La protéine neuve ordonnançant la technique a pu révolutionner la recherche biomédicale

Les chercheurs à l'Université du Texas chez Austin ont expliqué une approche neuve à l'ordonnancement de protéine qui est beaucoup plus sensible que la technique actuelle.

La technique neuve permet à différentes protéines d'être recensées, plutôt qu'exigeant des millions de eux d'être déterminés simultanément.

Le développement pourrait avoir des implications importantes pour la recherche biomédicale, la facilitant pour trouver des biomarqueurs neufs pour la maladie, ainsi qu'améliorant la compréhension de la façon dont le tissu sain fonctionne.

L'avancement est le résultat du travail a commencé il y a six ans par M. Edouard Marcotte et les collègues, qui étaient intéressés à adapter les méthodes ont employé dans le prochain rétablissement ordonnançant (NGS) à l'ordonnancement de protéine.

De la même manière que NGS a activé l'ordonnancement rapide et précis du génome entier, la technologie développée par l'équipe fournit vite et les informations détaillées au sujet des dizaines de milliers de protéines impliquées dans la santé et la maladie.

Nous avons produit, essentiellement, une technologie comme un ADN pour étudier des protéines.

M. Edouard Marcotte, chercheur de fil

Dans beaucoup de maladies telles que le cancer, le diabète et l'Alzheimer, cellules produisent les protéines qui servent de seuls empreintes digital ou biomarqueurs à la maladie.

L'amélioration du dépistage de ces biomarqueurs aiderait des chercheurs mieux à comprendre les maladies et à activer plus tôt et plus de diagnostic précis.

La norme de courant pour l'ordonnancement de protéine - spectrométrie de masse - n'est souvent pas sensible et n'exige pas d'environ un million de copies d'une protéine d'être présentes pour qu'elle soit trouvée.

La technique est également « débit inférieur, » trouvant seulement quelques mille types de protéine dans un échantillon unique.

Comme signalé dans la biotechnologie de nature de tourillon, la méthode neuve, molécule unique appelée fluorosequencing, permet à des millions de différentes protéines d'être ordonnancés simultanément dans un échantillon unique.

Avec davantage d'amélioration de la technique, Marcotte est plein d'espoir que ce numéro pourrait être augmenté pour atteindre dans les milliards.

Le haut débit et la sensibilité de la technique neuve avec la norme actuelle devraient améliorer le dépistage des biomarqueurs de la maladie et permettre à des scientifiques d'étudier les maladies telles que le cancer d'une voie entièrement neuve.

Regardant une tumeur un niveau unicellulaire, par exemple, pourrait permettre à des chercheurs de voir comment une tumeur évolue la forme une petite collection de cellules identiques à une grande masse des cellules génétiquement diverses avec différentes propriétés. De telles analyses ont pu préparer le terrain pour des approches neuves à viser le cancer.

Université du Texas chez Austin Crédit : Université du Texas chez Austin

Les points dans cette illustration ne sont pas des étoiles, ils sont des millions de protéines comme vu un microscope. Chaque protéine se lève comme une lame d'herbe avec seulement les bouts tout visibles que nous examinons vers le bas de ci-avant.

Les protéines sont des réseaux des acides aminés, ainsi chaque point est juste l'acide aminé sur le bout. Des 20 saveurs des acides aminés qui composent des protéines, un type est jaune étiqueté, un un autre est rose étiqueté, les autres 18 ne sont pas étiquetés, elles sont noir.

En éliminant un acide aminé de chaque protéine, en prenant une photo neuve et puis en répétant beaucoup de fois, les chercheurs peuvent enregistrer une séquence des acides aminés pour chaque protéine dans un échantillon de millions simultanément.

Source :

Cet article est basé sur un communiqué de presse par l'Université du Texas chez Austin.

Source:
Sally Robertson

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Sally Robertson

Sally has a Bachelor's Degree in Biomedical Sciences (B.Sc.). She is a specialist in reviewing and summarising the latest findings across all areas of medicine covered in major, high-impact, world-leading international medical journals, international press conferences and bulletins from governmental agencies and regulatory bodies. At News-Medical, Sally generates daily news features, life science articles and interview coverage.

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