研究員設計塑造系統推斷基因、藥物和他們的環境之間的關係

研究員小組在 Icahn 醫學院在西奈山的和華盛頓大學設計了集成基因組和臨時信息推斷基因,藥物之間的原因關係和他們的環境的一個塑造的系統,隨著時間的推移允許他們的交往的一個更加準確的預測。 工作在本質通信今天發表的論文被描述。

「知道人員的環境、飲食、治療和其他系數影響疾病關聯性格如何更加準確地隨著時間的推移有潛在對設計疾病的單個的風險」,埃里克 Schadt, PhD,精確度醫學的教務長說在 Icahn 醫學院在西奈山的; Sema4,西奈山事業的 CEO; 并且本文的共同執筆者。 「這將是遠期精確度健康或個性化的醫學」。

假使生物系統的複雜,科學家在 Icahn 醫學院相信通過隨著時間的推移檢查基因表達和其他數據增加預測工具的準確性只是可能的以回應多種擾動在多點。 工具他們造成評定靜態和動態更改為了識別原因關係萬維網在組成管理網絡的分子要素中的。

「預測生物系統工作情況是非常地困難的,因為他們是很動態的,適應,因為情況需求。 它仅是通過開採同樣多數據,像可能我們可以生成關於由於對某些環境或其他要素的暴露任何人的健康如何的更加可靠的結果也許更改」,說 PhD 6月朱,遺傳學和基因組科學教授在 Icahn 數據科學醫學院,題頭在 Sema4 和發行的高級作者。 「我們的新工具通過隨著時間的推移分析基因組數據提供一個基本進步。 此種途徑為對老化的醫學研究將是特別有用的和能根本地提高我們的能力預測疾病風險,使更加早期的干預成為可能一共對待或防止疾病。 」

科學家通過分析酵母細胞的基因上異種人口評估了他們的工具對待與 rapamycin,一種潛在的防皺藥物,描出人口在多個時間點。 結果顯示出,新的途徑識別在脫氧核糖核酸差異和基因表達差異之間的巨大數量的關聯,特別是老化關連的基因的,隨著時間的推移反射基因差異的更改的影響。 進一步,此途徑證明的可靠在識別基因藥物交往原因管理者,與常規方法比較使用仅時間點。

「本文展示在推斷更加高分辨率分子描出啟用的疾病的基因原因的改善。 因為科學家變得越來越能合併信息例如臨時,單細胞和描出到研究的小環境,算法例如在林博士的文件描述的那個將保持平衡利用這樣數據推斷越來越可以用於設計被改進的新穎的療法疾病分子驅動器的準確設計」。 精確度醫學的前述亞當 Margolin、遺傳學的部門的 PhD、主席和基因組科學和前輩教務長在 Icahn 醫學院。

來源: https://www.mountsinai.org/about/newsroom/2018/mount-sinai-researchers-build-modeling-systems-identifying-gene-drug-and-environment-interactions

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