Il software innovatore fa il nuovo indicatore luminoso sui trattamenti genetici che sono alla base delle malattie micidiali

Il software innovatore sviluppato dall'università di scienziati di Leicester sta facendo il nuovo indicatore luminoso sul trucco genetico degli agenti patogeni micidiali responsabili della meningite e della gastroenterite.

Il software, chiamato “PhasomeIt, scandisce rapido attraverso i grandi insiemi dei genoma ed identifica i loro geni variabili di fase, mentre anche comparando tutti questi geni ad uno un altro. Ciò può aiutare nella nostra comprensione dei trattamenti genetici che sono alla base di un intervallo delle malattie micidiali.

I ricercatori dall'università di Leicester, piombo dal Dott. Chris Bayliss dal dipartimento della genetica e della biologia del genoma, hanno applicato questo software a tantissime sequenze del genoma per due famiglie dei batteri - jejuni di neisseria meningitidis (una causa significativa di meningite) e del campilobatterio (la causa più frequente di gastroenterite portata dagli alimenti). Gli studi sono stati pubblicati nel giornale PLOS uno e nella genomica microbica.

Il Dott. Bayliss ha spiegato: “Noi ed altri prediciamo che l'analisi approfondita di questi grandi insiemi dei genoma farà luce su come questi agenti patogeni si adattano a vita presso i loro host del pollame e dell'essere umano e su come i cambiamenti genetici possono piombo alle infezioni nocive.„

Il DNA moderno che ordina le tecnologie ora redige un volume enorme - l'intero contenuto genetico di un organismo - di informazioni “genomiche„ per molti organismi differenti - dagli esseri umani giù ai microrganismi.

In molti casi ci sono anche troppi dati efficacemente da analizzare con software attualmente disponibile.

“Un meccanismo che entrambi batteri usano per adattare ad ambientale e pressioni ospite è la commutazione reversibile inserita/disinserita dei geni che codificano le molecole responsabili delle interazioni con il host,„ spiega Joe Wanford, uno studente di PhD che lavora alla ricerca nell'università di dipartimento di Leicester della genetica e della biologia del genoma.

“In molti casi questo trattamento è vantaggioso perché “il gene sullo stato„ tiene conto un'interazione stretta con le superfici della cellula ospite (quale nella gola), mentre “FUORI dallo stato„ tiene conto l'evasione degli anticorpi ospite che possono infine provocare la morte dei batteri. Alcuni di questi geni variabili di cosiddetta “fase„ possono essere identificati facilmente a causa delle funzionalità d'identificazione specifiche del loro DNA, ma finora non c'era modo analizzare rapidamente la presenza e distribuzione di questi geni attraverso i genoma multipli.„

Le analisi del gruppo hanno indicato che i geni variabili di fase in gran parte sono divisi fra patogeni (che causano la malattia) e (che vivono nel vostro organismo, senza causare il danno) specie commensali di batteri, ma che le leggere differenze nella presenza, o l'espressione di questi geni possono svolgere un ruolo nella transizione da colonizzazione asintomatica dei nostri organismi, alla malattia completa.

Il lavoro ora è in corso nel loro laboratorio caratterizzare i ruoli specifici di questi geni nel trattamento di malattia.

Il Dott. Bayliss ha aggiunto: “Crediamo che il nostro nuovo software sia critico nell'analizzare di un volume in continuo aumento di sequenze del genoma e continui a spargere le comprensioni chiave nei cicli di vita dei nostri symbionts batterici.„

Sorgente: https://le.ac.uk/