La recherche jette la lumière sur des caractéristiques génétiques des rotavirus de l'Indonésie

Le rotavirus A entraîne la diarrhée aiguë chez les jeunes enfants, et infecte des animaux et des êtres humains mondiaux. Un organisme de recherche japonais a constaté que la gastro-entérite aiguë infectant des enfants en Indonésie entre 2015 et 2016 a été provoquée par des tensions dominantes des rotavirus comme équine de G3, génétiquement différent des tensions humaines du virus. Les découvertes pourraient jeter la lumière sur la façon dont le virus s'est déplacé en Indonésie des pays voisins.

L'équipe de recherche a été aboutie par professeur Ikuo Shoji, professeur adjoint Takako Utsumi (les deux de projet du troisième cycle d'université de l'université de Kobe du médicament) et professeur Kazuhiko Katayama (institut national des maladies infectieuses, Japon). Leurs découvertes étaient publiées le 27 mars 2018 dans l'édition en ligne de l'infection, de la génétique et de l'évolution.

Le rotavirus A (RVA) se compose de 11 génomes segmentés. Cette nature segmentée signifie que le reassortment génétique se produit souvent, et le virus peut se transformer en des versions neuves. En 2006 un vaccin de rotavirus a été développé et employé dans beaucoup de pays, mais les pays récent différents ont les niveaux de variation rapportés de l'efficacité pour le vaccin. Ceci a pu en partie être provoqué par différentes tensions dominantes du virus.

L'équipe de recherche a visé à jeter la lumière sur les caractéristiques génétiques des tensions de rotavirus en Indonésie. Ils ont effectué l'analyse moléculaire du génome de rotavirus utilisant des échantillons de selles des enfants en Indonésie infectée avec la gastro-entérite aiguë. Pendant une année à partir de 2015 à 2016, le groupe a rassemblé des échantillons de selles de 134 enfants au-dessous de 5 années admises à l'hôpital à Sorabaya. Utilisant l'immunochromatography, ils ont examiné les enfants pour les rotavirus A, et ont constaté que 31,3% étaient RVA antigène-positifs. Ils ont alors découvert que le RVAs étaient les tensions rares G3P [8] et G3P [6]. Avec l'analyse approfondie de chacune des 11 tensions du virus utilisant l'ordonnancement de la deuxième génération, ils ont déterminé que c'était rotavirus comme équine de G3 avec un réseau général génétique de DS-1-like. Cette tension a également été rapportée en Australie, en Hongrie, en Espagne et au Brésil.

« Notre équipe planification maintenant pour analyser les changements dépendant du temps des tensions dominantes du rotavirus de l'Indonésie et pour expliquer comment ils ont été transmis en Indonésie des pays voisins. Nous vérifierons également leur choc sur l'infection professeur Shoji de commentaires à Japon ». « Nous examinerons des échantillons rassemblés des patients vaccinés, analysons l'information génétique des tensions qui résistent à l'immunité basée sur vaccin, et déterminons un système de surveillance pour empêcher ces tensions d'entrer en le Japon. »

Source : http://www.kobe-u.ac.jp/research_at_kobe_en/NEWS/news/2018_05_31_01.html