De onderzoekers ontwerpen modelleringssysteem om verband tussen genen, drugs, en hun milieu te concluderen

Een team van onderzoekers op de School Icahn van Geneeskunde bij Onderstel Sinai en de Universiteit van Washington heeft een modelleringssysteem ontworpen dat integreert genomic en tijdelijke informatie om oorzakelijk verband tussen genen, drugs, en hun milieu te concluderen, dat voor een nauwkeurigere voorspelling van hun interactie in tijd toestaat. Het werk wordt in een document beschreven vandaag in de Mededelingen die van de Aard wordt gepubliceerd.

Het „begrip van hoe het milieu van een persoon, het dieet, de medicijnen, en andere factoreneffect ziekte-geassocieerde trekken in tijd het potentieel hebben het risico van een individu van ziekte nauwkeuriger om te modelleren,“ zegt Eric Schadt, Doctoraat, Dean voor de Geneeskunde van de Precisie op de School Icahn van Geneeskunde bij Onderstel Sinai; CEO van Sema4, een Sinai van het Onderstel onderneming; en een medeauteur van het document. „Dit zal de toekomst van precisiegezondheid of gepersonaliseerde geneeskunde.“ zijn

Gezien de ingewikkeldheid van biologische systemen, geloofden de wetenschappers op de School Icahn van Geneeskunde dat het slechts mogelijk zou zijn om de nauwkeurigheid van voorspellingshulpmiddelen te verhogen door genuitdrukking en andere gegevens in antwoord op diverse storingen op veelvoudige punten in tijd te onderzoeken. De hulpmiddelen leidden zij maatregelen zowel tot statische als dynamische veranderingen om het Web van oorzakelijke verhoudingen onder moleculaire elementen te identificeren die omhoog regelgevende netwerken maken.

„Voorspellen van het gedrag van biologische systemen is enorm moeilijk omdat zij zo dynamisch zijn, aanpassend als voorwaardenvraag. Het is slechts door zo veel gegeven te ontginnen aangezien mogelijk dat wij betrouwbaardere resultaten over kunnen produceren hoe iedereen de gezondheid als resultaat van blootstelling aan zekere milieu of andere elementen zou kunnen veranderen,“ bovengenoemde Jun Zhu, Doctoraat, Professor van Genetica en Wetenschappen Genomic bij de School Icahn van Geneeskunde, Hoofd van de Wetenschappen van Gegevens bij Sema4, en hogere auteur van de publicatie. „Onze nieuwe hulpmiddelen bieden een fundamentele stap voorwaarts door genomic gegevens in tijd aan te analyseren. Dit type van benadering zal bijzonder nuttig voor medisch onderzoek bij het verouderen zijn en kon uiteindelijk onze capaciteit verbeteren om ziekterisico te voorspellen, dat vroegere acties mogelijk maakt om ziekte totaal te behandelen of te verhinderen. “

De wetenschappers evalueerden hun hulpmiddelen door een genetisch heterogeene die bevolking van gistcellen te analyseren met rapamycin worden behandeld, een potentiële anti-veroudert drug, die de bevolking profileert op veelvoudige tijdpunten. De resultaten toonden aan dat de nieuwe benadering een significante hoeveelheid verenigingen tussen de variatie van DNA en van de genuitdrukking variatie, vooral voor op verouderen betrekking hebbende genen identificeerde, wijzend op het veranderende effect van genetische variaties in tijd. Verder, bleek deze benadering betrouwbaarder in het identificeren van oorzakelijke regelgevers van gen-drug interactie, in vergelijking met conventionele methodes gebruikend slechts één enkel tijdpunt.

„Dit document toont de verbeteringen van het concluderen van genetische die oorzaken van ziekte aan door hoog-resolutie moleculaire te profileren worden toegelaten. Aangezien de wetenschappers meer en meer bekwaam worden om informatie zoals tijdelijk, eencellig, en micromilieu op te nemen die in studies profileren, zullen de algoritmen zoals beschreven in het document van Dr. Lin's aan hefboomwerking dergelijke gegevens worden in evenwicht gehouden om meer en meer nauwkeurige modellen van de moleculaire bestuurders van ziekte te concluderen die kunnen worden gebruikt om betere nieuwe therapie te ontwerpen.“ bovengenoemde Adam Margolin, Doctoraat, Stoel van het Ministerie van Genetica en Wetenschappen Genomic en Hogere Verwante Dean voor de Geneeskunde van de Precisie op de School Icahn van Geneeskunde.

Bron: https://www.mountsinai.org/about/newsroom/2018/mount-sinai-researchers-build-modeling-systems-identifying-gene-drug-and-environment-interactions

Advertisement