O erro na maioria de método amplamente utilizado no epigenetics pode causar resultados enganadores

Um erro em um dos métodos os mais amplamente utilizados no epigenetics, Mergulho-segs., pode causar os resultados enganadores, pesquisadores na universidade de Linköping, Suécia, mostrou. Isto pode ter o significado principal no campo da pesquisa, onde “os dados grandes” e os métodos avançados da análise do ADN são usados para estudar vastas quantidades de dados epigenéticos. O erro pode ser corrigido nos dados Mergulho-segs.s previamente recolhidos, que podem conduzir às descobertas novas dos estudos precedentes do epigenetics humano. Os resultados foram publicados nos métodos da natureza do jornal.

Em princípio, cada pilha em nosso corpo tem a mesma seqüência do ADN. Contudo, os tipos diferentes da pilha usam grupos muito diferentes de genes. Isto significa que os sinais adicionais estão exigidos controlar que genes são usados em cada tipo individual da pilha. Um tipo de tal sinal consiste nos grupos químicos anexados directamente à seqüência do ADN. Estas alterações químicas da seqüência do ADN fazem parte do que é chamado geralmente “o código epigenético”. O regulamento epigenético dos genes joga um papel importante na revelação humana normal mas é associado igualmente com muitas doenças, tais como o cancro.

Os pesquisadores na universidade de Linköping descobriram agora uma fraqueza em um mais frequentemente dos métodos usados na pesquisa epigenética, arranjar em seqüência da imunoprecipitação do ADN (Mergulho-segs.). Posto simplesmente, este método é baseado em seleccionar as partes do ADN que levam um sinal epigenético particular. Para isto, os pesquisadores usam os vários anticorpos que lhe reconhecem uma estrutura química e um ligamento específicos. Os anticorpos são classificados subseqüentemente e as seqüências do ADN a que limitaram são determinadas. O grupo de Nestor observou que determinadas marcas epigenéticas ocorreram sempre no mesmo lugar, mesmo no ADN que não deve conter aquelas marcas epigenéticas de todo.

“Nossa descoberta destaca a importância da validação experimental ao usar tecnologias da alto-produção na pesquisa. Sem tal experimental rigor, os erros patentes podem esconder na vista lisa, escondida por sua “consistência” através dos estudos” diz Colm Nestor, professor adjunto no departamento da medicina e do investigador principal clínicos e experimentais do estudo.

Analisando o grupo de mais de 125 Nestor existentes dos conjunto de dados revelou que as seqüências geralmente detectadas Mergulho-segs.s do ADN que não tiveram nenhuma marcas epigenética. Estes falsos positivos constituem 50-90% das regiões detectadas do ADN, e o valor do efeito difere entre conjunto de dados diferentes. “Agora que nós sabemos sobre este erro, é extremamente simples subtrai-lo afastado. Corrigir para estes erros permitirá que as descobertas novas sejam feitas da riqueza de dados do epigenetics já no public domain” diz Colm Nestor.

Os pesquisadores indicam que a grande maioria dos resultados dos estudos precedentes está correcta.

“Nós devemos continuar a usar estes métodos mas correcto para estes erros usando o projecto experimental apropriado” diz Colm Nestor.