Les scientifiques traduisent la plus longue séquence d'ADN toujours continue

Les scientifiques à l'université de Nottingham ont traduit jusqu'à présent la plus longue séquence d'ADN continue, mesurant environ 10.000 fois plus longtemps un ordonnancement que normalement s'affiche et deux fois tant que le détenteur d'un record précédent.

Séquence dCrédit d'image : fotohunter/Shutterstock

Dans l'ordonnancement normal, l'ADN est divisé en éclats et par la suite rassemblé pendant que la séquence est affichée.

L'équipe de recherche, aboutie par M. Matt Loose à partir de l'université de Nottingham, a employé l'ADN humain continuement à la séquence 2,3 millions de paires de bases. Pour la mettre dans le point de vue, la longueur la plus courante de l'ADN à afficher est 150 paires de bases.

La mesure continue de l'ADN a été réalisée utilisant un « nanopore » ordonnançant la machine. Un courant ionique est réussi par le nanopore et la machine mesure tous les changements du courant pour recenser quel nucléotide est présent (guanine, adénine, thymines, ou cytosine).

La machine de ordonnancement est la plus tardive dans une série de développements qui tiennent compte de meilleur marché et de plus de haut-débit ADN ordonnançant, nous portant une opération plus près de médicament personnalisé.

Le problème avec des techniques de ordonnancement précédentes a été la nécessité de rassembler correctement le génome des courtes séquences d'ADN. Pour surmonter cette édition, la séquence chevauchante utilisée par scientifiques s'affiche pour recenser correctement l'emplacement normal de l'éclat qu'elles ont ordonnancé dans le génome humain.

M. Martin Smith et son organisme de recherche en Australie a brisé la première fois 1 million de paires de bases d'étape en 2017. Utilisant la technique neuve développée par le M. Loose et collègues, les moyens là sont moins courts s'affiche pour rassembler. Théoriquement, l'ordonnancement de nanopore devrait activer l'ordonnancement de n'importe quelle longueur d'ADN.

le Long-Read ADN ordonnançant, pendant qu'il se nomme, a plusieurs avantages par rapport aux technologies de court-Read où l'ADN est divisé et rassemblé. Par exemple, les technologies de court-Read ont la difficulté avec les structures répétitives dans le génome.

l'ordonnancement du Long-Read ADN pourrait à l'avenir être employé pour trouver et caractériser les agents pathogènes en nourriture, les maladies de contrôle d'aide chez les animaux, et diagnostique des infections.

Le prochain objectif pour ordonnancer des technologies est la capacité d'ordonnancer continuement un chromosome humain entier.

Si l'ordonnancement d'un chromosome entier est continuement même possible reste à voir comme nombre d'interruptions là sont dans un chromosome est encore inconnu.

Je ne suis pas sûr vous pourrai jamais ordonnancer un chromosome d'une extrémité à l'autre. »

M. Loose, chef d'étude

Sources

La plus longue séquence d'ADN du monde traduite

Comment l'ordonnancement du nanopore DNA/RNA fonctionne-t-il ?

Sara Ryding

Written by

Sara Ryding

Sara is a passionate life sciences writer who specializes in zoology and ornithology. She is currently completing a Ph.D. at Deakin University in Australia which focuses on how the beaks of birds change with global warming.

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