Forskare planlägger att modellera systemet för att innebära förhållanden mellan gener, droger och deras miljö

Ett lag av forskare på Icahnen skolar av medicin på Mount Sinai, och universitetar av Washington har planlagt ett modellera system, som integrerar genomic och temporal information för att innebära en tillfällig bekantskap mellan gener, droger och deras miljö och att låta för en exaktare förutsägelse av deras växelverkan med tiden. Arbetet beskrivas i ett pappers- som i dag publiceras i naturkommunikationer.

”Dela upp i faktorer överenskommelse, hur en persons miljö, bantar, läkarbehandlingar och annan får effekt sjukdom-tillhörande drag har med tiden det potentiellt till exaktare att modellera en individ riskerar av sjukdom,” något att säga Eric Schadt, PhD, dekanen för precisionmedicin på Icahnen skolar av medicin på Mount Sinai; vd av Sema4, ett Mount Sinai företag; och enförfattare av det pappers-. ”Ska detta är framtiden av den vård- eller personifierade medicinen för precision.”,

Givet komplexiteten av biologiska system, skolar forskare på Icahnen av den trodde medicinen att den skulle är endast möjligheten till förhöjning som exaktheten av förutsägelsen bearbetar, genom att undersöka genuttryck och andra data som svar på olika perturbations på multipeln pekar med tiden. Bearbetar dem skapade mäter både statisk elektricitet och dynamiska ändringar för att identifiera rengöringsduken av en tillfällig bekantskap bland molekylära beståndsdelar som det reglerande sminket knyter kontakt.

”Är förutsägelsen uppförandet av biologiska system tremendously svår, därför att de är så dynamiska och att anpassa som villkorar begäran. Den är, endast genom att bryta så mycket data som möjligheten som vi kan frambringa pålitligare resultat om, hur någon vård- styrkaändring som ett resultat av exponering till bestämda miljö- eller andra beståndsdelar,”, sade Jun Zhu, PhD, professor av genetik, och Genomic vetenskaper på Icahnen skolar av medicin, huvudet av datavetenskaper på Sema4 och den höga författare av publikationen. ”Bearbetar vårt nytt erbjudande som en grund kliver framåtriktat, genom att analysera genomic data med tiden. Denna typ av att närma sig ska är bestämt användbar för medicinsk forskning på att åldras och ultimately kunde förhöja vår kapacitet att förutsäga att sjukdomen riskerar, tidigare ingripandemöjlighet för danande till fest eller förhindrar sjukdomen alldeles. ”,

Forskarna utvärderade deras bearbetar, genom att analysera en genetiskt heterogen befolkning av jästceller som behandlades med rapamycin, en potentiell anti-åldras drog som profilerar befolkningen på multipeltid, pekar. Resultaten visade att de nya att närma sig identifierade ett viktigt belopp av anslutningar mellan DNA-variation och genuttrycksvariation, speciellt för åldras-släkta gener och att reflektera ändra får effekt av genetiska variationer med tiden. Vidare att närma sig detta bevisad pålitligare, i att identifiera causal regulatorer av gen-drogen växelverkan som jämförs till konventionella metoder som använder endast en singeltid, pekar.

”Visar detta pappers- förbättringarna, i att innebära som är genetiskt, orsakar av sjukdomen som möjliggöras av hög-upplösning molekylärt profilera. Som forskare blir mer och mer kompetent till införlivad information liksom temporal, balanseras singel-cellen och microenvironmenten som profilerar in i studier, algoritmer liksom den som beskrivas i ska pappers- för Dr. Lins, för att utnyttja sådan data för att innebära mer och mer exakt modellerar av de molekylära chaufförerna av sjukdomen som kan vara den van vid designen förbättrade nya terapier.”, said Adam Margolin, PhD, stolen av avdelningen av genetik och den Genomic hög förbundna dekanen för vetenskaper och för precisionmedicin på Icahnen skolar av medicin.

Källa: https://www.mountsinai.org/about/newsroom/2018/mount-sinai-researchers-build-modeling-systems-identifying-gene-drug-and-environment-interactions

Advertisement