El desvío en la mayoría del método ampliamente utilizado en epigenetics puede causar resultados engañosos

Un desvío en uno de los métodos más ampliamente utilizados del epigenetics, Declive-seq, puede causar los resultados engañosos, investigadores en la universidad de Linköping, Suecia, ha mostrado. Esto puede tener significación importante en el campo de la investigación, donde los “datos grandes” y los métodos avanzados de análisis de la DNA se utilizan para estudiar granes cantidades de datos epigenéticos. El desvío se puede corregir en los datos Declive-seq previamente cerco, que pueden llevar a los nuevos descubrimientos de estudios anteriores del epigenetics humano. Los resultados se han publicado en los métodos de la naturaleza del gorrón.

En principio, cada célula en nuestra carrocería tiene la misma serie de la DNA. Sin embargo, diversos tipos de la célula utilizan grupos muy diversos de genes. Esto significa que las señales adicionales están requeridas de controlar qué genes se utilizan en cada tipo individual de la célula. Un tipo de tal señal consiste en los grupos químicos sujetados directamente a la serie de la DNA. Estas modificaciones químicas de la serie de la DNA forman la parte de qué común se llama la “clave epigenética”. La regla epigenética de genes desempeña un papel importante en el revelado humano normal pero también se asocia a muchas enfermedades, tales como cáncer.

Los investigadores en la universidad de Linköping ahora han descubierto una debilidad en uno lo más frecuentemente de los métodos usados en la investigación epigenética, secuencia de la inmunoprecipitación de la DNA (Declive-seq). Puesto simple, este método se basa en la selección de las partes de la DNA que llevan una señal epigenética determinada. Para esto, los investigadores utilizan los diversos anticuerpos que reconocen una estructura química y un lazo específicos a él. Los anticuerpos clasificación posteriormente y las series de la DNA a la cual han limitado son resueltas. El grupo de Nestor notó que ciertas marcas epigenéticas ocurrieron siempre en el mismo lugar, incluso en la DNA que no debe contener esas marcas epigenéticas en absoluto.

“Nuestro descubrimiento destaca la importancia de la validación experimental al usar tecnologías de la alto-producción en la investigación. Sin tal experimental rigor, los desvíos penetrantes pueden ocultar en la mira llana, encubierta por su “estado coherente” a través de estudios” dice a Colm Nestor, profesor adjunto en el departamento del remedio y del principal investigador clínicos y experimentales del estudio.

Analizando al grupo de más de 125 Nestor existentes de los grupos de datos reveló que las series común descubiertas Declive-seq de la DNA que no tenían ninguna marcas epigenética. Estos positivos falsos constituyen 50-90% de las regiones descubiertas de la DNA, y la magnitud del efecto difiere entre diversos grupos de datos. “Ahora que sabemos sobre este desvío, es extremadamente simple restarlo de distancia. La corrección para estos desvíos permitirá que los descubrimientos nuevos sean hechos de la riqueza de los datos del epigenetics ya en el public domain” dice a Colm Nestor.

Los investigadores señalan que la gran mayoría de resultados de estudios anteriores está correcta.

“Debemos continuar utilizar estos métodos pero correcto para estos desvíos usando diseño experimental apropiado” dice a Colm Nestor.