広範な lipidomics の調査は新陳代謝の健康および病気の署名を明らかにします

EPFL からの科学者およびウィスコンシンマディソンの大学は最も広範な lipidomics の調査の 1 つを今までに遂行しま、ほぼ 150 の脂質の種類をそれぞれの遺伝の調整装置に接続し、新陳代謝の健康および病気の署名を明らかにします。 セルシステムの 2 枚のペーパーで出版されて、調査は新陳代謝の健康科学のための陸標です。

生物学は脂質で包まれます: 脂肪、オイルは、ワックスはセルおよび細胞器官を、仲介します広大な生物的情報ネットワークの流れを、保護します囲み壊れやすいティッシュ、および多重有機体を渡る必要なエネルギーを保存します。

しかし重要性にもかかわらず、脂質は DNA、 RNA および蛋白質を支配する単純なルールおよび明示されているブロックによって定められない分子構造の多様性のために調査するべき最も堅い生体物質間に従来ありました。 そしてこの多様性は、建物およびゲノムおよび transcriptome のデータベースを分析することとは違って、脂質がよりカスタマイズされた分析的なプロシージャを必要とすることを意味します。

このような理由で、セルでそう正確に調整される方法か脂質種の大半の生理学機能を調査することは非常に困難です。 しかし lipidomics の技術が医学アプリケーションに進歩し、調査結果を変換し、そして臨床実験室にもたらしている間、かなりの挑戦はまだあります。

これはウィスコンシンマディソンの大学のデーブ Pagliarini のグループと共同する EPFL のヨハン Auwerx のチームが、マウスの血そしてレバーのほぼ 150 の脂質種の測定によって取った挑戦です。 彼らはまた各脂質種、また彼らの生理学機能の遺伝の調整装置の識別によってこれをフォローしました。

研究者はマウス (いわゆる BXD) のこの人口からの他の 「omics」のデータ・セット (phenomics、 proteomics、 transcriptomics) と lipidomics データを結合するのにシステム遺伝学のアプローチを使用しました。 アプローチは健全か不健康な新陳代謝の州の署名として異なった脂質のクラスからの血しょうそして血の脂質種を識別しました。

例えば、科学者は健全なまたは脂肪質レバーおよび非アルコール脂肪質の肝臓病の署名として 7 つの血しょうトリグリセリド種を示しました (NAFLD)。 観察はマウスと NAFLD の患者からの血しょうの NAFLD の独立した食餌療法および治療上のモデルで認可されました。

「この見つけることは脂質種が NAFLD のような病気を診断するのに現在使用された侵略的なティッシュのバイオプシーを取り替える biomarkers か署名として機能できる楽天主義に燃料を供給します - 単に血の特定の脂質種の測定によって」、ヨハン Auwerx を言います。

友達のペーパーでは同時に出版しました、著者は健全なまたは脂肪質レバーの署名として mitochondria の内部の膜の必要なリン脂質である cardiolipin の脂質のサブセット識別します。

両方のペーパーでは、研究者は脂質種の生産を調整するかもしれない複数の遺伝の位置を正確に示します。 BXD マウス人口からの人間の脂質関連の無秩序のいわゆるゲノム全体の連合の調査からのデータと遺伝データを比較することによって、脂質を調整する人間とマウス間の共通の遺伝子を識別できました。

「脂質を分析し、生理学的な役割を見つけることは決してかもしれ程に簡単核酸か蛋白質を調査します」、 Auwerx を言います。 「しかし生物的および臨床質問をアドレス指定するこれらの友達の調査は脂質種の遺伝の規則そして生理学的な重大さを理解するためにけれども再度大きいデータマイニングの潜在性を示している間」。、基礎を提供します

ソース: https://actu.epfl.ch/news/big-data-identifies-lipids-as-signatures-of-health/