Le logiciel novateur jette la lumière neuve sur des procédés génétiques étant à la base des maladies mortelles

Le logiciel novateur développé par l'université des scientifiques de Leicester jette la lumière neuve sur le renivellement génétique des agents pathogènes mortels responsables de la méningite et de la gastro-entérite.

Le logiciel, « PhasomeIt » appelé, balaye rapidement par de grands ensembles de génomes et recense leurs gènes variables de phase, tandis qu'également comparant tous ces gènes contre un des des autres. Ceci peut aider dans notre compréhension des procédés génétiques étant à la base d'une gamme des maladies mortelles.

Les chercheurs de l'université de Leicester, aboutie par M. Chris Bayliss à partir de la biologie de Service de Génétique et de génome, ont appliqué ce logiciel à un grand nombre de séquences de génome pour deux familles des bactéries - le Neisseria meningitidis (une cause significative de méningite) et le Campylobacter jejuni (la plupart de cause fréquente de gastro-entérite d'origine alimentaire). Les études ont été publiées dans le tourillon PLOS un et la génomique microbienne.

M. Bayliss a expliqué : « Nous et d'autres prévoyons que l'analyse en profondeur de ces grands ensembles de génomes jettera la lumière sur la façon dont ces agents pathogènes s'adaptent à la durée chez leurs hôtes d'être humain et de volaille et la façon dont les altérations génétiques peuvent mener aux infections nuisibles. »

L'ADN moderne ordonnançant des technologies produisent maintenant un énorme volume - la teneur génétique entière d'un organisme - d'information « génomique » pour beaucoup de différents organismes - des êtres humains vers le bas aux micros-organismes.

Dans de nombreux cas il y a même excessives caractéristiques à analyser effectivement avec le logiciel actuellement disponible.

« Un mécanisme que chacun des deux bactéries emploient pour adapter à ambiant et des pressions d'hôte est la commutation réversible mise en marche/arrêt des gènes qui codent des molécules responsables des interactions avec l'hôte, » explique Joe Wanford, un stagiaire de PhD travaillant à la recherche à l'université de la biologie du Service de Génétique et du génome de Leicester.

« Dans de nombreux cas ce procédé est avantageux parce que « gène SUR condition le » tient compte d'une interaction serrée avec des surfaces de cellule hôte (comme dans la gorge), alors que « HORS de la condition » tient compte de l'évasion des anticorps d'hôte qui peuvent éventuel avoir comme conséquence la mort des bactéries. Certains de ces gènes variables de soi-disant « phase peuvent être facilement recensés à cause du détail recensant des caractéristiques de leur ADN, mais jusqu'ici il n'y avait aucune voie d'analyser rapidement la présence, et distribution de ces gènes en travers des génomes multiples. »

Les analyses de l'équipe ont indiqué que des gènes variables de phase sont en grande partie partagés entre pathogènes (qui entraînent la maladie), et (qui vivent dans votre fuselage, sans endommager) substance commensale des bactéries, mais que les légères différences en présence, ou l'expression de ces gènes peuvent jouer un rôle dans le passage de la colonisation asymptomatique de nos fuselages, à la véritable maladie.

Le travail est maintenant actuel dans leur laboratoire pour caractériser les rôles spécifiques de ces gènes dans le procédé de la maladie.

M. Bayliss a ajouté : « Nous croyons que notre logiciel neuf sera critique en analysant d'un volume toujours croissant de séquences de génome, et continuera à jeter les analyses principales dans les durées de vie utile de nos symbionts bactériens. »

Source : https://le.ac.uk/