L'étude recense les molécules d'ARN qui règlent les hormones mâles dans le cancer de la prostate

Dans la plupart des cas du cancer de la prostate, la croissance des cellules tumorales est stimulée par l'action des hormones mâles, ou des androgènes, tels que la testostérone et la dihydrotestostérone (DHT).

Pour que ceci se produise, ces hormones doivent gripper aux récepteurs aux androgènes, protéines situées en grande partie dans le cytoplasme des cellules de prostate. Quand l'hormone et le récepteur grippent, elles émigrent au noyau de cellules, où elles activent ou empêchent un certain nombre de gènes pour produire une configuration d'expression du gène cette prolifération de tumeur de faveurs.

Une étude publiée dans les frontières de tourillon en génétique a recensé 600 longues molécules d'ARN noncoding nouvelles (lncRNAs) qui semblent être responsables du contrôle fin de ce processus. LncRNAs sont une grande classe des molécules d'ARN ayez dont une longueur plus de 200 nucléotides et ne codent pas des protéines.

« L'étude soulève l'hypothèse que certains de ces lncRNAs rendent une tumeur de prostate plus agressive. Si confirmé par la future recherche, la découverte ouvrent un monde des possibilités neuves, » a dit Sergio Verjovski-Almeida, un chercheur à l'institut de Butantan la condition, au Brésil, et l'investigateur principal de São Paulo pour le projet supporté par la fondation de recherches de São Paulo - FAPESP.

Car Verjovski-Almeida a expliqué, seulement 2% du génome humain produit les molécules d'ARN messager, qui diffusent l'information génétique ont eu besoin pour la synthèse des protéines. L'autre 98%, ancien écarté en tant que « camelote ADN », produit différents types d'ARN nommé noncoding parce qu'ils ne sont pas généralement traduits en protéines mais module l'expression des gènes voisins ou l'action des protéines produites par ces gènes. En d'autres termes, ils régissent le fonctionnement du génome au moyen de règlement épigénétique - ne modifiant pas ADN lui-même mais influençant l'expression du gène.

« Ces lncRNAs sont les régulateurs puissants de l'expression du gène. Ils agissent l'un sur l'autre avec et magnifient l'effet des protéines de réglementation. Est ce ce que nous croyons que les molécules que nous avons recensées font aux récepteurs aux androgènes dans une tumeur de prostate, » a indiqué Verjovski-Almeida, qui est également un professeur à l'université de l'institut de la chimie de São Paulo (IQ-USP).

L'enquête FAPESP-supportée a commencé par ordonnancer profondément des molécules exprimées en lignée cellulaire de cancer de la prostate. La technique de profond-ordonnancement permet à des milliards de nucléotides d'être ordonnancés en même temps, augmentant la probabilité de trouver les molécules qui sont exprimées en petites quantités et qui passeraient inapperçues dans des études plus superficielles.

« Plus nous ordonnançons un tissu plus profondément, plus nous découvrons des molécules d'ARN exprimées particulièrement au site en question, de même que type la caisse pour des lncRNAs, » Verjovski-Almeida a dit.

Environ 3.000 lncRNAs différents exprimés en tumeurs de prostate avaient été déjà décrits dans la littérature scientifique. L'étude réalisée par le groupe à l'institut de Butantan a indiqué encore 4.000 molécules nouvelles du même genre.

À la lumière de ces découvertes neuves, les chercheurs alors décidés pour réanalyser des données brutes des études publiées par d'autres groupes dans lesquels les molécules exprimées en tumeurs des patients présentant le cancer de la prostate étaient avec ceux ont exprimé en tissu sain de prostate.

« La plupart de ces études précédentes ont employé la méthode de puce ADN, qui ordonnance le tissu utilisant une Commission des gènes cibles connus. Les gènes tellement inconnus ou les gènes non compris dans la Commission simplement n'apparaissent pas dans les résultats de l'analyse, même si ils sont exprimés en tissu, » Verjovski-Almeida ont dit.

Quand ils ont réanalysé les données brutes de la recherche précédemment publiée, le groupe d'institut de Butantan a constaté que 65 lncRNAs plus hautement ont été exprimés en tumeurs de prostate qu'en tissu sain.

« Les études d'original avaient recensé l'expression accrue seulement de 40 de ces molécules. Le reste ont été réussis plus de faute de benchmark complet sur des lncRNAs de prostate. Ce sont des gènes qui pourraient être impliqués dans le développement du cancer de la prostate et devoir être explorés mieux, » Verjovski-Almeida ont dit.

Règlement d'action hormonale

La prochaine opération était de découvrir si ces lncRNAs ont agi l'un sur l'autre avec des récepteurs aux androgènes. Pour faire ainsi, les chercheurs avaient l'habitude une technique connue sous le nom d'immunoprécipitation d'ARN (RIP).

« Nous avons trouvé plus de 600 lncRNAs liés aux récepteurs aux androgènes dans des tumeurs de prostate. Ce sont des molécules qui grippent au composé constitué par l'androgène et son récepteur au noyau de cellules, probablement afin du contrôle fin du processus d'activation et d'inhibition de gène, » Verjovski-Almeida ont dit.

Des récepteurs aux androgènes sont connus pour être capables de gripper à plus de 10.000 sites différents de génome lors de la migration aux noyaux de cellules. Cependant, ils ne modifient pas l'expression de 10.000 gènes quand ceci se produit.

« Afin de découvrir ce qui sera activé et empêché, nous avons besoin d'un programme complémentaire, et nous croyons que certains des lncRNAs recensés jouez en effet ce rôle, » a indiqué le chercheur financé par FAPESP.

La prochaine technique employée par le groupe était un algorithme d'apprentissage automatique, un type d'outil d'artificial intelligence qui analyse un grand nombre de caractéristiques par des méthodes statistiques à la recherche de répéter les configurations qui peuvent être employées comme base de la prévision ou de la prise de décision. De cette manière, ils ont constaté que les lncRNAs étaient présents aux sites de génome où l'expression du gène a été modifiée (activé ou inhibé) par des récepteurs aux androgènes.

Les mêmes sites se sont également avérés pour contenir les concentrations de certaines histones, une famille des protéines fondamentales qui modulent l'organisme spatial de l'ADN au noyau et activent ou empêchent l'expression du gène. D'une façon générale, les gènes étaient plus en activité en présence de ces protéines de réglementation.

« Nous ne pouvons pas encore dire si la présence de ces lncRNAs est une cause ou un effet de l'abondance de certaines histones de commande et de l'altération à l'expression du gène, mais le fait est qu'ils marquent des régions spécifiques des gènes qui sont activés ou empêchés en présence de l'androgène. Avec ces découvertes, nous avons établi une Commission des régulateurs possibles de l'action du récepteur dans le cancer de la prostate, » Verjovski-Almeida a dit.

Seulement un de ces lncRNAs avait été montré au grippage aux récepteurs aux androgènes et lié à l'agressivité accrue de tumeur dans la recherche précédente, il a ajouté.

« Il se peut que plus de ces 600 lncRNAs que nous avons trouvé pour gripper au récepteur agissent également par un mécanisme assimilé, » il a dit. « Si vous recensez les lncRNAs qui règlent les gènes importants, vous pouvez essayer d'intervenir dans leur transcription ou dans le procédé réglementaire. Il ouvrent un monde des possibilités. »

Source : http://agencia.fapesp.br/rna-molecules-appear-to-regulate-action-of-male-hormone-in-prostate-cancer/28247/