La nuova tecnologia può individuare tutto il virus che rappresenta una minaccia agli esseri umani

I ricercatori al vasto istituto del MIT e di Harvard hanno messo a punto un metodo di calcolo quel “esche„ molecolari di progettazioni per tutti gli sforzi del virus conosciuti per infettare gli esseri umani. Ciò include i virus quale Zika, che sono difficili da individuare dovuto la loro abbondanza bassa in campioni clinici.

Virus di Zikamolekuul_be | Shutterstock

Il nuovo approccio potrebbe aiutare più efficacemente ed economico i centri d'ordinamento genomica attraverso la malattia del video del mondo, che è essenziale per gli scoppi gestenti e di gestioni.

Durante lo scoppio di 2015 to-2016 Zika, i servizi sanitari di salute pubblica hanno lottato per contenere l'epidemia, mentre i ricercatori universalmente hanno provato a capire la genetica del virus.

Tuttavia, l'abbondanza bassa di particelle di Zika nei campioni di sangue delle persone commoventi lo ha reso estremamente difficile affinchè i ricercatori catturi il materiale genetico del virus.

Come riportato nella biotecnologia della natura del giornale, Hayden Metsky, Kate Siddle ed i colleghi ora hanno messo a punto un metodo di calcolo chiamato CATTURA, short per “l'aggregazione compatta degli obiettivi per l'ibridazione completa.„ La tecnologia permette ai ricercatori di progettare le sonde che cattureranno il materiale genetico di tutta la combinazione di microbi, compreso qualunque sforzo virale conosciuto per infettare gli esseri umani.

Dopo l'immissione dei genoma di tutto il virus umano che è stato caricato al centro nazionale per il database di sequenza del GenBank delle informazioni di biotecnologia, la CATTURA determinerà l'insieme ottimale delle sonde per il recupero del materiale genetico.

Quelle sequenze possono poi essere inviate alle società che sintetizzano le sonde della ricerca. Quelle sonde possono poi essere usate per isolare il DNA microbico desiderato in moda da poterlo ordinare, quindi arricchente i campioni clinici per il microbo di interesse.

Facendo uso di questa tecnica, Metsky e le sonde sviluppate gruppo che li hanno aiutati per scoprire che Zika si era sparso a parecchie regioni geografiche mesi prima degli scienziati avevano potuti individuarlo. Il potenziale della tecnologia di migliorare la sorveglianza genomica ha potuto informare i tentativi di gestire le epidemie in futuro.

Poichè genomica ordinare sta bene ad una parte critica di sorveglianza di malattia, strumenti come la CATTURA aiuterà noi ed altri per individuare più presto gli scoppi e per generare più dati sugli agenti patogeni che possono essere divisi con le più ampie comunità di ricerca medica e scientifiche.„

Cristiano Matranga, autore Co-senior

Il metodo potrebbe anche essere uno strumento potente per lo studio delle febbri undiagnosed che i ricercatori sospettano per essere causati da un virus.

Siamo eccitati circa il potenziale di usare l'ordinamento metagenomic da fare luce su quei casi e, in particolare, sulla possibilità di agire in tal modo localmente in paesi commoventi.„

Kate Siddle, autore Co-senior

Il software della CATTURA è stato fatto pubblicamente - disponibile e può essere raggiunto su GitHub.

Sally Robertson

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Sally Robertson

Sally has a Bachelor's Degree in Biomedical Sciences (B.Sc.). She is a specialist in reviewing and summarising the latest findings across all areas of medicine covered in major, high-impact, world-leading international medical journals, international press conferences and bulletins from governmental agencies and regulatory bodies. At News-Medical, Sally generates daily news features, life science articles and interview coverage.

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