¿El Microbiome humano - una nueva huella dactilar potencial en pruebas forenses?

Thought LeadersProf. Jack GilbertDirector of The Microbiome CenterUniversity of Chicago

Una entrevista con profesor Jack Gilbert, conducto por Alina Shrourou, BSCA.

¿Cuál es un microbiome y porqué son los microbiomes únicos a un individuo?

Un microbiome es la suma total de los microbios de bacterias, hongos, y los virus que viven dentro de su carrocería. Están por todo su piel y en su tripa. Las bacterias solamente explican 2-3 libras de su Massachusetts de la carrocería.

© vrx/Shutterstock.com

Cuál es interesante es que cuando usted nace, usted es sobre todo estéril. Usted detecta microbios de su molde-madre y del ambiente. Entonces, la manera usted vive su vida y las cosas que usted obra recíprocamente con forma la clase de microbios que colonicen y vivan dentro de usted. Esto da lugar a su propio perfil único, e incluso los gemelos idénticos tienen diversos perfiles.

Contornee por favor el proyecto de Microbiome del robo que usted discutió en Pittcon 2018.

Hemos estado intentando entender si nuestra firma bacteriana puede actuar como una huella dactilar, y nos utilicemos como cierta clase de herramienta forense, como pruebas del trazo.

¿Emitimos alrededor 36 millones de células bacterianas a nuestro ambiente inmediato cada hora - tan si un ladrón en un cuarto por 10 minutos toca objetos y se va detrás de algunas sus bacterias, podemos descubrir su firma bacteriana personal obteniendo algunas de las bacterias presentes en el cuarto?

Podría entonces ser posible ordenar la información, como hacemos con la DNA humana en una escena del crimen, y por lo tanto determina a ese individuo.

Es una idea interesante, y en el momento que es un proyecto de investigación muy temprano que estamos trabajando conectado con el instituto nacional de la justicia.

¿Cómo usted determina si un organismo microbiano está asociado a un rasgo determinado?

Hemos estado intentando ver si la firma bacteriana que vive dentro de nosotros se correlaciona de alguna manera con nuestras opciones de la forma de vida.

La firma que pertenece a usted es mucho resuelta por cómo usted ha vivido su vida; si usted tenía animales domésticos el crecer, si usted creció en una ciudad o una granja etc, son todo descompuesto en factores hacia adentro.

Diversos entornos de trabajo de pueden determinar qué bacterias viven dentro de usted, cómo crecen y cómo se distribuyen, así que quisimos ver si ese correlaciona. Aumentamos una base de datos sobre de 12.000 personas y hemos estado correlacionando cómo es similar nuestras firmas falsas del microbiome de los ladrones están a la gente en nuestra base de datos. Ha complicado, pero estamos consiguiendo realmente cerca de determinar alguien los rasgos de la forma de vida basados en la firma microbiana que ella deja detrás en una escena del crimen.

¿Qué técnicas analíticas es usted que usa para determinar biomarkers microbianos?

Leverage la secuencia del genoma, especialmente las plataformas de Illumina - extracción de la DNA, y amplificación de la polimerización en cadena, mucha la misma manera que con series humanas de la DNA. Determinamos un gen determinado presente en todas las bacterias que entonces ordenemos y lo utilizamos para determinar qué organismos bacterianos están presentes en diversos temas y qué hace a un individuo único.

Entonces producimos un presupuesto de la probabilidad que sus bacterias serían encontradas en cierto ambiente. Usando técnicas estadísticas avanzadas, intentamos y determinamos si los datos de secuencia de sus bacterias pueden colocarle en esa escena del crimen.

Contornee por favor cualquier biomarkers específico que usted haya determinado ya en este proyecto.

La manera de la cual analizamos el microbiota está buscando deformaciones únicas de organismos. Todos tenemos una especie determinada de Escherichia Coli el vivir dentro de nuestra tripa, y todos tenemos vida de la epidermitis del estafilococo en nuestra piel, pero cada uno individual tiene una deformación con un genotipo y un genoma únicos a ellos. Se desarrolla con usted y se transforma en un cierto plazo, y llamamos esos biomarkers de las mutaciones.

Estamos utilizando que información para intentar y para determinar si podemos sacar mutaciones genotípicas determinadas, o los biomarkers, que son únicos a un individuo.

¿Si la forma de vida de un individuo puede cambiar en su curso de la vida, hace este medio que puede su microbiome también? ¿Si es así son las firmas del microbiome siempre una herramienta exacta de la identificación?

Estamos intentando contestar a una pregunta muy determinada; si el perfil del microbiome de un individuo es estable y tirante con usted en su vida.

Presumimos basado en todos los datos que hemos cerco que tenemos una composición basada deformación única que sea una huella dactilar de nuestro microbiota, pero no hemos probado esto, y hay lotes de los factores que podrían alterar esta teoría.

La parte de este proyecto es intentar y determinar si nuestro establo microbiano de la huella dactilar, y cómo es el establo él. ¿Una vez que usted deja un trazo de su firma de las bacterias en una televisión del tirador o, decae? ¿Y si es así cómo rápidamente?

Usando el análisis de Microbiome para la investigación de la escena del crimen de AZoNetwork en Vimeo.

¿Qué usted piensa los asimientos futuros para usar el microbiome único de un individuo de esta manera? ¿O para otros usos?

El futuro es realmente emocionante. Podemos potencialmente utilizar el microbiome en ciencia forense, pero ésa estaría en un futuro lejano. El programa humano de la DNA para las pruebas forenses tardó décadas, y apenas estamos comenzando solamente nuestro viaje.

Cuál es el más emocionante somos podemos también utilizar la información del microbiome dentro de nuestras carrocerías en remedio personalizado, usando el microbiome para predecir si un individuo responderá a una terapia determinada.

Podríamos revisar el microbiome de un enfermo de cáncer y determinar si tienen los biomarkers que pueden indicar su reacción a la inmunoterapia, que puede ayudar a profesionales de la atención sanitaria a determinar su estrategia ideal para la terapia. Podemos utilizar esto para adaptar el tratamiento al individuo bastante que el tratamiento medio de una población.

¿Cómo puede Pittcon 2018 ayudarle con su investigación?

Cuál es emocionante sobre Pittcon es que reúne a un grupo entero de expertos tecnológicos en áreas que no tendría normalmente acceso a.

El poder llegar hasta la anchura de la experiencia y de las tecnologías que están disponibles para mí aquí me da más oportunidades de desplegar mis objetivos de la investigación y de hacer algo nuevo y emocionante, eso quizás que no tendría normalmente la ocasión que ser implicada hacia adentro.

Sobre profesor Jack Gilbert

Profesor Jack A Gilbert ganó su Ph.D. de la palanca de selección y de la universidad de Nottingham, Reino Unido en 2002, y recibió su entrenamiento postdoctoral en la universidad de Queens, Canadá. Él volvió posteriormente al Reino Unido en 2005 al laboratorio marino de Plymouth en un científico mayor hasta su movimiento al laboratorio nacional de Argonne y a la Universidad de Chicago en 2010.

Actualmente, profesor Gilbert es el director del centro de Microbiome y profesor de la cirugía en la Universidad de Chicago. Él es también líder del grupo para la ecología microbiana en el laboratorio nacional de Argonne, el socio de investigación en el museo del campo de la historia natural, la persona científica en el laboratorio biológico marino, y la cátedra que visita de Yeoh Ghim Seng en cirugía en la universidad nacional de Singapur.

Gilbert utiliza análisis molecular para probar hipótesis fundamentales en ecología microbiana. Él ha sido autor de más de 250 publicaciones y capítulos revisados par del libro en metagenomics y se acerca a la ecología del ecosistema. Él es el redactor jefe de fundación del gorrón de los mSystems. En 2014 lo reconocieron en el asunto Chicago 40 de Crain conforme al filete 40, y en 2015 al científico popular lo enlistó como uno de los 50 científicos más influyentes por el iniciado del asunto, y en los diez brillantes.

En 2016 él ganó el premio de Altemeier de la sociedad quirúrgica de la infección, y el premio de WH Pierce de la sociedad para la microbiología aplicada para la excelencia de la investigación. Él también co-fue autor de la “suciedad es bueno” publicado en 2017, una guía de la ciencia popular al microbiome y la salud de niños.

Citations

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    Pittcon. (2018, August 23). ¿El Microbiome humano - una nueva huella dactilar potencial en pruebas forenses?. News-Medical. Retrieved on July 15, 2019 from https://www.news-medical.net/news/20180329/The-Human-Microbiome-e28093-A-New-Potential-Fingerprint-in-Forensic-Evidence.aspx.

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