Nuevo método robusto para microscópico perfilar células minúsculas

Muchas de la célula pulsan hacia adentro nuestro trabajo de carrocerías de maneras indeterminadas, esa ciencia no entienden todavía completo. Eso también va para las células inmunes, que son vitales para protegernos contra enfermedades serias.

Para conquistar este obstáculo, los investigadores pusieron mucho esfuerzo en encontrar nuevas maneras de estudiar los trabajos internos de células individuales.

- El reto es no sólo aislar una célula individual de una muestra de tejido. También necesitamos encontrar una manera de determinar la función de la célula individual, decimos Kedar Nath Natarajan, profesor adjunto e investigador principal en el departamento de la bioquímica y la biología molecular, universidad de Dinamarca meridional.

En un nuevo estudio, llevado por Kedar Nath Natarajan y XI Chen del instituto de Wellcome Sanger, un equipo de investigación ha desarrollado un nuevo método para microscópico perfilar células minúsculas dentro de órganos y de tejidos.

El nuevo método permitió que analizaran más de 3000 células del bazo, que es apuroses para toda clase de células inmunes; las células que luchan infecciones, pero también rinden inmunidad y la reacción diarias.

Los nuevos métodos se están desarrollando constante para perfilar microscópico células minúsculas dentro de órganos y de tejidos. El principio es estudiar la heliografía básica de una DNA del organismo es decir y cómo se empaqueta dentro de una célula. Esto que empaqueta se refiere como la cromatina y señales que los genes dentro de la heliografía se cambian por intervalos, así determinando si se convierte en un glóbulo, una célula epitelial, una célula inmune, una célula cancerosa u otro tipo de célula.

- Nuestro nuevo método perfila cromatina dentro de células y ofrece un robusto, escalable y una opción más barata a los métodos actuales del estado-de-arte, que requieren la infraestructura costosa, los reactivos especializados y los equipos, dijo a Kedar Nath Natarajan.

Así como el primer autor XI Chen del instituto de Wellcome Sanger, él tiene guía el revelado de los nuevos métodos y clases del perfil de las diversas de células incluyendo las células inmunes, las células madres etc. Los otros contribuidores del instituto de Wellcome Sanger son Ricardo J Miragaia y este trabajo fue realizado en el laboratorio de la Sarah correspondiente autor un Teichmann.

El extracto del papel da esta descripción:

El análisis para la cromatina transposasa-accesible usando la secuencia (ATAC-seq) es ampliamente utilizado determinar regiones reguladoras en el genoma. Sin embargo, muy pocos estudios se han realizado en el nivel unicelular (scATAC-seq) debido a los retos técnicos. Aquí desarrollamos un método placa-basado simple y robusto del scATACseq, combinando por adelantado el bulto Tn5 que marcaba con etiqueta con la clasificación de los único-núcleos. Demostramos que nuestro método trabajó robusto a través de diversos sistemas, incluyendo las células frescas y cryopreserved de tejidos primarios. Perfilando sobre 3.000 splenocytes, determinamos tipos distintos de la célula inmune y revelamos regiones reguladoras tipo-específicas de la célula y factores relacionados de la transcripción.

Fuente: https://www.sdu.dk/en/om_sdu/fakulteterne/naturvidenskab/nyheder2018/2018_11_26_singlecell