Méthode robuste neuve pour profiler au microscope les cellules minuscules

On de la cellule saisit notre travail de fuselages des voies obscures, cette science ne comprend pas encore entièrement. Cela va également pour les cellules immunitaires, qui sont indispensables pour nous protéger contre des graves maladies.

Afin de conquérir cet obstacle, les chercheurs ont déployé beaucoup d'efforts dans trouver des moyens neufs d'étudier les travaux intérieurs de différentes cellules.

- Le défi est non seulement d'isoler une cellule individuelle d'un prélèvement de tissu. Nous également devons trouver une voie de déterminer le fonctionnement de la cellule individuelle, disons Kedar Nath Natarajan, professeur adjoint et investigateur principal au Service de Biochimie et à la biologie moléculaire, université du Danemark du sud.

Dans une étude neuve, aboutie par Kedar Nath Natarajan et XI Chen à partir de l'institut de Wellcome Sanger, une équipe de recherche a développé une méthode neuve pour profiler au microscope les cellules minuscules dans des organes et des tissus.

La méthode neuve leur a permise d'analyser plus de 3000 cellules de la rate, qui est un point névralgique pour toutes sortes de cellules immunitaires ; les cellules qui combattent des infections, mais rendent également l'immunité et la réaction quotidiennes.

Des méthodes neuves continuellement sont développées pour profiler au microscope les cellules minuscules dans des organes et des tissus. Le principe est d'étudier le modèle fondamental d'un organisme c.-à-d. ADN et comment il est empaqueté dans une cellule. Cet emballage désigné sous le nom de la chromatine et des signes que des gènes dans le modèle sont commuté en marche et en arrêt, de ce fait déterminant si ce devient un globule sanguin, une cellule de la peau, une cellule immunitaire, une cellule cancéreuse ou un type différent de cellule.

- Notre méthode neuve profile la chromatine dans des cellules et offre un robuste, évolutif et l'alternative meilleur marché aux méthodes actuelles de condition-de-art, qui exigent l'infrastructure chère, les réactifs spécialisés et les matériels, a indiqué Kedar Nath Natarajan.

En même temps que le premier auteur XI Chen de l'institut de Wellcome Sanger, il a le fil le développement des méthodes neuves et genres de profil des différents de cellules comprenant les cellules immunitaires, les cellules souche etc. Les autres contributeurs de l'institut de Wellcome Sanger sont Ricardo J Miragaia et ce travail a été effectué dans le laboratoire de la Sarah auteur correspondante un Teichmann.

L'abrégé sur du papier donne cette description :

L'analyse pour la chromatine transposase-accessible utilisant l'ordonnancement (ATAC-seq) est très utilisée pour recenser des régions de réglementation dans tout le génome. Cependant, très peu d'études ont été réalisées au niveau unicellulaire (scATAC-seq) dû aux défis techniques. Ici nous avons développé une méthode plaque plaque simple et robuste de scATACseq, combinant le volume franc Tn5 étiquetant avec trier d'unique-noyaux. Nous avons expliqué que notre méthode a fonctionné robuste en travers des systèmes variés, y compris les cellules fraîches et cryopreserved des tissus primaires. Par le profilage plus de 3.000 splenocytes, nous recensons les types distincts de cellule immunitaire et indiquons des régions de réglementation de type-détail de cellules et des facteurs relatifs de transcription.

Source : https://www.sdu.dk/en/om_sdu/fakulteterne/naturvidenskab/nyheder2018/2018_11_26_singlecell