La technique nouvelle trouve des tensions neuves des microbes dans le microbiota fécal humain après la chirurgie d'obésité

Utilisant une seule technique de bio-informatique développée à l'université de l'Alabama à Birmingham, les chercheurs d'UAB ont trouvé l'émergence des tensions neuves des microbes dans le microbiota fécal humain après la chirurgie d'obésité. Ces tensions neuves ont apparu après la perturbation chirurgicale de l'estomac et de l'intestin grêle de supérieur. En revanche, les chercheurs ont constaté que les tensions du microbiota fécal d'intestin humain ont ressemblé à ceux pré-chirurgie trouvée après la chirurgie dans le côlon, qui est la partie plus inférieure du gastro-intestinal, ou GI, région.

Les chercheurs d'UAB ont étudié des patients subissant deux types de chirurgie d'obésité -- gastrectomie du bypass gastrique Roux-en-y et de la chemise. En gastrectomie de chemise, la taille de l'estomac est réduite. le bypass gastrique Roux-en-y réduit également la taille de l'estomac qui reçoit la nourriture, mais elle produit supplémentaire une dérivation chirurgicale du reste de l'estomac et de la première partie de l'intestin grêle.

« Nos résultats prouvent que, quand vous changez la région supérieure de GI avec la chirurgie d'obésité, vous changez également l'environnement d'intestin, ayant pour résultat l'émergence des tensions neuves des microbes, » a dit Casey le lendemain, Ph.D., chef de l'équipe de recherche et professeur émérite dans le service d'UAB de la biologie de cellules, de développement et intégratrice. « En concurrence microbienne pour des éléments nutritifs et espace dans la région de GI, les lauréats sont des tensions neuves qui sont plus compétitives dans l'environnement neuf de région de GI. »

La capacité de la technique d'informatique de distinguer parmi différentes tensions de la même substance avance l'analyse du microbiota humain d'intestin et comment la chirurgie peut modifier la communauté microbienne. Le microbiota humain se compose en grande partie de 500 à 1.000 substances bactériennes qui ont une influence principalement avantageuse sur la santé des personnes, y compris la modulation du système immunitaire et des influences sur le développement de métabolisme et d'organe d'hôte. Les études précédentes du microbiota ont pu déterminer des changements de l'abondance relative d'espèces variées après la chirurgie d'obésité, mais elles ne pourraient pas discerner si ceci pourrait être due au remontage d'une tension d'une substance particulière par une autre tension de cela la même substance.

En 2017, les chercheurs d'UAB avaient employé leur technique -- unique-nucléotide-variante hublot hublot appelée de similitude, ou WSS -- pour prouver à la première démonstration directe que les microbes de distributeur fécaux sont restés dans les bénéficiaires pendant des mois ou des années après les greffes fécales pour soigner des patients avec des infections récurrentes de Clostridium difficile.

Pour l'état publié dans le tourillon humain de Microbiome en décembre, le lendemain et des collègues a analysé les échantillons fécaux pris des patients avant et un à deux ans après la chirurgie d'obésité. L'étude a compris 18 patients subissant le bypass gastrique Roux-en-y et six patients subissant la gastrectomie de chemise.

Quand les échantillons pre-- et goujon-fécaux pour les deux groupes de patients de chirurgie d'obésité étaient comparés, seulement 65 pour cent des rayures de Roux-en-y WSS et 75 pour cent des rayures de la gastrectomie WSS de chemise étaient au-dessus de la coupure limite qui recense des paires relatives. Ceci a signifié que, pour 35 pour cent des paires du microbiota Roux-en-y et 25 pour cent de chemise la gastrectomie appareille, des modifications d'une souche microbienne d'une substance bactérienne à une autre tension s'était produit, et dans certains cas ces changements de la communauté microbienne ont persisté un à deux ans après les fonctionnements. Des changements multiples des tensions de microbe des substances bactériennes variées ont été recensés dedans les la plupart, mais pas tous les, patients de chirurgie d'obésité.

En revanche, pour cinq patients de chirurgie qui ont détruit des segments du côlon sigmoïde, qui est près de l'extrémité de la région de GI, 97 pour cent de comparer de rayures de WSS pre- et échantillons de goujon-chirurgie étaient au-dessus de la coupure, indiquant des tensions stables au fil du temps, en dépit des fonctionnements. Trois de ces patients ont montré une tension neuve unique de microbe dans une substance bactérienne particulière. Les autres deux n'ont eu aucune tension neuve. Ce 97 pour cent sont assimilés à la stabilité du microbiota d'intestin vue sur un ou deux ans dans les gens qui n'ont pas eu un fonctionnement.

« Notre étude décrit, pour la première fois, l'émergence des tensions neuves de microbe dans la communauté fécale après le changement du tractus gastro-intestinal supérieur, » Morrow a dit. « Le plus probablement, les origines des tensions neuves dans la communauté fécale sont les communautés tissu-associées de microbe de l'intestin grêle. Puisque la chirurgie a eu comme conséquence un changement physiologique permanent, les tensions neuves de microbe réfléchissent la réaction à ces changements environnementaux de la région de GI. »

« Dans une implication plus grande, » Morrow a dit, « la réalisation que les êtres humains peuvent héberger des tensions multiples des mêmes microbes nous fournit une plus-value neuve pour la complexité de la communauté humaine de microbe de GI. Il renforce l'importance de nos études actuelles pour examiner le choc que d'autres demandes de règlement de perturbateur de microbiome, telles que des antibiotiques et la chimiothérapie anticancéreuse, ont sur la structure de la communauté de microbe de région de GI. »