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Les chercheurs recensent des sous-types neufs multiples de la plupart de cancer courant d'enfance

Comme des cartographes complétant un plan, les chercheurs ont recensé des sous-types neufs multiples du cancer d'enfance le plus courant--recherchez qui améliorera vraisemblablement le diagnostic et la demande de règlement des patients à haut risque. Les scientifiques d'hôpital des recherches des enfants de St Judas ont abouti l'étude, qui apparaît comme publication en ligne anticipée aujourd'hui en génétique de nature de tourillon.

Les chercheurs utilisés ont intégré l'analyse génomique, y compris l'ARN ordonnançant, pour définir l'horizontal génomique de la leucémie aiguë lymphoblastique de lymphocyte B (BILLE) dans presque 2.000 enfants et adultes. La BILLE est la forme la plus courante de TOUS et du cancer le plus courant chez les enfants. La BILLE reste la principale cause du décès par cancer pédiatrique.

Les chercheurs ont recensé 23 sous-types de BILLE, y compris huit sous-types neufs, avec les configurations ainsi que les résultats génomiques et cliniques distincts. La prévalence de sous-type varie souvent avec l'âge. Plus de 90 pour cent de caisses de BILLE peuvent maintenant être classés par catégorie par le sous-type avec 70 pour cent il y a quelques années.

La « BILLE a la diversité moléculaire remarquable, que nous et d'autres pour raffiner la catégorie et conduisions le développement des médicaments de précision pour améliorer la demande de règlement et les résultats de BILLE, » a dit l'auteur Charles correspondant Mullighan, MBBS, M.D., un membre du Service de Pathologie de St Judas. Une « partie de médicament de précision est un diagnostic moléculaire précis, que cette étude fournit à plus de patients. »

Un changement de sous-type-définition nouveau

L'altération de la transcription factorise le gène PAX5 a défini deux sous-types neufs, y compris PAX5 P80R, comme première leucémie lymphoblastique commencée par une mutation ponctuelle. « Tandis que les mutations secondaires sont nécessaires et concernent souvent la signalisation de kinase, nous montrons que cette mutation ponctuelle nuit le développement des cellules lymphoïdes de B et introduit le développement de la BILLE chez les souris, » Mullighan a dit.

L'autre PAX5 sous-type, PAX5-altered, a été défini par diverse altération dans le gène, y compris des mutations de séquence ou des réarrangements avec un de 24 autres gènes. Ensemble les sous-types PAX5 ont représenté presque 10 pour cent des caisses précédemment uncategorized de BILLE.

Les sous-types neufs comprennent une variété à haut risque de BILLE qui se produit principalement dans les adultes. Elle est définie par le réarrangement des facteurs BCL2 de transcription avec le MYC ou le BCL6. « Ce sous-type a un diagnostic morne, » Mullighan a dit. La « reconnaissance de ce réarrangement de sous-type-définition peut mener à la thérapie alternative pour des patients. » En revanche, un sous-type défini par le réarrangement du gène DUX4 a été associé à un bon pronostic dans les adultes, comme avait été précédemment observé chez les enfants.

Rail de l'expression du gène

L'étude a expliqué la capacité de l'ARN ordonnançant pour recenser les types multiples d'altération génomique, mettant en valeur l'installation de cette technique pour le diagnostic de leucémie, en particulier quand l'ordonnancement d'entier-génome n'est pas procurable. Les exemples en cela étudient les réarrangements chromosomiques inclus ayant pour résultat des gènes de fusion, des profils d'expression du gène et toute autre altération.

« Par cette étude, deux-tiers des patients non caractérisés précédents de BILLE pourraient être classifiés dans différents sous-types avec des profils distincts d'altération génétique et les caractéristiques cliniques, » a dit le Co-premier l'auteur Zhaohui GU, Ph.D., un boursier post-doctoral dans le laboratoire de Mullighan. « Qui peut considérablement accélérer le développement des demandes de règlement personnalisées pour ces patients.

« Nous avons également déterminé un pipeline robuste de catégorie de BILLE basé principalement sur l'ARN ordonnançant les caractéristiques qui peuvent être intégrées dans le diagnostic clinique de TOUS, » GU avons dit.

« En tant que clinicien, ces caractéristiques décrivant la diversité des sous-types de BILLE nous permettront de raffiner nos capacités pronostiques pour différents patients, et éventuel, mèneront au développement des traitements visés neufs qui traiteront plus effectivement la leucémie avec moins effets secondaires, » ont dit le repère co-auteur Litzow, M.D., professeur de médecine à la Mayo Clinic et à la présidence du Comité de leucémie, Eastern Cooperative Oncology Group et l'université américaine du réseau de représentation de radiologie, qui a contribué à l'étude.

Sous-types complémentaires indiqués

Les autres sous-types neuf recensés comprennent :

  • Le réarrangement génétique NUTM1 avec différents gènes d'associé que les chercheurs croient peut être vulnérable à la demande de règlement
  • Réarrangement génétique de HLF aux familles multigéniques, y compris TCF4 ainsi que l'associé précédemment identifié TCF3.
  • Trois sous-types qui configurations de part d'expression du gène assimilées à ceux des sous-types déterminés de BILLE. La catégorie propose que les sous-types neufs, ETV6-RUNX1-like, KMT2A-like et ZNF384-like, aient des profils de risque et des pronostics assimilés au sous-type déterminé pour lequel ils sont nommés.
  • Sous-types complémentaires pilotés par des mutations de séquence, y compris IKZF1 N159Y. Les anciens travaux de St Judas et l'initiative d'OBJECTIF de groupe de l'oncologie des enfants ont montré les mutations IKZF1 (Ikaros) pour être une borne de BILLE à haut risque.

L'étude a compris des patients de St Judas, la DENT et études de coopérative de cancer d'adulte.

Les échantillons patients de plusieurs des sous-types de BILLE sont à la disposition de la communauté scientifique internationale par le St Judas que le portail de caractéristiques ACTIONNENT (moyen public des leucémies Patient-dérivées et augmentées). ACTIONNEZ effectue aux échantillons patient-dérivés de xénogreffe de leucémie gratuit procurable aux chercheurs sans l'obligation de collaborer.