevoir en fonction la demande de règlement la personne plutôt que la demande de règlement moyenne d'une population.

Comment Pittcon 2018 peut-il vous aider avec votre recherche ?

Ce qui excite au sujet de Pittcon est qu'il rassemble un groupe entier d'experts techniques les domaines que je n'aurais pas normalement accès à.

Pouvoir atteindre la largeur de l'expérience et des technologies qui sont à la disposition de moi ici me donne plus d'opportunités d'augmenter mes objectifs de recherches et de faire quelque chose nouvelle et passionnante, cela peut-être que je n'aurais pas normalement l'occasion d'être impliqué dedans.

Au sujet de prof. Jack Gilbert

Professeur Jack A Gilbert a gagné son Ph.D. du monolevier et de l'université de Nottingham, R-U en 2002, et a reçu sa formation post-doctorale à l'université de la Reine, Canada. Il est par la suite revenu au R-U en 2005 au laboratoire marin de Plymouth à un scientifique supérieur jusqu'à son mouvement au laboratoire national d'Argonne et à l'Université de Chicago en 2010.

Actuel, professeur Gilbert est le directeur du centre de Microbiome et un professeur de la chirurgie à l'Université de Chicago. Il est également chef de groupe pour l'écologie microbienne au laboratoire national d'Argonne, à l'associé de recherches au musée d'inducteur de l'histoire naturelle, au camarade scientifique au laboratoire biologique marin, et au professorat de visite de Yeoh Ghim Seng en chirurgie à l'université nationale de Singapour.

Gilbert emploie l'analyse moléculaire pour évaluer des hypothèses principales en écologie microbienne. Il a écrit plus de 250 publications et chapitres de livre observés par pairs sur le metagenomics et s'approche à l'écologie d'écosystème. Il est le rédacteur-en-chef de fondation du tourillon de mSystems. En 2014 il a été identifié sur les affaires de Crain Chicago 40 au-dessous de la liste 40, et en 2015 il a été indiqué en tant qu'un des 50 scientifiques les plus influents par l'initié d'affaires, et dans les Dix brillants par le scientifique populaire.

En 2016 il a gagné le prix d'Altemeier de la société chirurgicale d'infection, et le prix de WH Pierce de la société pour la microbiologie appliquée pour l'excellence de recherches. Il Co-a également écrit des « saletés est bon » publié en 2017, un guide de science populaire du microbiome et la santé enfantile.

Citations

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    Pittcon. (2018, August 23). Le Microbiome humain - une empreinte digital potentielle neuve dans les preuves médico-légales ?. News-Medical. Retrieved on May 25, 2019 from https://www.news-medical.net/news/20180329/The-Human-Microbiome-e28093-A-New-Potential-Fingerprint-in-Forensic-Evidence.aspx.

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