Gli scienziati decodificano la sequenza mai continua del DNA più lunga

Gli scienziati all'università di Nottingham hanno decodificato la sequenza del DNA continua più lunga fin qui, misurando intorno 10.000 volte più lungamente l'ordinamento del normale legge e due volte finchè il supporto record precedente.

Sequenza del DNA - da fotohunterCredito di immagine: fotohunter/Shutterstock

Nell'ordinamento normale, il DNA è diviso nei frammenti e successivamente è riunito mentre la sequenza sta leggenda.

Il gruppo di ricerca, piombo dal Dott. Matt Loose dall'università di Nottingham, ha usato continuamente il DNA umano alla sequenza 2,3 milione coppie di basi. Per metterlo nella prospettiva, la lunghezza più comune di DNA da leggere è 150 coppie di basi.

La misura continua di DNA è stata raggiunta facendo uso di un sequenziatore “del nanopore„. Una corrente ionica è passata attraverso il nanopore ed il commputer misura tutti i cambiamenti nella corrente per identificare quale nucleotide è presente (guanina, adenina, timine, o citosina).

Il sequenziatore è il più recente in una serie degli sviluppi che tengono conto di alto-capacità di lavorazione più e più economico il DNA che ordina, portantei un punto più vicino a medicina personale.

Il problema con le tecniche d'ordinamento precedenti è stato la necessità di riunire correttamente il genoma dalle brevi sequenze del DNA. Per sormontare questa emissione, la sequenza di sovrapposizione usata scienziati legge per identificare correttamente la posizione normale del frammento che hanno ordinato nel genoma umano.

Il Dott. Martin Smith ed il suo gruppo di ricerca in Australia in primo luogo ha rotto le 1 milione coppie di basi della pietra miliare nel 2017. Facendo uso di nuova tecnica sviluppata dal Dott. Loose e colleghi, i mezzi là sono meno breve leggono per radunare. Teoricamente, l'ordinamento del nanopore dovrebbe permettere all'ordinamento di tutta la lunghezza di DNA.

il DNA del A lungo read che ordina, mentre sta definendo, presenta parecchi vantaggi sopra le tecnologie del breve read dove il DNA è diviso e riunito. Per esempio, le tecnologie del breve read incontrano difficoltà con le strutture ripetitive nel genoma.

l'ordinamento del DNA del A lungo read ha potuto in futuro essere usato per trovare e caratterizzare gli agenti patogeni in alimento, malattie di controllo di guida in animali e diagnostica le infezioni.

Lo scopo seguente per l'ordinamento delle tecnologie è la capacità di ordinare continuamente un intero cromosoma umano.

Se ordinare un intero cromosoma è continuamente anche possibile resta vedere come il numero delle rotture là è in un cromosoma è ancora sconosciuto.

Non sono sicuro voi mai potrò ordinare un cromosoma da un'estremità all'altra.„

Dott. Loose, guida di studio

Sorgenti

Sequenza del DNA più lunga del mondo decodificata

Come l'ordinamento del nanopore DNA/RNA funziona?

Sara Ryding

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Sara Ryding

Sara is a passionate life sciences writer who specializes in zoology and ornithology. She is currently completing a Ph.D. at Deakin University in Australia which focuses on how the beaks of birds change with global warming.

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