A nova tecnologia pode detectar todo o vírus que levantar uma ameaça aos seres humanos

Os pesquisadores no instituto largo do MIT e do Harvard desenvolveram um método computacional que projectasse “iscas moleculars” para todas as tensões do vírus conhecidas para contaminar seres humanos. Isto inclui os vírus tais como Zika, que são difíceis detectar devido a sua baixa abundância em amostras clínicas.

Vírus de Zikamolekuul_be | Shutterstock

A aproximação nova poderia ajudar centros arranjando em seqüência genomic através da doença do monitor do mundo mais eficazmente e barata, que é essencial para manifestações de controlo e de controlo.

Durante a manifestação de 2015 to-2016 Zika, as autoridades responsáveis pela saúde pública esforçaram-se para conter a epidemia, quando os pesquisadores no mundo inteiro tentaram compreender a genética do vírus.

Contudo, a baixa abundância de partículas de Zika nas amostras de sangue de indivíduos afetados fez extremamente difícil para que os pesquisadores capturem o material genético do vírus.

Como relatado na biotecnologia da natureza do jornal, Hayden Metsky, Kate Siddle e os colegas têm desenvolvido agora um método computacional chamado CAPTURA, curto para “a agregação compacta dos alvos para a hibridação detalhada.” A tecnologia permite pesquisadores de projectar as pontas de prova que capturarão o material genético de toda a combinação de micróbios, incluindo qualquer tensão viral conhecida para contaminar seres humanos.

Após ter entrado os genomas de todo o vírus humano que for transferido ficheiros pela rede ao centro nacional para a base de dados da seqüência do GenBank de informação de biotecnologia, a CAPTURA determinará o grupo óptimo de pontas de prova para recuperar o material genético.

Aquelas seqüências podem então ser enviadas às empresas que sintetizam as pontas de prova da pesquisa. Aquelas pontas de prova podem então ser usadas para isolar o ADN microbiano desejado de modo que possa ser arranjado em seqüência, enriquecendo desse modo amostras clínicas para o micróbio do interesse.

Usando esta técnica, Metsky e as pontas de prova desenvolvidas equipe que o ajudaram a descobrir que Zika tinha espalhado a diversas regiões geográficas meses antes dos cientistas tinham podido detectá-lo. O potencial da tecnologia melhorar a fiscalização genomic podia informar tentativas de controlar no futuro epidemias.

Porque genomic arranjar em seqüência transforma-se uma parte crítica da fiscalização da doença, ferramentas como a CAPTURA ajudará nos e outro a detectar mais cedo manifestações e a gerar mais dados nos micróbios patogénicos que podem ser compartilhados com as comunidades mais largas científicas e de investigação médica.”

Cristão Matranga, autor Co-superior

O método poderia igualmente ser uma ferramenta poderosa para investigar as febres undiagnosed que os pesquisadores suspeitam para ser causados por um vírus.

Nós somos entusiasmado sobre o potencial usar arranjar em seqüência metagenomic para derramar a luz naqueles casos e, em particular, a possibilidade de fazer tão localmente em países afetados.”

Kate Siddle, autor Co-superior

O software da CAPTURA foi feito publicamente - disponível e pode ser alcançado em GitHub.

Sally Robertson

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Sally Robertson

Sally has a Bachelor's Degree in Biomedical Sciences (B.Sc.). She is a specialist in reviewing and summarising the latest findings across all areas of medicine covered in major, high-impact, world-leading international medical journals, international press conferences and bulletins from governmental agencies and regulatory bodies. At News-Medical, Sally generates daily news features, life science articles and interview coverage.

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