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Plate-forme de ordonnancement massive neuve mise en application pour le double dépistage génétique de preimplantation de facteur

Une équipe de recherche de l'Universitat Autònoma De Barcelone (UAB), en collaboration avec le sang et la banque de tissus de la Catalogne, est parvenue à mettre en application une plate-forme de ordonnancement massive pour le dépistage génétique de Preimplantation (PGT) pour la première fois dans l'histoire.

Le travail de recherches a adapté le TruSight une (TSO) plate-forme, une d'aujourd'hui la plupart des Commissions génétiques complètes avec plus de 4.800 gènes responsables des maladies (héréditaires) monogenetic les plus courantes, au double dépistage génétique de Preimplantation de facteur (DF-PGT).

L'étude, publiée dans PLoS UN, a été aboutie par Joaquima Navarro et Jordi Benet, chercheurs du service d'UAB de la biologie cellulaire, de la physiologie et de l'immunologie, et a compris la collaboration de l'équipe aboutie par Francisco Vidal à partir du sang et banque de tissus de la Catalogne.

« Nous sommes avec succès parvenus à mettre en application une stratégie novatrice, prometteuse et universelle, disposée pour un diagnostic simultané des mutations génétiques et d'altération chromosomique dans des embryons obtenus par fécondation in vitro (IVF), d'avantage aux familles de candidat de DF-PGT avec des mutations entraînant les maladies incluses dans la plate-forme de TSO. De plus, elle exige seulement une expérience unique de laboratoire et sans nécessité de préparer au préalable la méthodologie de diagnostic. Ceci accélère considérablement le procédé d'étude et la disponibilité des résultats des troubles du gène unique de la famille. Jusqu'ici, il y avait un besoin de préparer les procédures spécifiques avant de conduire le diagnostic de chacune des mutations », Joaquima Navarro précise.

L'outil neuf permettra pour diagnostiquer des mutations directement et indirectement, qui augmente le niveau de la garantie du diagnostic. En même temps, il tient compte de la caractérisation chromosomique dans des embryons, pour la totalité de chacune des 23 paires de chromosome humain, et trouve si l'embryon est aneuploïde, avec un numéro anormal des chromosomes et pour cette raison non transmissible, ou l'euploïde, avec le numéro correct et pour cette raison viable et avec des possibilités plus grandes d'implantation.

L'équipe aboutie par professeur Navarro a développé la stratégie de DF-PGT en 2009. Une technique pilote avec succès appliquée à de nombreuses reprises depuis lors, elle consiste en analysant à moins d'un même cycle d'IVF les mutations génétiques spécifiques entraînant des maladies héréditaires, ainsi que dotation chromosomique embryonnaire complète (cytogénétique) par une technique d'hybridation génomique comparative. Ceci laisse recenser et sélecter les embryons qui sont exempts de maladies et d'anomalies chromosomiques gênant leur évolution. En 2009, 2013 et 2015, ce groupe était le tout premier pour employer une autre stratégie de DF-PGT pour sélecter les embryons sains et pour aider les progénitures en bonne santé de naissance différente de familles : les jumeaux exempt du syndrome de von Hippel Lindau, des jumeaux libres du syndrome de Lynch, et de deux autres bébés en bonne santé de deux familles en danger de l'anémie falciforme et de la mucoviscidose, respectivement. À ces occasions, les scientifiques ont dû préparer la première fois les méthodes de diagnostic de mutations responsables de la maladie génétique spécifique ; considérant que dans la stratégie actuelle proposée, aucune préparation spécifique n'est nécessaire.

Franchissement des limitations d'ADN en cellules embryonnaires

Le prochain rétablissement ordonnançant (NGS) des techniques représentent un saut géant vers l'avant de la qualité des procédures d'analyse génétique, donnée aux lesquelles elles permettent étudier des millions de séquences d'ADN massivement et simultanément dans une mêmes expérimentent. Ces puissants outils avec succès sont utilisés pour la caractérisation du sang et des prélèvements de tissu, dans laquelle la quantité d'ADN n'est pas un facteur limitatif.

« La méthodologie proposée surmonte les limitations existant jusqu'ici. Elle a été développée pour être appliquée aux groupes de seulement 6-8 cellules de trophoderm de blastocyste avec l'ordonnancement d'un cycle gelé de transfert d'embryons, dans le cas des résultats indiquant une absence des maladies de famille et l'embryon », explique Joaquima Navarro.

Avant de mettre en application la plate-forme neuve il y avait un besoin de déterminer lesquels des quatre systèmes d'amplification de l'ADN les plus utilisés généralement étaient les plus adaptés pour l'identification adéquate des mutations. Les chercheurs étaient ainsi également le tout premier pour conduire une caractérisation chromosomique avec le programme de bio-informatique de Nexus à l'aide de la base de données de TSO.

« L'outil est également d'intérêt dans PGTs avec le risque d'altération chromosomique due à l'âge maternel avancé, altération trouvée dans les chromosomes du père, ainsi qu'en cas de fausses-couches répétées. Également en cas d'oocytes de jeunes donneurs, puisqu'un certain risque d'aneuploidie a été également décrit », le chercheur d'UAB précise.

Les chercheurs sont confiants que cette méthodologie neuve sera bientôt procurable pour l'usage avec la Commission de TSO ou de l'appliquer aux Commissions neuves et bien plus complètes, comme celles capables d'analyser l'exome entier ou le séquençage du génome entier. Ils sont également certains que dans la condition moyenne elle sera appliquée simultanément à beaucoup d'échantillons, réduisant de ce fait son coût.

En plus des chercheurs de l'UAB et du sang et de la banque de tissus de la Catalogne, cette étude a compris la participation des spécialistes de l'institut de recherches d'Hebron de Vall (VHIR), de la fondation de Puigvert, l'en Red de Enfermedades Cardiovasculares (CIBERCV), le centre de Medicina Embrionària (CME), le d'Infertilitat i Reproducció Humana (CIRH) de centre et l'institut de recherche biomédicale d'août pi i Sunyer (IDIBAPS) de Centro de Investigación.

« Notre travail représente très une étape importante dans la ligne de la recherche que nous conduisons sur le dépistage génétique de preimplantation. Un inducteur dans lequel l'UAB était au premier rang mondial pendant les années 1980 sous la direction de professeur de biologie cellulaire Josep Egozcue. Nous aurions aimé partager ces résultats avec lui, il certainement aurait été très satisfaisant », Joaquima Navarro déclare.