La ricerca fa luce sulle caratteristiche genetiche del rotavirus dell'Indonesia

Il Rotavirus A causa la diarrea acuta in bambini piccoli ed infetta sia gli animali che gli esseri umani universalmente. Un gruppo di ricerca giapponese ha trovato che la gastroenterite acuta che infetta i bambini in Indonesia fra 2015 e 2016 è stata causata dagli sforzi dominanti del rotavirus del tipo di equina di G3, geneticamente differente dagli sforzi umani del virus. I risultati potrebbero fare luce su come il virus ha viaggiato in Indonesia dai paesi limitrofi.

Il gruppo di ricerca piombo dal professor Ikuo Shoji, dall'assistente universitario Takako Utsumi (entrambi del progetto dalla scuola post-laurea dell'università di Kobe di medicina) e dal professor Kazuhiko Katayama (istituto nazionale delle malattie infettive, Giappone). I loro risultati sono stati pubblicati il 27 marzo 2018 nell'edizione online dell'infezione, della genetica e dell'evoluzione.

Il Rotavirus A (RVA) consiste di 11 genoma segmentato. Questa natura segmentata significa che il reassortment genetico accade spesso ed il virus può evolversi nelle nuove versioni. Nel 2006 un vaccino del rotavirus è stato sviluppato ed utilizzato stato in molti paesi, ma i paesi recentemente differenti hanno riferito i livelli di variazione di efficacia per il vaccino. Ciò ha potuto essere causata parzialmente dagli sforzi dominanti differenti del virus.

Il gruppo di ricerca ha mirato a fare luce sulle caratteristiche genetiche degli sforzi del rotavirus in Indonesia. Hanno effettuato l'analisi molecolare del genoma del rotavirus facendo uso dei campioni di feci dai bambini in Indonesia hanno infettato con la gastroenterite acuta. Per un anno dal 2015 al 2016, il gruppo ha raccolto i campioni di feci da 134 bambini nell'ambito di 5 anni ammessi all'ospedale a Soerabaya. Facendo uso del immunochromatography, hanno esaminato i bambini per il rotavirus A ed hanno trovato che 31,3% erano RVA antigene-positivi. Poi hanno scoperto che il RVAs era gli sforzi rari G3P [8] e G3P [6]. Con ulteriore analisi di tutti e 11 i sforzo del virus facendo uso dell'ordinamento di prossima generazione, hanno determinato che questo era rotavirus del tipo di equina di G3 con una spina dorsale genetica di DS-1-like. Questo sforzo egualmente è stato riferito in Australia, in Ungheria, in Spagna e nel Brasile.

“Il nostro gruppo ora pianificazione analizzare i cambiamenti dipendenti dal tempo negli sforzi dominanti del rotavirus dell'Indonesia e chiarire come sono stati trasmessi in Indonesia dai paesi limitrofi. Egualmente studieremo il loro impatto sull'infezione il professor Shoji di osservazioni nel Giappone„. “Esamineremo i campioni raccolti dai pazienti vaccinati, analizziamo le informazioni genetiche degli sforzi che resistono all' immunità basata a vaccino ed istituiamo un sistema di sorveglianza per impedire questi sforzi entrare nel Giappone.„

Sorgente: http://www.kobe-u.ac.jp/research_at_kobe_en/NEWS/news/2018_05_31_01.html