La technologie neuve peut trouver n'importe quel virus qui constitue un danger aux êtres humains

Les chercheurs à l'institut grand du MIT et du Harvard ont développé une méthode de calcul qui conçoit les « amorces » moléculaires pour toutes les souches du virus connues pour infecter des êtres humains. Ceci comprend les virus tels que Zika, qui sont difficiles de trouver en raison de leur abondance inférieure dans les échantillons cliniques.

Virus de Zikamolekuul_be | Shutterstock

L'approche neuve pourrait aider les centres de ordonnancement génomiques en travers de la maladie de moniteur du monde plus effectivement et à bon marché, qui est essentielle pour des manifestations de réglage et de management.

Pendant la manifestation de 2015 to-2016 Zika, les autorités de la santé publiques ont lutté pour contenir l'épidémie, alors qu'éprouvé mondial de chercheurs pour comprendre la génétique du virus.

Cependant, l'abondance inférieure de particules de Zika dans les prises de sang des personnes affectées l'a rendu extrêmement difficile pour que les chercheurs captent le matériel génétique du virus.

Comme signalé dans la biotechnologie de nature de tourillon, Hayden Metsky, Kate Siddle et collègues ont maintenant développé un LOQUET appelé de méthode de calcul, abréviation « la totalisation compacte des objectifs pour l'hybridation complète. » La technologie permet à des chercheurs de concevoir les sondes qui capteront le matériel génétique de n'importe quelle combinaison des microbes, y compris n'importe quelle souche virale connue pour infecter des êtres humains.

Après entrée des génomes de n'importe quel virus humain qui a été téléchargé au centre national pour la base de données de séquence du GenBank de l'information de biotechnologie, le LOQUET déterminera l'ensemble optimal de sondes pour récupérer le matériel génétique.

Ces séquences peuvent alors être envoyées aux compagnies qui synthétisent les sondes de recherches. Ces sondes peuvent alors être employées pour isoler l'ADN microbien désiré de sorte qu'il puisse être ordonnancé, enrichissant de ce fait les échantillons cliniques pour le microbe d'intérêt.

Utilisant cette technique, Metsky et sondes développées par équipe qui les ont aidés pour découvrir que Zika s'était écarté à plusieurs régions géographiques des mois avant des scientifiques avaient pu le trouver. Le potentiel de la technologie d'améliorer le contrôle génomique a pu aviser des tentatives de régler des épidémies à l'avenir.

Car génomique l'ordonnancement devient une partie critique de contrôle de la maladie, outils comme le LOQUET aidera nous et d'autres pour trouver des manifestations plus tôt et pour produire de plus de caractéristiques sur les agents pathogènes qui peuvent être partagés avec les communautés de la recherche scientifiques et médicales plus larges. »

Chrétien Matranga, auteur de Co-sénior

La méthode pourrait également être un puissant outil pour vérifier les fièvres de non disgnostiqué que des chercheurs soupçonnent pour être provoqué par un virus.

Nous sommes excités au sujet du potentiel d'employer l'ordonnancement metagenomic pour jeter la lumière sur ces cas et, en particulier, la possibilité de faire tellement localement dans les pays affectés. »

Kate Siddle, auteur de Co-sénior

Le logiciel de LOQUET a été effectué publiquement - procurable et peut être consulté sur GitHub.

Sally Robertson

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Sally Robertson

Sally has a Bachelor's Degree in Biomedical Sciences (B.Sc.). She is a specialist in reviewing and summarising the latest findings across all areas of medicine covered in major, high-impact, world-leading international medical journals, international press conferences and bulletins from governmental agencies and regulatory bodies. At News-Medical, Sally generates daily news features, life science articles and interview coverage.

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