O software informático inovativo derrama a luz nova nos processos genéticos que são a base de doenças mortais

O software informático inovativo desenvolvido pela universidade de cientistas de Leicester está derramando a luz nova na composição genética dos micróbios patogénicos mortais responsáveis para a meningite e a gastroenterite.

O software, chamado “PhasomeIt, faz a varredura ràpida através dos grandes grupos de genomas e identifica seus genes variáveis da fase, enquanto igualmente comparando todos estes genes contra um outros. Isto pode ajudar em nossa compreensão dos processos genéticos que são a base de uma escala de doenças mortais.

Os pesquisadores da universidade de Leicester, conduzida pelo Dr. Chris Bayliss do departamento da genética e da biologia do genoma, aplicaram este software a um grande número seqüências do genoma para duas famílias das bactérias - meningitidis do Neisseria (uma causa significativa da meningite) e jejuni do Campylobacter (a causa a mais freqüente da gastroenterite foodborne). Os estudos foram publicados no jornal PLOS um e na genómica microbiana.

O Dr. Bayliss explicou: “Nós e outro prevemos que a análise detalhada destes grandes grupos de genomas derramará a luz em como estes micróbios patogénicos se adaptam à vida dentro de seus anfitriões do ser humano e das aves domésticas e em como as mudanças genéticas podem conduzir às infecções prejudiciais.”

O ADN moderno que arranja em seqüência tecnologias produz agora um volume enorme - o índice genético inteiro de um organismo - de informação “genomic” para muitos organismos diferentes - dos seres humanos para baixo aos micro-organismos.

Em muitos casos há mesmo demasiados dados a analisar eficazmente com software informático actualmente disponível.

“Um mecanismo que both of these bactérias se usam para adaptar a ambiental e pressões do anfitrião é o interruptor reversível de ligar/desligar dos genes que codificam as moléculas responsáveis para interacções com o anfitrião,” explica Joe Wanford, um aluno de doutoramento que trabalha na pesquisa na universidade do departamento de Leicester da genética e da biologia do genoma.

“Em muitos casos este processo é vantajoso porque “gene no estado o” permite uma interacção apertada com superfícies da pilha de anfitrião (como na garganta), visto que “FORA do estado” permite a evasão dos anticorpos do anfitrião que podem finalmente conduzir à morte das bactérias. Alguns destes genes variáveis da “fase assim chamada” podem facilmente ser identificados devido ao específico que identifica características de seu ADN, mas até aqui não havia nenhuma maneira de analisar rapidamente a presença, e distribuição destes genes através dos genomas múltiplos.”

As análises da equipe indicaram que os genes variáveis da fase estão compartilhados pela maior parte entre patogénico (que causam a doença), e (que vivem em seu corpo, sem causar dano) espécie comensal de bactérias, mas que as diferenças ligeiras na presença, ou a expressão destes genes podem jogar um papel na transição da colonização assintomática de nossos corpos, à doença desenvolvida.

O trabalho é agora em curso em seu laboratório caracterizar os papéis específicos destes genes no processo da doença.

O Dr. Bayliss adicionou: “Nós acreditamos que nosso software novo será crítico na análise de um volume crescente de seqüências do genoma, e continuará a derramar as introspecções chaves nos ciclos de vida de nossos symbionts bacterianos.”

Source: https://le.ac.uk/