廣泛的 lipidomics 研究顯示新陳代謝的健康和疾病簽名

從 EPFL 的科學家和威斯康辛麥迪遜大學迄今執行了其中一個最廣泛的 lipidomics 研究,連接差不多 150 個不同油脂種類到他們的各自基因管理者,顯示新陳代謝的健康和疾病簽名。 發布在細胞系統的二份文件,這個研究是新陳代謝的健康科學的一個地標。

生物在油脂被包紮: 油脂,油,并且甚而蠟包圍細胞和他們的細胞器,斡旋浩大的生物信息網流,保護脆弱的組織,和存儲在多個有機體間的重要能源。

但是儘管他們的重要性,油脂傳統上是在學習的最困難的原生質中由於他們的分子結構分集,明確定義的構件和簡單規則沒有取決於管理脫氧核糖核酸、核糖核酸和蛋白質。 并且此分集意味著,不同於大廈和分析染色體和 transcriptome 數據庫,油脂要求自定義的分析程序。

因此,學習大量的生理機能油脂種類或他們在細胞那麼精密地調控的這個方式是非常難的。 但是,當 lipidomics 技術是繼續進行,翻譯他們的發現成醫療應用和引入他們到臨床實驗室時仍然是一個嚴重的挑戰。

這是約翰 Auwerx 小組 EPFL 的,與在威斯康辛麥迪遜大學的戴維 Pagliarini 的組合作通過評定差不多在鼠標的血液和肝臟的 150 個油脂種類採取的挑戰。 他們通過識別每個油脂種類以及他們的生理機能基因管理者也探究此。

研究員使用系統遺傳學途徑與其他 「omics」數據集 (phenomics、 proteomics, transcriptomics) 結合 lipidomics 數據從鼠標 (所謂的 BXD) 的此人口。 這個途徑識別等離子和血液油脂種類從不同的油脂選件類作為健康或不健康的新陳代謝的狀態簽名。

例如,科學家展示了七個等離子甘油三酸酯種類作為健康或脂肪肝和非酒精脂肪肝疾病簽名 (NAFLD)。 他們的觀察在 NAFLD 一個獨立飲食和治療設計被驗證了在鼠標和在從患者的等離子有 NAFLD 的。

「此查找加劇為服務油脂種類可能作為簽名或生物標誌將替換當前用於的入侵的組織切片檢查法診斷疾病例如 NAFLD - 的樂觀完全通過評定在血液的特定油脂種類」,約翰 Auwerx 說。

在伴隨文件同時發布了,作者識別作為健康或脂肪肝簽名 cardiolipin 油脂的一個子集,是在線粒體的內在膜的重要磷脂。

在兩份文件,研究員精確定位可能調控油脂種類的生產的幾個基因地點。 通過比較從 BXD 鼠標群的基因數據與從油脂關連的紊亂的所謂的染色體關聯研究的數據在人的,他們能識別在調控油脂的鼠標和人之間的公用基因。

「分析油脂和查找他們的生理角色可能不是一樣直接的像學習核酸或蛋白質」, Auwerx 說。 「但是這些伴隨研究為瞭解油脂種類的基因管理規定和生理意義提供一個基礎,當,再展示大數據採集潛在提出生物和臨床問題時」。

來源: https://actu.epfl.ch/news/big-data-identifies-lipids-as-signatures-of-health/